284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1455 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  100 
 
 		 816 aa  1668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1781  glycosyltransferase, RfaG  51.92 
 
 		 365 aa  379  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16220  hypothetical protein  50.54 
 
 		 368 aa  379  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2013  glycosyltransferase, RfaG  49.86 
 
 		 368 aa  369  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.986179 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5357  hypothetical protein  53.83 
 
 		 394 aa  347  4e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0704313 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4249  Protein of unknown function DUF1972  46.65 
 
 		 373 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444925  normal  0.0986637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5479  hypothetical protein  46.85 
 
 		 380 aa  323  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2169  glycosyltransferase-like protein  41.3 
 
 		 395 aa  246  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.231417  hitchhiker  0.00000680168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02940  glycosyltransferase  33.88 
 
 		 379 aa  196  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0995  Protein of unknown function DUF1972  36.31 
 
 		 380 aa  196  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00615148 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4445  Protein of unknown function DUF1972  34.52 
 
 		 421 aa  190  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.733886 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0887  Protein of unknown function DUF1972  33.78 
 
 		 399 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.736373 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 423 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0586  glycosyl transferase, group 1  32.88 
 
 		 360 aa  171  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.233194 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2826  glycosyl transferase, group 1  30 
 
 		 351 aa  162  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.670405  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1405  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 352 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0023982 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2889  a-glycosyltransferase  29.16 
 
 		 399 aa  160  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000672894  normal  0.063845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3145  Protein of unknown function DUF1972  30.16 
 
 		 402 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 429 aa  156  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0206  glycosyltransferase  27.49 
 
 		 402 aa  152  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0874911  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3051  glycosyl transferase, group 1  32.01 
 
 		 363 aa  150  9e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1437  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  27.84 
 
 		 382 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000575862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 425 aa  145  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1423  glycosyl transferase, putative  27.58 
 
 		 384 aa  144  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0457556  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1503  glycosyltransferase  27.51 
 
 		 396 aa  143  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 441 aa  140  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 417 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 435 aa  104  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  24.88 
 
 		 427 aa  100  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 441 aa  91.7  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2878  glycosyl transferase, group 1  25.57 
 
 		 367 aa  90.9  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  27.03 
 
 		 437 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4357  glycosyl transferase group 1  24.87 
 
 		 400 aa  88.2  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  44.63 
 
 		 219 aa  87.4  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  42.2 
 
 		 196 aa  85.5  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  40 
 
 		 208 aa  85.5  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  27.2 
 
 		 411 aa  84.7  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  32.96 
 
 		 178 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4985  glycosyl transferase group 1  27.73 
 
 		 394 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.655947  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 452 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  41.82 
 
 		 200 aa  82  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  25 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  38.21 
 
 		 184 aa  81.6  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  34.93 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  40 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  41.88 
 
 		 238 aa  80.5  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  42.59 
 
 		 187 aa  80.1  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  26.74 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  26.74 
 
 		 410 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  28.18 
 
 		 459 aa  80.1  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0392  glycosyl transferase group 1  25.15 
 
 		 375 aa  79.7  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  25.25 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 438 aa  78.2  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  25.25 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  23.9 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  40.91 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  40.91 
 
 		 195 aa  77.8  0.0000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  36.15 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  42.34 
 
 		 247 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  26.14 
 
 		 461 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  38.94 
 
 		 178 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  40.91 
 
 		 191 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  35.46 
 
 		 221 aa  75.5  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  40 
 
 		 191 aa  75.5  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  34.96 
 
 		 175 aa  75.1  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02467  glycosyltransferase  23.68 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.890042  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  40 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  25.48 
 
 		 529 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3552  glycosyl transferase group 1  26.4 
 
 		 370 aa  73.2  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000192778  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  42.61 
 
 		 235 aa  73.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 419 aa  73.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2587  glycosyl transferase, group 1  22.49 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  36.36 
 
 		 196 aa  72.4  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  42.61 
 
 		 235 aa  72.4  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  25 
 
 		 434 aa  72  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  25.54 
 
 		 455 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  39.09 
 
 		 189 aa  72  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  43.48 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0450  putative glycosyl transferase  23.42 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.741345  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0255  glycosyl transferase group 1  26.16 
 
 		 411 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880027  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  40.52 
 
 		 190 aa  70.5  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  34.26 
 
 		 185 aa  70.9  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  42.86 
 
 		 192 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  39.09 
 
 		 191 aa  69.7  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  26.04 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  42.73 
 
 		 192 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  42.73 
 
 		 192 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  25.3 
 
 		 455 aa  69.3  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  34.65 
 
 		 426 aa  68.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  34.86 
 
 		 153 aa  69.3  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 196 aa  68.9  0.0000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  42.48 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  33.8 
 
 		 192 aa  68.6  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0592  glycosyl transferase group 1  25.1 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  40 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.39 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  38.39 
 
 		 205 aa  67.4  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0053  glycosyl transferase group 1  22.19 
 
 		 368 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.933113  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 186 aa  66.2  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>