More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2488 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2488  polysaccharide export protein  100 
 
 		 196 aa  390  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.486389  normal  0.441144 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.41 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0211  polysaccharide export protein  36.48 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  34.22 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  33.95 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  30.82 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  32.09 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 192 aa  69.3  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  34.71 
 
 		 816 aa  69.3  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  31.38 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  32.18 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  30.72 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  32.08 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  39.19 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  35.29 
 
 		 406 aa  65.5  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3192  polysaccharide export protein  32 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  33.97 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  64.7  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  37.84 
 
 		 392 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  32.57 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  32.1 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  37.84 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  34.64 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  35.27 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40 
 
 		 396 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  36.89 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  34.83 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.55 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  40 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  40 
 
 		 391 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  33.77 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.04 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1069  polysaccharide export protein  32 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  36.6 
 
 		 803 aa  62  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  37.16 
 
 		 392 aa  62  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  35.39 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  30.53 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  36.49 
 
 		 392 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  30.53 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  29.68 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  33.08 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  31.17 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  36.49 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  36.49 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  34.59 
 
 		 356 aa  59.3  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  28.27 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  38.24 
 
 		 451 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  33.33 
 
 		 378 aa  59.3  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  36.43 
 
 		 441 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3185  polysaccharide export protein  38.24 
 
 		 451 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  36.97 
 
 		 246 aa  58.9  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  31.95 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  37.61 
 
 		 411 aa  58.9  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 386 aa  58.5  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  30.82 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4031  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123149  normal  0.629032 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  38 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  38 
 
 		 410 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  27.74 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  29.7 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2767  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.853985  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  30.33 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  29.3 
 
 		 869 aa  56.6  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 384 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.81 
 
 		 373 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  31.09 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  35.06 
 
 		 833 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000033468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  30.1 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  26.47 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  29.87 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  31.17 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  35.46 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02231  hypothetical protein  25.5 
 
 		 700 aa  55.5  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  37.41 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.14 
 
 		 703 aa  55.1  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  34.04 
 
 		 350 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 393 aa  55.1  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  26.82 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2963  polysaccharide export protein  26.64 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  30.52 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0160  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 391 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  31.44 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.95 
 
 		 348 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  34.04 
 
 		 389 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  29.46 
 
 		 425 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2010  polysaccharide export protein  30.27 
 
 		 422 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.054742 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>