217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0664 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  100 
 
 
386 aa  776    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  39.47 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  40.81 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  35.7 
 
 
388 aa  217  2e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  35.05 
 
 
406 aa  213  3.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.04 
 
 
387 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  34.04 
 
 
387 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.04 
 
 
373 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.04 
 
 
378 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.04 
 
 
387 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.04 
 
 
373 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.04 
 
 
387 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  35.12 
 
 
398 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  34.23 
 
 
379 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  34.96 
 
 
397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  33.85 
 
 
396 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  32.9 
 
 
422 aa  193  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  32.63 
 
 
409 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  32.63 
 
 
409 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  32.38 
 
 
440 aa  192  7e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  32.98 
 
 
419 aa  186  8e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  33.42 
 
 
394 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  33.78 
 
 
392 aa  179  7e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  29.37 
 
 
393 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  32.98 
 
 
389 aa  177  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  33.51 
 
 
389 aa  176  7e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  31.78 
 
 
390 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  31.72 
 
 
410 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  31.61 
 
 
388 aa  173  5e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  30.87 
 
 
403 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  31.45 
 
 
363 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  30.67 
 
 
404 aa  170  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  31.23 
 
 
410 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  30.34 
 
 
422 aa  170  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
388 aa  169  7e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  32.28 
 
 
400 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  30.79 
 
 
410 aa  168  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  32.8 
 
 
406 aa  166  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  32.28 
 
 
440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  32.71 
 
 
390 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  32.62 
 
 
417 aa  160  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  32.16 
 
 
402 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  32.48 
 
 
388 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  33.7 
 
 
408 aa  159  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  31.7 
 
 
385 aa  153  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  28.38 
 
 
390 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  28.38 
 
 
397 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  29.79 
 
 
391 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  32.01 
 
 
375 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  30.45 
 
 
380 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  30 
 
 
395 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  31.46 
 
 
377 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  28.33 
 
 
378 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  28.33 
 
 
378 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  29.63 
 
 
384 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  27.78 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  28.27 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  28.61 
 
 
372 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  26.74 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.72 
 
 
398 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  32.2 
 
 
391 aa  107  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  27.22 
 
 
392 aa  106  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  25.63 
 
 
379 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  30.27 
 
 
391 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  25.92 
 
 
356 aa  104  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.75 
 
 
392 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  26.22 
 
 
387 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.75 
 
 
392 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.16 
 
 
393 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  26.6 
 
 
397 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  30.27 
 
 
391 aa  101  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  29.89 
 
 
385 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  25.82 
 
 
385 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  25.76 
 
 
379 aa  101  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.53 
 
 
400 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.53 
 
 
446 aa  99.8  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.21 
 
 
396 aa  99  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.23 
 
 
387 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.23 
 
 
387 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.23 
 
 
392 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 
422 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.4 
 
 
392 aa  97.1  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.62 
 
 
396 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.62 
 
 
391 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.62 
 
 
391 aa  96.3  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.3 
 
 
396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.01 
 
 
378 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.54 
 
 
379 aa  93.6  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  25.54 
 
 
377 aa  93.6  6e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27.06 
 
 
381 aa  92.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  24.84 
 
 
390 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  25.85 
 
 
378 aa  90.9  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  27.17 
 
 
428 aa  90.9  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>