228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3057 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  100 
 
 		 440 aa  890    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  52.91 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  53.51 
 
 		 410 aa  409  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  47.97 
 
 		 396 aa  343  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  46.54 
 
 		 402 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  45.32 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  40.78 
 
 		 403 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  40.8 
 
 		 422 aa  291  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  39.84 
 
 		 389 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  40.73 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  39.64 
 
 		 410 aa  239  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  36.31 
 
 		 419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  35.04 
 
 		 390 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  38.56 
 
 		 389 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  37.4 
 
 		 393 aa  230  4e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  37.25 
 
 		 410 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  35.91 
 
 		 394 aa  226  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  34.1 
 
 		 388 aa  225  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  35.11 
 
 		 388 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  36.24 
 
 		 417 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  35.31 
 
 		 398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  35.11 
 
 		 388 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.45 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  32.45 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.45 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.71 
 
 		 378 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.45 
 
 		 387 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  33.86 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.79 
 
 		 373 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.79 
 
 		 373 aa  209  7e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  33.6 
 
 		 379 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  32.61 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  35.73 
 
 		 391 aa  203  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  33.42 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  33.42 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  32.38 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  30.81 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  34.95 
 
 		 363 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  31.06 
 
 		 395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  33.94 
 
 		 387 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  31.28 
 
 		 406 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 380 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  32.78 
 
 		 394 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  32.43 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  30.05 
 
 		 390 aa  170  4e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  32.59 
 
 		 392 aa  170  4e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  30.05 
 
 		 397 aa  170  5e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 365 aa  156  6e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  32.23 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  30.89 
 
 		 375 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 406 aa  147  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  32.23 
 
 		 378 aa  147  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 385 aa  134  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 376 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  30.56 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  26.29 
 
 		 378 aa  120  7e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 378 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.14 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 379 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  26.18 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.18 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.18 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  26.18 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.18 
 
 		 379 aa  111  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.18 
 
 		 386 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.7 
 
 		 378 aa  109  9.000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 354 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  25.7 
 
 		 377 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 378 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  25.67 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  25.96 
 
 		 350 aa  98.6  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  23.34 
 
 		 379 aa  98.2  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  25.73 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  23.43 
 
 		 396 aa  94.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  25.41 
 
 		 384 aa  93.6  6e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 398 aa  93.2  9e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  22.97 
 
 		 417 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  23.92 
 
 		 426 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  24.13 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.74 
 
 		 446 aa  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  24.42 
 
 		 426 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.74 
 
 		 422 aa  89.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  23.74 
 
 		 400 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  23.81 
 
 		 391 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 348 aa  87.4  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.07 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  24.05 
 
 		 362 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.07 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  22.7 
 
 		 385 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  23.76 
 
 		 381 aa  85.5  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  25.51 
 
 		 317 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  23.95 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  23.95 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  23.95 
 
 		 429 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.95 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  23.95 
 
 		 429 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>