203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_6038 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  100 
 
 		 380 aa  759    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  36.22 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  33.33 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  32.26 
 
 		 440 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  33.06 
 
 		 379 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  29.79 
 
 		 402 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 409 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  33.1 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  32.46 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.74 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  35.74 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.74 
 
 		 378 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.74 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.74 
 
 		 387 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.74 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  35.74 
 
 		 373 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  32.83 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  34.9 
 
 		 389 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 403 aa  159  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  31.45 
 
 		 387 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 410 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  31.81 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  33.07 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  28.34 
 
 		 406 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  32.24 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  32.65 
 
 		 392 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 388 aa  150  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  33.45 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 388 aa  149  8e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  32.33 
 
 		 417 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  32.33 
 
 		 390 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 410 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 363 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 396 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  31.25 
 
 		 410 aa  147  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  29.56 
 
 		 419 aa  144  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  29.7 
 
 		 388 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  34.13 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  30.79 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  30.49 
 
 		 404 aa  140  3e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  30.45 
 
 		 386 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  28.9 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  29.04 
 
 		 394 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  26.7 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 392 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  24.79 
 
 		 375 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 354 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  25 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  25.15 
 
 		 384 aa  107  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  28.43 
 
 		 397 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  28.43 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 385 aa  107  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  24.73 
 
 		 378 aa  106  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  23.86 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 387 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  30.42 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  28.45 
 
 		 356 aa  99.8  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.37 
 
 		 396 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  25.87 
 
 		 376 aa  97.4  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 398 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.33 
 
 		 407 aa  96.3  9e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  29.25 
 
 		 392 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.59 
 
 		 396 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 		 391 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.52 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  26.33 
 
 		 378 aa  93.6  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 407 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  24.57 
 
 		 352 aa  92.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  26.58 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  28.85 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.52 
 
 		 446 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  23.86 
 
 		 379 aa  90.5  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  24.57 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.52 
 
 		 422 aa  90.5  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.52 
 
 		 400 aa  90.5  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 360 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  24.38 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.29 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.29 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  26.67 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.29 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  29.29 
 
 		 429 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.75 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0597184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.75 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  24.27 
 
 		 391 aa  88.6  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  24.67 
 
 		 384 aa  88.6  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  24.91 
 
 		 385 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.75 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.75 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>