283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0728 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  100 
 
 		 406 aa  810    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  42.86 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  38.67 
 
 		 387 aa  229  8e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  35.05 
 
 		 386 aa  215  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.85 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.85 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.85 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  30.85 
 
 		 387 aa  179  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.91 
 
 		 378 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.1 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.1 
 
 		 373 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  32.78 
 
 		 422 aa  172  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  32.45 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 419 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  29.55 
 
 		 379 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  31.5 
 
 		 393 aa  166  8e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  30.55 
 
 		 388 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  31.94 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  29.66 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  29.66 
 
 		 409 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  32.63 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  31.22 
 
 		 388 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  32.34 
 
 		 398 aa  160  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 392 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  30 
 
 		 408 aa  159  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  31.22 
 
 		 440 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  31.78 
 
 		 394 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  29.97 
 
 		 363 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  32.37 
 
 		 389 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  31.53 
 
 		 397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  30.03 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  29.81 
 
 		 417 aa  150  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 397 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  29.19 
 
 		 390 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  29.54 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  29.89 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  29.05 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  30.5 
 
 		 410 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  30.73 
 
 		 410 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  28.19 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  29.5 
 
 		 410 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  26.85 
 
 		 422 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 403 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 395 aa  133  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  26.39 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  27.84 
 
 		 404 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  27.32 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  29.73 
 
 		 378 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  28.15 
 
 		 376 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  29.73 
 
 		 378 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  28.95 
 
 		 392 aa  116  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  29.29 
 
 		 377 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  31.2 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  27.79 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  28.35 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  28.39 
 
 		 393 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 375 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  27.98 
 
 		 391 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  30.57 
 
 		 384 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  26.09 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  28.62 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.88 
 
 		 407 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  27.74 
 
 		 379 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 387 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  25.64 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25.96 
 
 		 397 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  28.24 
 
 		 362 aa  97.1  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  30.23 
 
 		 384 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  25 
 
 		 392 aa  97.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 387 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  25 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  26.28 
 
 		 407 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  27.6 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  26.21 
 
 		 379 aa  94.7  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.96 
 
 		 396 aa  94  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  26.33 
 
 		 373 aa  93.6  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  27.59 
 
 		 379 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  32.08 
 
 		 392 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25.96 
 
 		 396 aa  92.8  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.96 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  25.96 
 
 		 391 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  29.53 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  26.23 
 
 		 398 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.31 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  27.65 
 
 		 371 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  29.91 
 
 		 352 aa  90.9  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.65 
 
 		 317 aa  89.7  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  26.84 
 
 		 369 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  25.07 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  25.07 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  26.89 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.07 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  25.07 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  25.07 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.89 
 
 		 379 aa  89  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  26.89 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>