228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2133 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  100 
 
 		 375 aa  749    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0759  putative capsule polysaccharide exporter  62.5 
 
 		 378 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2418  polysaccharide export protein  62.22 
 
 		 378 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.160125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0416  polysaccharide export protein  61.54 
 
 		 377 aa  457  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.482624  normal  0.901304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3419  polysaccharide export protein  59.73 
 
 		 384 aa  444  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0961152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2254  putative polysaccharide export protein  59.68 
 
 		 385 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.732758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1559  polysaccharide export protein  59.22 
 
 		 392 aa  437  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.053083  normal  0.0507525 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2754  polysaccharide export protein  36.81 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3859  polysaccharide export protein  33.7 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0198  polysaccharide export protein  30.99 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5948  exopolysaccharide export protein  30.18 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3820  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.388057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7135  polysaccharide export protein  30.79 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3057  polysaccharide export protein  31.15 
 
 		 440 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521526  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  30.21 
 
 		 422 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3767  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.607345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1938  polysaccharide export protein  28.96 
 
 		 410 aa  144  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.231854  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3037  polysaccharide export protein  29.13 
 
 		 365 aa  144  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3770  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3660  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 388 aa  143  5e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.208413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  31.98 
 
 		 379 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0664  polysaccharide export protein  29.2 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0130788  normal  0.0340972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2463  polysaccharide export protein  28.27 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.118558 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6357  polysaccharide export protein  29.74 
 
 		 389 aa  140  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.168651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0324  polysaccharide export protein  29.28 
 
 		 410 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1533  polysaccharide export protein  30.32 
 
 		 397 aa  138  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0950  polysaccharide export protein  29.04 
 
 		 394 aa  137  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2714  polysaccharide export protein  29.33 
 
 		 393 aa  137  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3462  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 388 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.775015  normal  0.722378 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.46 
 
 		 387 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  28.46 
 
 		 387 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0287  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0771  polysaccharide export protein  31.55 
 
 		 409 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.61 
 
 		 378 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.46 
 
 		 387 aa  136  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.46 
 
 		 387 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3494  polysaccharide export protein  30.34 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2347  polysaccharide export protein  32.31 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.76 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.76 
 
 		 373 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1161  polysaccharide export protein  31.38 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0571636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3782  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 402 aa  133  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1028  putative capsule polysaccharide export outer membrane protein  32.07 
 
 		 440 aa  132  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6038  polysaccharide export protein  25 
 
 		 380 aa  132  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2758  polysaccharide export protein  30.07 
 
 		 390 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.261698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2535  polysaccharide export protein  29.41 
 
 		 417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1033  polysaccharide export protein  27.13 
 
 		 400 aa  126  5e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1486  polysaccharide export protein  28.8 
 
 		 408 aa  126  6e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.721781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0753  polysaccharide export protein  31.31 
 
 		 392 aa  126  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3781  polysaccharide export protein  28.46 
 
 		 396 aa  123  6e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543784  normal  0.42896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2975  capsule polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family  28.76 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2589  polysaccharide export protein  28.76 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3232  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 422 aa  120  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3905  polysaccharide export protein  30.25 
 
 		 354 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.132595 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2079  polysaccharide export protein  31.7 
 
 		 394 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.238275 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2984  polysaccharide export protein  27.89 
 
 		 403 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  31.47 
 
 		 373 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0093  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 410 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249835 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.63 
 
 		 356 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0728  polysaccharide export protein  27.66 
 
 		 406 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0592295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  29.12 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  29.37 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.23 
 
 		 375 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  27.3 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  27.33 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  28.67 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  27.06 
 
 		 397 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  27.67 
 
 		 407 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  27.56 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  30.98 
 
 		 360 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 392 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  26.91 
 
 		 387 aa  100  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  27.04 
 
 		 407 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  27.87 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.87 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  27.87 
 
 		 379 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  27.87 
 
 		 379 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.87 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 392 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.87 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  27.87 
 
 		 386 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 392 aa  98.2  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  30.04 
 
 		 379 aa  97.4  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.21 
 
 		 378 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  28.03 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.01 
 
 		 396 aa  95.9  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3232  polysaccharide export protein  27.18 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.549213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  27.01 
 
 		 396 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  27.4 
 
 		 391 aa  95.1  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.01 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  27.01 
 
 		 391 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  27.43 
 
 		 379 aa  94.4  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  27.48 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.71 
 
 		 377 aa  93.2  7e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.08 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.08 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>