More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1690 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  100 
 
 
428 aa  864    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  55.32 
 
 
426 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  55.37 
 
 
426 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  55.56 
 
 
369 aa  413  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  53.33 
 
 
390 aa  390  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  55.31 
 
 
407 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  54.77 
 
 
408 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  47.44 
 
 
423 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  47.44 
 
 
423 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  50.79 
 
 
383 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  45.05 
 
 
391 aa  343  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  42.72 
 
 
417 aa  329  5.0000000000000004e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  46.7 
 
 
391 aa  323  3e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  46.77 
 
 
362 aa  305  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  45.92 
 
 
392 aa  304  2.0000000000000002e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  40.64 
 
 
387 aa  303  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  47.17 
 
 
381 aa  298  9e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  40.92 
 
 
372 aa  285  9e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  41.07 
 
 
384 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  41.94 
 
 
417 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  40.37 
 
 
384 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  42.12 
 
 
396 aa  271  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  40.96 
 
 
390 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  39.68 
 
 
379 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  39.25 
 
 
385 aa  265  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  39.35 
 
 
390 aa  264  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  45.24 
 
 
348 aa  260  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  40.06 
 
 
350 aa  259  7e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  38.96 
 
 
391 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  38.07 
 
 
379 aa  257  3e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  47.18 
 
 
400 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  47.18 
 
 
446 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  41.14 
 
 
348 aa  255  8e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  38.14 
 
 
391 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  46.83 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  38.96 
 
 
385 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  40.56 
 
 
352 aa  247  3e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  36.73 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  41.49 
 
 
379 aa  244  3e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  37.9 
 
 
389 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  42.72 
 
 
348 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  36.1 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  37.97 
 
 
393 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  33.93 
 
 
376 aa  203  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  33.14 
 
 
373 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30130  Polysaccharide export protein  35.79 
 
 
379 aa  200  5e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  34.47 
 
 
377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  33.51 
 
 
374 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  37.11 
 
 
407 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  36.79 
 
 
407 aa  194  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  35.8 
 
 
392 aa  194  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  35.8 
 
 
392 aa  193  5e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4275  polysaccharide export protein  38.14 
 
 
368 aa  193  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  35.69 
 
 
317 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4409  polysaccharide export protein  37.8 
 
 
368 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4430  polysaccharide export protein  38.14 
 
 
368 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.756533  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  36.09 
 
 
397 aa  192  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.13 
 
 
375 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  35.96 
 
 
392 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  38 
 
 
393 aa  191  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  36.57 
 
 
392 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  36.57 
 
 
387 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  36.57 
 
 
387 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.33 
 
 
396 aa  187  3e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  31.57 
 
 
386 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  32.2 
 
 
378 aa  187  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  31.36 
 
 
378 aa  186  8e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.59 
 
 
379 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  33.85 
 
 
396 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.85 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  33.85 
 
 
391 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.71 
 
 
378 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.79 
 
 
348 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.79 
 
 
351 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  35.79 
 
 
348 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.17 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.17 
 
 
379 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  35.79 
 
 
379 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  38.03 
 
 
379 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  38.38 
 
 
386 aa  179  8e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  38.03 
 
 
379 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  38.03 
 
 
379 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  38.03 
 
 
386 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  38.03 
 
 
379 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  38.03 
 
 
379 aa  179  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  38.03 
 
 
386 aa  178  2e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  31.43 
 
 
378 aa  176  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  33.68 
 
 
356 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
371 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  36.08 
 
 
360 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3450  capsular polysaccharide biosynthesis protein  32.7 
 
 
364 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.9 
 
 
429 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  34.62 
 
 
378 aa  169  1e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>