More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0835 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  100 
 
 		 272 aa  545  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  35.45 
 
 		 270 aa  136  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  35.96 
 
 		 264 aa  132  6.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  33.2 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  34.82 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  32.5 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  35.71 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  35.71 
 
 		 276 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  29.46 
 
 		 277 aa  99.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  32.71 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  26.32 
 
 		 344 aa  88.6  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  29.6 
 
 		 324 aa  85.5  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  25.91 
 
 		 356 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  33.49 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  37.82 
 
 		 237 aa  79  0.00000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1525  polysaccharide export protein  35.8 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  37.04 
 
 		 192 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  30.9 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.38 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  33.68 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  27.15 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  39.05 
 
 		 417 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  30.61 
 
 		 212 aa  72.8  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  46.15 
 
 		 385 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1596  polysaccharide export protein  31.72 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 376 aa  72.4  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  46.15 
 
 		 391 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  39.22 
 
 		 398 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  31.54 
 
 		 185 aa  71.6  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 185 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 347 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  28.71 
 
 		 288 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  32.92 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  40 
 
 		 396 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  36.17 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  45.05 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.26 
 
 		 422 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  38.19 
 
 		 400 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  33.85 
 
 		 381 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  39.26 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  30.88 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  33.65 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.26 
 
 		 152 aa  67.4  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  28.4 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0660  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 823 aa  67.8  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.58 
 
 		 388 aa  67  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  43.56 
 
 		 391 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  32.43 
 
 		 429 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  35.21 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  33.53 
 
 		 372 aa  65.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 392 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  31.56 
 
 		 379 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  28.99 
 
 		 393 aa  65.5  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1078  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.93 
 
 		 378 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.273848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2307  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.93 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3301  WcbC  30.93 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0776528  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  31.51 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3289  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.93 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 869 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  37.98 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  32.71 
 
 		 185 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3254  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.93 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2185  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.93 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2133  polysaccharide export protein  36.81 
 
 		 375 aa  64.7  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0521  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  30.93 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21613  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  38.3 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2893  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  31.1 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  25.35 
 
 		 830 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2515  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  30.45 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.53 
 
 		 429 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  31.21 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  37.71 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  36.3 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  26.77 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  31.05 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  29.45 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  32.49 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0132  putative polysaccharide export protein, outer membrane  28.34 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.679141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  37.98 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 392 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1691  polysaccharide export protein  29.27 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000171908  normal  0.0125517 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2881  polysaccharide export protein  27.27 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  28.86 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 426 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  31.96 
 
 		 387 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  34.57 
 
 		 407 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.43 
 
 		 386 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 387 aa  62.4  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  34.46 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2609  polysaccharide export protein  34.38 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  29.86 
 
 		 426 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>