More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2882 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  100 
 
 		 247 aa  501  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  30.56 
 
 		 264 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 275 aa  96.7  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  27.73 
 
 		 281 aa  94  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  31.06 
 
 		 276 aa  93.2  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  25.28 
 
 		 283 aa  84.7  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  28.21 
 
 		 263 aa  82  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  30.63 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  31.08 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1463  putative polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 352 aa  77  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.24713e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  25.25 
 
 		 350 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  28.21 
 
 		 948 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  29.68 
 
 		 191 aa  75.1  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  27.14 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  26.11 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  30.19 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  26.36 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  23.89 
 
 		 250 aa  73.2  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  25.25 
 
 		 390 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  26.54 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  31.21 
 
 		 495 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  28.81 
 
 		 307 aa  72  0.000000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.59 
 
 		 396 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  25 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  30 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  25.52 
 
 		 389 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  28.98 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2590  polysaccharide export protein  24.72 
 
 		 185 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2730  polysaccharide export protein  24.72 
 
 		 185 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2920  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 185 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  25.43 
 
 		 384 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28.06 
 
 		 781 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  25.26 
 
 		 495 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  28.21 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  27.44 
 
 		 348 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  24.55 
 
 		 381 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  24.74 
 
 		 495 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  29.21 
 
 		 369 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  28.33 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  26.97 
 
 		 431 aa  66.2  0.0000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.57 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  24.46 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  26.99 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3126  polysaccharide export protein  24.16 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13851  hypothetical protein  27.78 
 
 		 365 aa  65.5  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.92 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  30.12 
 
 		 379 aa  64.7  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  24.28 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  28.31 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2909  polysaccharide export protein  26.62 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723004  hitchhiker  0.000339784 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0827  polysaccharide export protein  27.54 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.895511  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  20.45 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.31 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  20.34 
 
 		 422 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  28.31 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  27.03 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.31 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  23.33 
 
 		 385 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  21.21 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  28.31 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  26.78 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  23.56 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4409  polysaccharide export protein  23.16 
 
 		 398 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  26.4 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  28.31 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  26.51 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  28.92 
 
 		 379 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  27.37 
 
 		 260 aa  63.2  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  20.45 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3833  polysaccharide export protein  24.89 
 
 		 371 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.679596  normal  0.69653 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  29.44 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0740  polysaccharide export protein  24.52 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  29.14 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  22.86 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0536  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  22.83 
 
 		 429 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 379 aa  62.4  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 391 aa  62.4  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  24.86 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  25 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  25.45 
 
 		 407 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  24.55 
 
 		 407 aa  62  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 348 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  27.75 
 
 		 373 aa  62  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  29.07 
 
 		 237 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  28.31 
 
 		 348 aa  62  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  27.17 
 
 		 417 aa  62  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  27.11 
 
 		 378 aa  62  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  25.29 
 
 		 379 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  27.51 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  26.86 
 
 		 378 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3844  polysaccharide export periplasmic protein  22.75 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0047  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.92 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  28.05 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1327  WcbC  24.52 
 
 		 422 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2192  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  21.92 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>