97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0096 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0096  HAD superfamily hydrolase  100 
 
 
207 aa  428  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000147851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0647  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  46.73 
 
 
204 aa  174  7e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000028477  normal  0.274345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1005  HAD family hydrolase  36.87 
 
 
209 aa  135  4e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.10158  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5618  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.18 
 
 
211 aa  124  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2711  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.12 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.04 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0909  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.75 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.538395  normal  0.573349 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0002  HAD family hydrolase  31 
 
 
200 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.142779  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12718  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  29.32 
 
 
203 aa  101  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0725  HAD superfamily hydrolase  31.55 
 
 
208 aa  98.6  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4490  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.43 
 
 
209 aa  90.9  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2805  HAD family hydrolase  28.04 
 
 
208 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.187459 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2835  HAD family hydrolase  29.1 
 
 
231 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.160416  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3957  phosphatase  26.8 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4187  phosphatase  26.04 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0033  phosphatase  26.04 
 
 
196 aa  79  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0029  phosphatase  26.04 
 
 
196 aa  78.2  0.00000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4304  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.766315  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4237  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4259  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4415  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4350  phosphatase  26.2 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  26.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  26.74 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4093  phosphatase  25 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  26.2 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  26.2 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  26.2 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3244  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4501  phosphatase  26.23 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4879  phosphatase  26.56 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000893081 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4218  phosphatase  25.68 
 
 
203 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0571  HAD family hydrolase  27.94 
 
 
203 aa  68.6  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2458  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.337506  normal  0.279583 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2208  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.98 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3008  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.103903  normal  0.720985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3671  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000314321  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2037  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  25 
 
 
203 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  25.85 
 
 
203 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  26.44 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  26.77 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1967  putative HAD superfamily hydrolase  33.94 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0600927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  24.76 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4154  phosphatase  23.81 
 
 
203 aa  52  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0468  HAD family hydrolase  25.13 
 
 
202 aa  51.6  0.000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.85334  hitchhiker  0.00430907 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4958  hydrolase  28.06 
 
 
201 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158078  normal  0.959815 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1892  HAD family hydrolase  23.32 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.606117  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0945  HAD superfamily hydrolase  26.15 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000164408  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  33.01 
 
 
233 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0043  HAD family hydrolase  24.54 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2165  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.94 
 
 
196 aa  47.4  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
234 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38090  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  31.82 
 
 
194 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.516929  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3215  HAD superfamily hydrolase  23.59 
 
 
216 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  22.83 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.542403  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2236  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.55 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
210 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1128  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
214 aa  45.4  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.893823  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0053  HAD family hydrolase  23.3 
 
 
207 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  47.46 
 
 
220 aa  45.4  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1926  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.88 
 
 
201 aa  45.1  0.0008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  31.87 
 
 
232 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  33.33 
 
 
214 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  30 
 
 
230 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32070  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  24.29 
 
 
227 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466176  normal  0.444114 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1090  hydrolase  38.6 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2325  HAD family hydrolase  27.84 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
231 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1667  HAD family hydrolase  23.04 
 
 
199 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0663843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  30.77 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  24.75 
 
 
216 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000290  HAD superfamily hydrolase  38.71 
 
 
205 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.5 
 
 
298 aa  43.1  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  30.77 
 
 
232 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.17 
 
 
219 aa  43.1  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  25.2 
 
 
224 aa  43.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3093  hypothetical protein  22.93 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  24.48 
 
 
223 aa  43.1  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7538  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  29.17 
 
 
232 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.763652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2669  HAD family hydrolase  21.9 
 
 
206 aa  42.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  32.63 
 
 
233 aa  42.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7952  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3453  HAD family hydrolase  22.96 
 
 
204 aa  42  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1742  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.62 
 
 
204 aa  42  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0641396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0275  haloacid dehalogenase, type II  32.81 
 
 
227 aa  41.6  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1265  HAD family hydrolase  32.31 
 
 
204 aa  41.6  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489087  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4259  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.78 
 
 
203 aa  41.6  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30870  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  30.14 
 
 
133 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  30.93 
 
 
225 aa  41.6  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0504  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.67 
 
 
233 aa  41.6  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  30.49 
 
 
225 aa  41.2  0.01  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>