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for query gene Ksed_09340 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09340  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  100 
 
 		 494 aa  955    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  57.14 
 
 		 512 aa  526  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  59.5 
 
 		 493 aa  527  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  60.57 
 
 		 509 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.71 
 
 		 646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.71 
 
 		 646 aa  469  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.04 
 
 		 646 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  52.07 
 
 		 609 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.91 
 
 		 511 aa  464  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  53.43 
 
 		 627 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.2 
 
 		 505 aa  455  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  49.9 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  53.86 
 
 		 521 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.23 
 
 		 534 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  52.64 
 
 		 540 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  45.53 
 
 		 504 aa  376  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  50.47 
 
 		 546 aa  365  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.48 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2622  major facilitator superfamily MFS_1  42.58 
 
 		 790 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.11 
 
 		 528 aa  236  8e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.84 
 
 		 522 aa  229  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 487 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
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NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.75 
 
 		 522 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal  1 
 
 
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NC_008391  Bamb_3488  major facilitator transporter  38.02 
 
 		 469 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36718  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.47 
 
 		 498 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
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NC_013216  Dtox_2326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.86 
 
 		 579 aa  210  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000685947  hitchhiker  0.0026086 
 
 
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NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.01 
 
 		 504 aa  209  7e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.07 
 
 		 489 aa  209  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2324  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.39 
 
 		 534 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.937948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.32 
 
 		 523 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.31 
 
 		 488 aa  207  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  33.84 
 
 		 467 aa  206  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4406  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.85 
 
 		 514 aa  205  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.853367 
 
 
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NC_013739  Cwoe_2956  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.98 
 
 		 521 aa  205  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.210467 
 
 
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NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  35.33 
 
 		 530 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0033  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.78 
 
 		 541 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7143  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.65 
 
 		 489 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.235133 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.43 
 
 		 532 aa  200  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0761  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.75 
 
 		 534 aa  200  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.698382  normal  0.0379028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1573  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.71 
 
 		 529 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6823  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.31 
 
 		 558 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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CP001800  Ssol_2131  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.08 
 
 		 471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011886  Achl_2110  major facilitator superfamily MFS_1  35.78 
 
 		 457 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273414 
 
 
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NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.47 
 
 		 478 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
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NC_013757  Gobs_2256  major facilitator superfamily MFS_1  38.23 
 
 		 504 aa  197  3e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.68 
 
 		 490 aa  197  3e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
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NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.85 
 
 		 496 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
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NC_013131  Caci_2698  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  34.64 
 
 		 468 aa  197  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.73028  normal  1 
 
 
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NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.51 
 
 		 527 aa  197  5.000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.05 
 
 		 515 aa  196  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.94 
 
 		 478 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.49 
 
 		 529 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.269985  normal  1 
 
 
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NC_011146  Gbem_2631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.56 
 
 		 515 aa  196  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.383083  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_2378  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 529 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_5301  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.273025  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2290  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.39 
 
 		 529 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.192526  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5559  major facilitator transporter  34.3 
 
 		 468 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1476  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.41 
 
 		 472 aa  196  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76254  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3094  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.13 
 
 		 532 aa  196  8.000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.18 
 
 		 520 aa  196  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.91 
 
 		 520 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.66 
 
 		 525 aa  194  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0974  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.85 
 
 		 534 aa  195  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760021 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2724  EmrB/QacA family drug resistance transporter  35.48 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.701538  normal  0.0103293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1604  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 		 515 aa  194  3e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.46 
 
 		 524 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5597  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.73 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2706  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.2 
 
 		 537 aa  194  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0659  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.45 
 
 		 517 aa  194  4e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.372094  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4455  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 478 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 484 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2166  major facilitator superfamily MFS_1  35.05 
 
 		 485 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0144549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.55 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1086  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.3 
 
 		 531 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.970713  normal  0.875398 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3331  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.28 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.95 
 
 		 545 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.91 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2635  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.18 
 
 		 520 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.723891  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0136  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.55 
 
 		 504 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.903569  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3490  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.86 
 
 		 521 aa  190  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0312462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1631  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.64 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6584  EmrB/QacA family drug resistance transporter  34.28 
 
 		 502 aa  190  5e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  35.73 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2059  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.66 
 
 		 480 aa  190  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.84 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1437  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.73 
 
 		 520 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0759  major facilitator superfamily permease  31.88 
 
 		 554 aa  190  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000977825  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.98 
 
 		 532 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3660  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.26 
 
 		 558 aa  189  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3202  multidrug resistance protein B  29.93 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1947  multidrug ABC transporter, permease  28.47 
 
 		 582 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.128457  n/a   
 
 
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NC_010159  YpAngola_A3461  multidrug resistance protein B  29.93 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.611803  normal  1 
 
 
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NC_010465  YPK_3339  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.93 
 
 		 511 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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