More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3814 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  38.25 
 
 		 1111 aa  677    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3814  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 		 1131 aa  2293    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.257486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4308  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  33.64 
 
 		 552 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3924  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.33 
 
 		 443 aa  249  2e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.350169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3221  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.04 
 
 		 443 aa  244  6e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0497788 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2061  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.96 
 
 		 318 aa  239  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365539  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1805  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.28 
 
 		 310 aa  236  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 		 933 aa  232  3e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1275  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.59 
 
 		 304 aa  229  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00827298  normal  0.435617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0424  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.69 
 
 		 441 aa  229  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.130175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 1064 aa  224  4.9999999999999996e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  39.02 
 
 		 326 aa  220  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.02 
 
 		 326 aa  218  5.9999999999999996e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 		 687 aa  218  7e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 965 aa  211  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  25.89 
 
 		 1046 aa  207  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 1267 aa  207  9e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3468  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.07 
 
 		 412 aa  207  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.64 
 
 		 823 aa  207  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0087  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.63 
 
 		 308 aa  205  3e-51  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.010948 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 		 1352 aa  203  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 		 1195 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.95 
 
 		 1788 aa  201  5e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 		 1271 aa  201  9e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0978  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.11 
 
 		 322 aa  197  8.000000000000001e-49  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.97362  decreased coverage  0.00116316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 		 936 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 		 1765 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  27.01 
 
 		 1765 aa  194  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 858 aa  194  8e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 		 1917 aa  194  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 1768 aa  193  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  25.74 
 
 		 1683 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1002 aa  193  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0599  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.1 
 
 		 313 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.464892  normal  0.548622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 		 799 aa  192  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 964 aa  191  5e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 974 aa  191  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 755 aa  189  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 798 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0212  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 953 aa  188  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.44 
 
 		 1629 aa  188  6e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  31.72 
 
 		 977 aa  187  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 		 977 aa  186  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1033 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 975 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 816 aa  186  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 		 1767 aa  185  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 		 1207 aa  186  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 1767 aa  185  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.41 
 
 		 1767 aa  185  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 		 1022 aa  184  8.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.09 
 
 		 1398 aa  184  9.000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  30.3 
 
 		 1214 aa  184  1e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 2099 aa  184  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 1695 aa  184  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  30.28 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.28 
 
 		 803 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.74 
 
 		 340 aa  182  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.483  normal  0.196753 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.72 
 
 		 923 aa  182  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  27.69 
 
 		 1322 aa  182  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.26 
 
 		 1003 aa  182  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.284418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.02 
 
 		 612 aa  182  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 		 991 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 1014 aa  181  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 1362 aa  181  4.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 		 1137 aa  182  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1165 aa  181  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 1009 aa  181  7e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  28.09 
 
 		 1135 aa  181  7e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 754 aa  181  8e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 1363 aa  181  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1584  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.42 
 
 		 319 aa  181  9e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.335279  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 1021 aa  181  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 720 aa  180  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 829 aa  180  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 		 1692 aa  180  1e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 		 2099 aa  180  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 		 1782 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 758 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 		 981 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 		 1611 aa  179  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 		 1782 aa  179  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.45 
 
 		 1303 aa  179  2e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.47 
 
 		 929 aa  179  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 977 aa  179  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 		 1771 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  27.38 
 
 		 1137 aa  179  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 1784 aa  179  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 885 aa  179  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 796 aa  179  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  27.57 
 
 		 998 aa  179  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.18 
 
 		 1109 aa  178  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 		 970 aa  178  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 745 aa  179  4e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 1141 aa  178  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.31 
 
 		 925 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 		 1582 aa  177  8e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.31 
 
 		 950 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  26.53 
 
 		 910 aa  177  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  29.88 
 
 		 847 aa  177  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>