More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2353 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  100 
 
 
446 aa  901    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1781  carboxyl-terminal protease  57.14 
 
 
439 aa  465  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0030  peptidase S41A  53.81 
 
 
439 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3288  carboxyl-terminal protease  51.36 
 
 
432 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4248  carboxyl-terminal protease  56.03 
 
 
438 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00499045 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04640  carboxyl-terminal protease S41A  56.22 
 
 
439 aa  442  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.900151  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5329  carboxyl-terminal protease family protein  57.04 
 
 
445 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0331  peptidase S41A, protease  57.18 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5869  putative carboxyl-terminal protease  55.61 
 
 
436 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67810  putative carboxyl-terminal protease  55.37 
 
 
436 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.859493  normal  0.405059 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2533  carboxyl-terminal protease  53.02 
 
 
441 aa  438  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5058  carboxyl-terminal protease  55.78 
 
 
438 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4887  peptidase S41A, C-terminal protease  53.91 
 
 
445 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4931  carboxyl-terminal protease  55.78 
 
 
438 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5109  carboxyl-terminal protease  55.22 
 
 
438 aa  434  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0407  carboxyl-terminal protease  54.48 
 
 
437 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0492  C-terminal processing peptidase  49.31 
 
 
462 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2568  C-terminal processing peptidase-3  52.18 
 
 
426 aa  425  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.257628  hitchhiker  0.00928405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2392  peptidase S41A, protease  50 
 
 
468 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.605927 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2020  carboxyl-terminal protease  50.24 
 
 
428 aa  420  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0858479  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3168  carboxyl-terminal protease  50.37 
 
 
468 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0383  carboxyl-terminal protease  46.01 
 
 
476 aa  413  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000063116  normal  0.361886 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0524  carboxy-terminal peptidase  48.8 
 
 
482 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.707834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1673  periplasmic protease  46.83 
 
 
441 aa  402  1e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.248616  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0682  carboxyl-terminal protease  48.8 
 
 
482 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00713841 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0044  carboxyl-terminal protease  48.52 
 
 
440 aa  404  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2409  carboxyl-terminal protease  51.75 
 
 
452 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000398409  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3063  carboxyl-terminal protease  48.42 
 
 
438 aa  391  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0122157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1920  carboxyl-terminal protease  50.87 
 
 
455 aa  386  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000216068  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0608  peptidase S41A, C-terminal protease  46.2 
 
 
480 aa  385  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1853  peptidase S41A, C-terminal protease  47.95 
 
 
443 aa  385  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000457328  normal  0.829779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0561  hypothetical protein  45.98 
 
 
445 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0537  hypothetical protein  45.98 
 
 
445 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1935  carboxyl-terminal protease  50 
 
 
444 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000744169  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1772  carboxy-terminal processing protease  48.38 
 
 
443 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.011127  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1119  carboxyl-terminal protease  48.46 
 
 
481 aa  374  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1210  carboxyl-terminal protease  46.99 
 
 
415 aa  369  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6187  peptidase S41A  43.44 
 
 
515 aa  365  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1500  carboxyl-terminal protease  48.64 
 
 
444 aa  366  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000070609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1290  carboxyl-terminal protease  49.38 
 
 
444 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000397536  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2993  carboxyl-terminal protease  50.12 
 
 
444 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.70163e-17 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0164  carboxyl-terminal protease  47.06 
 
 
458 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4487  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  48.87 
 
 
444 aa  364  1e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.372365  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0445  carboxyl-terminal protease  43.44 
 
 
515 aa  364  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.271211  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3509  carboxyl-terminal protease  46.14 
 
 
461 aa  363  3e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2244  carboxyl-terminal protease  43.44 
 
 
515 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.939746  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2869  carboxyl-terminal protease  43.44 
 
 
515 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.274998 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2858  carboxyl-terminal protease  43.44 
 
 
515 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0738688  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0969  carboxy-terminal processing protease  46.33 
 
 
450 aa  362  8e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0264  carboxyl-terminal protease  42.43 
 
 
530 aa  360  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1232  C-terminal processing peptidase S41A  49.62 
 
 
440 aa  360  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00731341  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0566  carboxyl-terminal protease  46.8 
 
 
456 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0258  carboxyl-terminal protease  47.03 
 
 
457 aa  360  4e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0533  carboxyl-terminal protease  44.19 
 
 
522 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.639363  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4182  peptidase S41A  44.19 
 
 
526 aa  359  5e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2775  carboxyl-terminal protease  42.25 
 
 
511 aa  359  6e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2913  carboxyl-terminal protease  42.04 
 
 
513 aa  358  8e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0415  carboxy-terminal protease  43.79 
 
 
521 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0166  carboxyl-terminal protease  47.17 
 
 
452 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.97074  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1546  carboxyl-terminal protease  45.35 
 
 
483 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0199003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0661  C-terminal processing protease-3  43.74 
 
 
530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.860766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0477  carboxyl-terminal protease  43.74 
 
 
524 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.811957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0496  carboxyl-terminal protease  43.74 
 
 
530 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0182  carboxy-terminal protease  43.74 
 
 
524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3209  carboxy-terminal protease  43.74 
 
 
524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1410  carboxy-terminal protease  43.74 
 
 
524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2837  carboxy-terminal protease  43.74 
 
 
524 aa  356  3.9999999999999996e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0449  peptidase S41A  46.38 
 
 
451 aa  354  1e-96  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.143572  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0414  carboxy-terminal-processing protease precursor (C- terminal-processing protease)  49.75 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.479747 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3021  carboxyl-terminal protease  47.67 
 
 
472 aa  355  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.846777  normal  0.0258031 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1646  carboxyl-terminal protease  46.48 
 
 
458 aa  353  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0449  carboxy-terminal processing protease precursor  43.41 
 
 
456 aa  353  2.9999999999999997e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0525  carboxyl-terminal protease  49.5 
 
 
451 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.29494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1084  C-terminal processing peptidase  41.88 
 
 
480 aa  353  4e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.207844  normal  0.316164 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  45.27 
 
 
435 aa  353  4e-96  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1722  C-terminal processing peptidase  43.41 
 
 
456 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  47.58 
 
 
457 aa  352  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3016  carboxyl-terminal protease  45.94 
 
 
440 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55561  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3885  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 
440 aa  349  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.26921  normal  0.039138 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2508  carboxyl-terminal protease  45.97 
 
 
471 aa  349  6e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4223  carboxyl-terminal protease  44.24 
 
 
440 aa  348  9e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.502517  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4209  carboxyl-terminal protease  44.78 
 
 
440 aa  348  9e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.194144 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  49.86 
 
 
507 aa  348  1e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4733  carboxyl-terminal protease  44.47 
 
 
440 aa  348  1e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0128345  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0574  carboxyl-terminal protease  48.97 
 
 
462 aa  347  3e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1062  carboxyl-terminal protease  45.66 
 
 
442 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.937129  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0324  C-terminal processing peptidase  47.18 
 
 
434 aa  346  6e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2562  carboxyl-terminal protease  44.98 
 
 
440 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0132517 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2287  carboxyl-terminal protease  44.98 
 
 
440 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.939403  normal  0.065151 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4300  carboxy-terminal protease  45.01 
 
 
444 aa  345  1e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0300488  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2006  carboxy--processing protease (C-terminal-processing protease)  49.06 
 
 
434 aa  345  1e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00114653  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1949  carboxyl-terminal protease  44.95 
 
 
477 aa  345  1e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  43.67 
 
 
439 aa  344  2e-93  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0725  carboxyl-terminal protease  43.3 
 
 
428 aa  344  2e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2567  carboxyl-terminal protease  46.65 
 
 
456 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000043041 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  44.72 
 
 
444 aa  343  4e-93  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2244  carboxyl-terminal protease  44.75 
 
 
440 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0625684  normal  0.355809 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1654  carboxyl-terminal protease  44.99 
 
 
477 aa  342  5.999999999999999e-93  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.9351 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1472  carboxyl-terminal protease  47.28 
 
 
444 aa  342  7e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.732729  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1770  carboxyl-terminal protease  47.89 
 
 
424 aa  342  8e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>