More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0443 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  100 
 
 
541 aa  1094  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  59.7 
 
 
541 aa  620  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.18 
 
 
540 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3669  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.85 
 
 
716 aa  300  5e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170337  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0926  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  34.57 
 
 
539 aa  300  5e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5279  putative chemotaxis transducer  48.68 
 
 
712 aa  296  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0493383  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61300  putative chemotaxis transducer  48.39 
 
 
712 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.862971 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1939  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.39 
 
 
638 aa  288  2e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.573171  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3611  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.59 
 
 
634 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4053  methyl-accepting chemotaxis protein  45.64 
 
 
634 aa  283  5e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0851  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.41 
 
 
674 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.244273  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4715  chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 
713 aa  280  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.233277  normal  0.171171 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0949  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.6 
 
 
636 aa  281  3e-74  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0451727 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0619  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49 
 
 
634 aa  280  6e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1098  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.03 
 
 
637 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0167241  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3379  methyl-accepting chemotaxis protein  45.48 
 
 
559 aa  276  9e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1963  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.6 
 
 
637 aa  275  2e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.870205  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2562  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.23 
 
 
671 aa  271  2e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.94 
 
 
541 aa  267  3e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3705  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.06 
 
 
541 aa  266  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0963791  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.99 
 
 
529 aa  263  6e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.017789  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.51 
 
 
411 aa  263  7e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4196  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.2 
 
 
552 aa  262  1e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.14959  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4382  chemotaxis sensory transducer  41.49 
 
 
738 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 
545 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0650014  normal  0.35347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2358  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 
545 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2347  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.42 
 
 
545 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  41.42 
 
 
545 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.94984e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0343  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.08 
 
 
645 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.675969  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.87 
 
 
545 aa  259  8e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  33.58 
 
 
535 aa  259  9e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42 
 
 
499 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2000  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.96 
 
 
560 aa  259  1e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0144557  normal  0.0324669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.17 
 
 
564 aa  258  2e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.14 
 
 
545 aa  258  3e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 
640 aa  258  3e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1674  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.3 
 
 
543 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.92 
 
 
572 aa  255  2e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4887  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.34 
 
 
645 aa  254  2e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.658451 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
545 aa  253  4e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1228  methyl-accepting chemotaxis transducer  46.39 
 
 
688 aa  254  4e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.739741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  40.05 
 
 
545 aa  254  4e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2546  putative chemotaxis transducer  46.67 
 
 
714 aa  253  5e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.6 
 
 
568 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  32.27 
 
 
528 aa  253  6e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0219  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.9 
 
 
773 aa  253  9e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.952357  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0450  chemotaxis sensory transducer  43.59 
 
 
645 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0320  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.73 
 
 
645 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  4.09011e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  40.05 
 
 
545 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0567  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
633 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1998  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.99 
 
 
714 aa  251  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0164438 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3770  chemotaxis sensory transducer  45.94 
 
 
715 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2970  chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
712 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0539  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
633 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0342  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.43 
 
 
645 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860801  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0563  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.33 
 
 
633 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29760  putative chemotaxis transducer  46.39 
 
 
714 aa  251  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3768  chemotaxis sensory transducer  46.43 
 
 
560 aa  250  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29800  putative chemotaxis transducer  47.13 
 
 
561 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00431462  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3827  methyl-accepting chemotaxis transducer  37.95 
 
 
695 aa  250  5e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.21184e-05 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.2 
 
 
545 aa  250  5e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.888266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2954  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.76 
 
 
620 aa  250  5e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000679912  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.25 
 
 
538 aa  249  7e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4463  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.87 
 
 
552 aa  249  9e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.43301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.69 
 
 
640 aa  248  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.753261  normal  0.0120166 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2607  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.36 
 
 
541 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00122932  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3169  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.07 
 
 
620 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0580  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.1 
 
 
679 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0080  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.97 
 
 
636 aa  247  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0167  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.83 
 
 
540 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.24 
 
 
548 aa  248  3e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0085  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.28 
 
 
638 aa  247  4e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0647334  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2412  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.89 
 
 
545 aa  247  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.516535  hitchhiker  6.53474e-06 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0712  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.59 
 
 
624 aa  247  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4190  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45 
 
 
688 aa  247  5e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.251316  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4404  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.43 
 
 
638 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0156105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3557  methyl-accepting chemotaxis transducer  46.04 
 
 
714 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386044  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1257  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.28 
 
 
688 aa  246  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.124474  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2217  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.04 
 
 
714 aa  246  9e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0905  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  41.5 
 
 
640 aa  245  1e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.746842  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2609  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.5 
 
 
621 aa  245  1e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.206567  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2074  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.75 
 
 
714 aa  246  1e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.203311  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1030  methyl-accepting chemotaxis protein  37.19 
 
 
549 aa  245  1e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3582  methyl-accepting chemotaxis protein  32.73 
 
 
541 aa  244  2e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0734  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.48 
 
 
643 aa  244  2e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.770301  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3502  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.33 
 
 
620 aa  244  2e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.666992  normal  0.2901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2548  putative chemotaxis transducer  46.53 
 
 
561 aa  244  2e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1701  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.35 
 
 
650 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.076135 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2174  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.01 
 
 
544 aa  244  3e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00506259 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2365  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.45 
 
 
714 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1059  methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 
629 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0106  methyl-accepting chemotaxis protein  41.44 
 
 
546 aa  244  4e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.827543  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0099  chemotaxis sensory transducer  42.78 
 
 
639 aa  244  4e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  1.52719e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3098  methyl-accepting chemotaxis protein  41.79 
 
 
642 aa  243  5e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.398555  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0712  chemotaxis sensory transducer  41.67 
 
 
541 aa  243  5e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  5.66108e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.05 
 
 
547 aa  243  5e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3173  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.69 
 
 
541 aa  243  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0131988  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1798  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  43.45 
 
 
681 aa  243  7e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.668901  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3522  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.4 
 
 
636 aa  242  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2861  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.17 
 
 
544 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.445183 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>