More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4814 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.59 
 
 		 1048 aa  654    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4814  histidine kinase  100 
 
 		 919 aa  1789    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00150972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 		 1711 aa  597  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.12 
 
 		 1383 aa  589  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.38 
 
 		 1140 aa  583  1.0000000000000001e-165  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.166751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2687  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.76 
 
 		 1013 aa  567  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4349  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.88 
 
 		 1514 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4411  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.75 
 
 		 1514 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0203527 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 1431 aa  558  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4611  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 		 1002 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4456  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.58 
 
 		 1415 aa  552  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0339  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.03 
 
 		 1390 aa  552  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.726297  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1666  ATP-binding region, ATPase-like  43.68 
 
 		 1427 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.207779 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.52 
 
 		 1390 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0937102  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0360  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.52 
 
 		 1390 aa  550  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.592677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3954  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.76 
 
 		 1370 aa  543  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.64 
 
 		 1426 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  43.9 
 
 		 1299 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.13 
 
 		 1406 aa  541  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1931  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.67 
 
 		 1385 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 		 1153 aa  538  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.31 
 
 		 1361 aa  539  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.11 
 
 		 1010 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0221  GAF sensor hybrid histidine kinase  42.21 
 
 		 1651 aa  526  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.01 
 
 		 1559 aa  526  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.56 
 
 		 1152 aa  521  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41 
 
 		 1131 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0135  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 1631 aa  521  1e-146  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  42.76 
 
 		 1202 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7104  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.72 
 
 		 1646 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4776  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.44 
 
 		 1248 aa  511  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 		 1003 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.504038  normal  0.0804481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.89 
 
 		 1118 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.18 
 
 		 1287 aa  496  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.26 
 
 		 1051 aa  492  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4775  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.87 
 
 		 1383 aa  479  1e-134  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4608  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.67 
 
 		 1645 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.284957  normal  0.407853 
 
 
-
 
NC_006692  CNG02240  protein-histidine kinase, putative  33.99 
 
 		 1816 aa  289  2e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.58 
 
 		 1180 aa  271  5e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02350  protein-histidine kinase, putative  36.31 
 
 		 1614 aa  266  2e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.16806  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  36.1 
 
 		 1156 aa  265  3e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 		 1172 aa  256  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2980  histidine kinase  35.29 
 
 		 1311 aa  253  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229379  normal  0.450681 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  34.8 
 
 		 1366 aa  248  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 		 934 aa  243  2e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3120  histidine kinase  33.17 
 
 		 1344 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.628446  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2824  ATP-binding region ATPase domain protein  33.01 
 
 		 1374 aa  239  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1754  histidine kinase  31.11 
 
 		 1344 aa  238  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.176495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0812  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.54 
 
 		 975 aa  237  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.817585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  30.26 
 
 		 1347 aa  234  4.0000000000000004e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.28 
 
 		 1301 aa  231  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  35.26 
 
 		 863 aa  231  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  31.88 
 
 		 1306 aa  229  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  32.55 
 
 		 1343 aa  228  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  29.63 
 
 		 1384 aa  227  1e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  32.76 
 
 		 1378 aa  224  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6436  histidine kinase  32.65 
 
 		 1418 aa  223  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1604  two component transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 904 aa  223  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  32.04 
 
 		 1378 aa  222  3e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  38.89 
 
 		 876 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  29.75 
 
 		 1373 aa  219  2e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  34.76 
 
 		 1355 aa  218  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  30.14 
 
 		 1366 aa  218  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2832  ATP-binding region ATPase domain protein  29.98 
 
 		 1340 aa  216  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201204  hitchhiker  0.008817 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 1341 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6047  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 677 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002587  chitin catabolic cascade sensor histidine kinase ChiS  32.14 
 
 		 1111 aa  214  4.9999999999999996e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2107  two component transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 1349 aa  211  5e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000288147  normal  0.419692 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2074  sensor histidine kinase  31 
 
 		 816 aa  211  6e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0783  ATP-binding region ATPase domain protein  32.78 
 
 		 1374 aa  210  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2076  histidine kinase  30.3 
 
 		 1373 aa  209  2e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2575  chitin degradation sensor protein  32.84 
 
 		 1127 aa  209  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 978 aa  208  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149383  normal  0.186346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0505  response regulator receiver  32.93 
 
 		 1334 aa  208  4e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.86 
 
 		 979 aa  207  5e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 974 aa  208  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0756  sensory box sensor histidine kinase/DNA-binding response regulator  31.21 
 
 		 993 aa  207  8e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  29.48 
 
 		 1370 aa  207  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 		 823 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 816 aa  204  4e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4604  histidine kinase  33.33 
 
 		 663 aa  204  7e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0150  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.03 
 
 		 1177 aa  204  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6165  histidine kinase  29.91 
 
 		 1397 aa  204  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000541195 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0812  histidine kinase  30.94 
 
 		 1335 aa  204  9e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 		 1133 aa  203  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03422  hypothetical protein  33.25 
 
 		 1128 aa  203  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2723  histidine kinase  30.75 
 
 		 1347 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  30.91 
 
 		 1207 aa  202  1.9999999999999998e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1362 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 		 1002 aa  201  5e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0411  signal transduction histidine kinase, LytS  29.01 
 
 		 1018 aa  201  6e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000411039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3199  two component transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 		 940 aa  201  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157032  normal  0.236848 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 		 975 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.41 
 
 		 858 aa  198  3e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  28.02 
 
 		 961 aa  197  9e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.91 
 
 		 1099 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 		 1058 aa  197  9e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 		 977 aa  196  2e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.84 
 
 		 1361 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.5 
 
 		 1358 aa  194  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>