More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3277 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3277  ABC transporter related protein  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0972  ABC transporter related  95.77 
 
 		 307 aa  589  1e-167  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0658  ABC transporter-related protein  65.23 
 
 		 308 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292078 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1148  ABC transporter related  63.25 
 
 		 307 aa  378  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00842419  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0917  ABC transporter related  56.58 
 
 		 312 aa  344  8e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.807075 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3463  ABC transporter-related protein  56.91 
 
 		 305 aa  343  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0860  ABC transporter related  51.33 
 
 		 315 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.134812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  69.37 
 
 		 510 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  69.59 
 
 		 512 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1763  ABC transporter related  50.66 
 
 		 311 aa  285  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.612212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1606  ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.704701  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1913  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  48.34 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.173813  normal  0.389183 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  47.02 
 
 		 322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2106  ABC transporter related  48.54 
 
 		 311 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1901  ABC transporter related  48.36 
 
 		 323 aa  271  8.000000000000001e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.298526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  46.23 
 
 		 325 aa  271  8.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0808  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1778  ABC transporter related protein  47.71 
 
 		 317 aa  269  4e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0112874  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  45.03 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  44.7 
 
 		 324 aa  264  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  45.28 
 
 		 314 aa  261  8e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1109  ABC transporter related  42.72 
 
 		 312 aa  254  9e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.307772 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  43.28 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1292  ABC transporter, ATP binding/permease protein  46.69 
 
 		 315 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.549706  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  43.85 
 
 		 319 aa  252  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  43.91 
 
 		 315 aa  247  2e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 		 308 aa  247  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  43.23 
 
 		 651 aa  247  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1587  ABC transporter related  45.72 
 
 		 299 aa  245  6e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119219  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1588  ABC transporter related  40.26 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.187855  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1081  ATPase  44.44 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  44.59 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  41.58 
 
 		 323 aa  242  6e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5638  ABC transporter related  41.64 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.321953 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 350 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0426  ABC transporter-related protein  42.59 
 
 		 340 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  42.86 
 
 		 316 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  43.05 
 
 		 319 aa  236  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  43.14 
 
 		 335 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2917  ABC transporter related  42.41 
 
 		 307 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.528915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0893  ABC transporter related  45.7 
 
 		 317 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.811101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  40.92 
 
 		 322 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  41.31 
 
 		 575 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  38.74 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4678  ABC transporter related  43.65 
 
 		 667 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1019  ABC transporter related  44.81 
 
 		 590 aa  231  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  50.89 
 
 		 594 aa  230  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 312 aa  230  2e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2926  ABC transporter related  42.21 
 
 		 316 aa  229  4e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0894  ABC transporter related  44.7 
 
 		 314 aa  228  8e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  44.97 
 
 		 590 aa  228  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0965  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 578 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0912  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 578 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0880  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 578 aa  227  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0944  ABC transporter ATP-binding protein  44.55 
 
 		 578 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0852  ABC transporter, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 578 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  44.13 
 
 		 593 aa  225  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  43.65 
 
 		 576 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00761  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  42.86 
 
 		 578 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00778  hypothetical protein  42.86 
 
 		 578 aa  225  8e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  45.05 
 
 		 1106 aa  225  9e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0859  ABC transporter, ATP-binding protein  43.51 
 
 		 578 aa  225  9e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2848  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 578 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0115  ABC transporter related  39.53 
 
 		 301 aa  224  1e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0942  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 578 aa  224  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0848  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 578 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2849  ABC transporter related  42.86 
 
 		 578 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  41.14 
 
 		 346 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  49.8 
 
 		 578 aa  223  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  41.14 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  41.14 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  43.42 
 
 		 580 aa  223  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  51.56 
 
 		 579 aa  223  4e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0817  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 578 aa  222  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2558  ABC transporter, ATP-binding protein  42.53 
 
 		 578 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.943618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.73 
 
 		 322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  43.05 
 
 		 322 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2813  ABC transporter, ATP-binding protein  41.56 
 
 		 580 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 585 aa  222  6e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2901  ABC transporter related  41.56 
 
 		 580 aa  222  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  44.26 
 
 		 582 aa  222  7e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 589 aa  221  9e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  40.13 
 
 		 318 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  42.07 
 
 		 583 aa  221  9.999999999999999e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  40.13 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3221  ABC transporter-related protein  43.93 
 
 		 310 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.357398  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  40.13 
 
 		 318 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  43.43 
 
 		 322 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  46.79 
 
 		 581 aa  219  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  44.92 
 
 		 576 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0696  hypothetical protein  42.67 
 
 		 580 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1550  ABC transporter related  40.13 
 
 		 318 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0714  hypothetical protein  42.67 
 
 		 580 aa  219  6e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2512  ABC transporter related  44.95 
 
 		 583 aa  219  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.58848  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  42.16 
 
 		 328 aa  218  7.999999999999999e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2809  ABC transporter related  48.44 
 
 		 255 aa  218  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.640321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  40.72 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>