More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_3352 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  58.48 
 
 		 683 aa  826    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  58.82 
 
 		 683 aa  811    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  77.16 
 
 		 681 aa  1085    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  58.98 
 
 		 683 aa  822    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  59.13 
 
 		 683 aa  814    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  58.98 
 
 		 683 aa  814    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  57.21 
 
 		 683 aa  809    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 683 aa  1414    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  58.25 
 
 		 683 aa  829    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  58.98 
 
 		 683 aa  822    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  59.13 
 
 		 683 aa  823    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  57.06 
 
 		 683 aa  805    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  58.51 
 
 		 683 aa  808    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 		 677 aa  470  1.0000000000000001e-131  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  40.5 
 
 		 648 aa  458  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  38.47 
 
 		 649 aa  438  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.03 
 
 		 661 aa  419  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.19 
 
 		 668 aa  407  1.0000000000000001e-112  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 		 705 aa  391  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 		 656 aa  387  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  38.49 
 
 		 693 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.72 
 
 		 643 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.98 
 
 		 704 aa  383  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  39.64 
 
 		 714 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.78 
 
 		 643 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.78 
 
 		 643 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.02 
 
 		 646 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.32 
 
 		 648 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.58 
 
 		 714 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.23 
 
 		 734 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.73 
 
 		 618 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  40.62 
 
 		 626 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.87 
 
 		 662 aa  374  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 727 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.97 
 
 		 727 aa  374  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.37 
 
 		 712 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.21 
 
 		 905 aa  375  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  37.31 
 
 		 667 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.64 
 
 		 761 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.47 
 
 		 811 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.7 
 
 		 728 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 		 744 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  35.89 
 
 		 701 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.91 
 
 		 739 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  36.39 
 
 		 728 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  37.26 
 
 		 824 aa  360  5e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.91 
 
 		 640 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 		 806 aa  359  9.999999999999999e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  37.1 
 
 		 824 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  39.25 
 
 		 757 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.36 
 
 		 776 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  35.49 
 
 		 829 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.93 
 
 		 720 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.04 
 
 		 732 aa  351  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.01 
 
 		 734 aa  351  3e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  37.32 
 
 		 735 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.44 
 
 		 654 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  37.97 
 
 		 712 aa  347  5e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 720 aa  346  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.33 
 
 		 625 aa  345  1e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  33.94 
 
 		 814 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 		 640 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  34.99 
 
 		 860 aa  343  5.999999999999999e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 741 aa  342  1e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  35.93 
 
 		 890 aa  342  1e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.04 
 
 		 795 aa  342  1e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.04 
 
 		 776 aa  341  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  35.08 
 
 		 880 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 		 770 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.54 
 
 		 765 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 		 751 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  34.91 
 
 		 779 aa  336  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 710 aa  335  1e-90  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.54 
 
 		 761 aa  333  7.000000000000001e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 775 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  33.97 
 
 		 853 aa  332  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  34.19 
 
 		 757 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  35.59 
 
 		 833 aa  331  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  36.83 
 
 		 678 aa  331  3e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 755 aa  331  3e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.61 
 
 		 641 aa  330  6e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  36.04 
 
 		 709 aa  329  1.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  36.69 
 
 		 723 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.97 
 
 		 680 aa  328  2.0000000000000001e-88  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 		 730 aa  328  2.0000000000000001e-88  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 		 763 aa  327  5e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.79 
 
 		 710 aa  326  8.000000000000001e-88  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  34.13 
 
 		 861 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  37.48 
 
 		 658 aa  325  2e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  33.67 
 
 		 855 aa  323  6e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.1 
 
 		 679 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  34.45 
 
 		 704 aa  322  9.999999999999999e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  35.29 
 
 		 686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 676 aa  322  1.9999999999999998e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 691 aa  321  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  36.23 
 
 		 675 aa  319  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  33.17 
 
 		 759 aa  318  2e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  35.06 
 
 		 669 aa  318  2e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 665 aa  318  3e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  31.64 
 
 		 713 aa  317  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>