More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2982 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  100 
 
 		 699 aa  1434    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  58.16 
 
 		 668 aa  797    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  43.71 
 
 		 702 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  42.67 
 
 		 702 aa  522  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  42.25 
 
 		 702 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0043  TonB-dependent receptor  41.82 
 
 		 684 aa  502  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  35.03 
 
 		 696 aa  371  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  33.38 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 661 aa  251  5e-65  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  28.03 
 
 		 685 aa  241  2e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  30.85 
 
 		 760 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 		 672 aa  204  4e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  28.42 
 
 		 695 aa  197  7e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 697 aa  195  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  27.66 
 
 		 699 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  27.8 
 
 		 667 aa  180  8e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  25.52 
 
 		 745 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  25.52 
 
 		 745 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  25.52 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  25.52 
 
 		 749 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  25.52 
 
 		 745 aa  170  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  25.52 
 
 		 745 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  25.37 
 
 		 753 aa  167  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  25.15 
 
 		 687 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  24.85 
 
 		 709 aa  167  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  25.6 
 
 		 719 aa  164  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  25.75 
 
 		 688 aa  162  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  25.46 
 
 		 723 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  25.56 
 
 		 713 aa  161  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  25.07 
 
 		 688 aa  160  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  26.23 
 
 		 726 aa  160  8e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  25.21 
 
 		 710 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  25.1 
 
 		 688 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  23.54 
 
 		 676 aa  154  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  24.11 
 
 		 710 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  24.11 
 
 		 710 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  24.11 
 
 		 710 aa  154  7e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  23.54 
 
 		 710 aa  153  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  24.9 
 
 		 688 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  23.5 
 
 		 676 aa  152  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  24.8 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  25.77 
 
 		 686 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0541  TonB-dependent receptor  25.86 
 
 		 718 aa  145  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  25.03 
 
 		 687 aa  145  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  25.83 
 
 		 681 aa  145  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  25.07 
 
 		 724 aa  143  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 725 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  25 
 
 		 684 aa  140  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  24.82 
 
 		 698 aa  138  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  26.19 
 
 		 661 aa  138  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  25.49 
 
 		 663 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  24.5 
 
 		 681 aa  135  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  24.23 
 
 		 681 aa  134  7.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  25.22 
 
 		 686 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.07 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  26.59 
 
 		 668 aa  130  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1282  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 698 aa  124  6e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  24.08 
 
 		 750 aa  124  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  24.19 
 
 		 667 aa  123  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  25.48 
 
 		 668 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2221  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 793 aa  119  3e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0217178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  24.93 
 
 		 668 aa  117  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  23.81 
 
 		 669 aa  117  8.999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.54 
 
 		 750 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  22.36 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  20.78 
 
 		 713 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1053  TonB-dependent receptor  25.03 
 
 		 705 aa  108  5e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3271  outer membrane heme receptor  23.43 
 
 		 728 aa  105  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.403034  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0619  TonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 767 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 		 766 aa  99.8  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3340  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 685 aa  97.1  9e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3750  TonB-dependent receptor  22.37 
 
 		 741 aa  92.8  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2653  TonB-dependent receptor  23.5 
 
 		 716 aa  91.3  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5315  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.6 
 
 		 767 aa  90.1  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4772  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.04 
 
 		 769 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.784759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2296  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.61 
 
 		 734 aa  88.6  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.234344 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  21.64 
 
 		 729 aa  87.8  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4838  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.75 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0484  TonB-dependent receptor  26.36 
 
 		 749 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698636  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  25.76 
 
 		 713 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1206  putative TonB-dependent receptor  21.92 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5431  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.59 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5431  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.59 
 
 		 755 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.469015  normal  0.608312 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0460  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  21.5 
 
 		 731 aa  85.1  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2591  hemin receptor precursor, TonB-dependent outer membrane uptake protein  29.28 
 
 		 687 aa  84.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.125278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0763  TonB-dependent receptor  22.5 
 
 		 721 aa  84.3  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.72696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  25.38 
 
 		 708 aa  84.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0221  TonB-dependent haemoglobin/transferrin/lactoferrin receptor  22.17 
 
 		 755 aa  83.2  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2813  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  21.84 
 
 		 752 aa  82  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409295  normal  0.033455 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 713 aa  82  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4218  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.2 
 
 		 862 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  25.76 
 
 		 708 aa  80.9  0.00000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  22.02 
 
 		 775 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  22.25 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3079  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.3 
 
 		 749 aa  79.7  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578184  normal  0.640721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1043  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.52 
 
 		 862 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.261279  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1006  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  22.07 
 
 		 759 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0425  TonB-dependent receptor domain-containing protein  29.07 
 
 		 625 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00623502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4004  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  23.3 
 
 		 681 aa  77  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.371484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>