96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2028 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  51.08 
 
 		 690 aa  748    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 704 aa  1452    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  52.14 
 
 		 698 aa  734    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.07 
 
 		 688 aa  616  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.09 
 
 		 687 aa  608  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.43 
 
 		 704 aa  525  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  39.69 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  45.21 
 
 		 932 aa  448  1.0000000000000001e-124  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  45.01 
 
 		 750 aa  443  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.89 
 
 		 487 aa  433  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 		 638 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  36.25 
 
 		 581 aa  416  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  42.33 
 
 		 463 aa  391  1e-107  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  43.8 
 
 		 606 aa  380  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  41.72 
 
 		 470 aa  360  6e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  34.88 
 
 		 434 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  32.72 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  32.86 
 
 		 460 aa  256  1.0000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  38.35 
 
 		 410 aa  248  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  28.38 
 
 		 436 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  28.16 
 
 		 436 aa  167  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.99 
 
 		 467 aa  137  9e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  29.05 
 
 		 581 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  36.32 
 
 		 435 aa  102  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  34.62 
 
 		 435 aa  100  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  32.58 
 
 		 478 aa  99.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  36.99 
 
 		 450 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  29.67 
 
 		 441 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  24.13 
 
 		 447 aa  95.9  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  30.3 
 
 		 429 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1666  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  32.14 
 
 		 1289 aa  92.8  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.7 
 
 		 674 aa  89.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  32.81 
 
 		 445 aa  89.7  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  29.3 
 
 		 473 aa  88.6  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  30.53 
 
 		 340 aa  88.2  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  35.94 
 
 		 474 aa  88.6  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  33 
 
 		 452 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  34.87 
 
 		 440 aa  88.2  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  27.94 
 
 		 473 aa  87.8  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  32 
 
 		 711 aa  85.5  0.000000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  24.2 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  33.82 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  31.88 
 
 		 429 aa  80.1  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7366  phospholipase C, phosphocholine-specific  36.73 
 
 		 805 aa  79.3  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  27.93 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  25.64 
 
 		 479 aa  77.8  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  35.06 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  25.26 
 
 		 538 aa  77  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 415 aa  77  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  30.5 
 
 		 494 aa  74.7  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  26.42 
 
 		 471 aa  74.3  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  35.56 
 
 		 408 aa  73.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.32 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  34.78 
 
 		 490 aa  72.4  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  41.58 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  41.58 
 
 		 446 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0824  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  27.75 
 
 		 1264 aa  67.8  0.0000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000954733  decreased coverage  0.00757756 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  31.01 
 
 		 627 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  24.47 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1614  glycosy hydrolase family protein  38.21 
 
 		 1471 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  25.6 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  25.7 
 
 		 446 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  35 
 
 		 471 aa  65.1  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  41.86 
 
 		 495 aa  62.8  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  24.84 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  30.5 
 
 		 482 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  37.61 
 
 		 478 aa  61.2  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.05 
 
 		 1967 aa  58.9  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0859  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  24.58 
 
 		 2095 aa  57.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  34.94 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0850  alpha-N-acetylglucosaminidase family protein  30 
 
 		 2095 aa  55.1  0.000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.871673  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  31.96 
 
 		 466 aa  54.7  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0195  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.42 
 
 		 1329 aa  54.3  0.000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  36.05 
 
 		 537 aa  53.5  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  32.65 
 
 		 532 aa  53.9  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  34.29 
 
 		 606 aa  53.9  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  34.29 
 
 		 584 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  36.36 
 
 		 464 aa  53.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  28.89 
 
 		 473 aa  52.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  32.59 
 
 		 731 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  33.33 
 
 		 505 aa  52  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1885  S-layer domain protein  28.99 
 
 		 591 aa  51.6  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.726885  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  46.43 
 
 		 474 aa  50.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  33.7 
 
 		 223 aa  50.8  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  32.29 
 
 		 515 aa  50.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4057  carbohydrate-binding family V/XII protein  28.86 
 
 		 600 aa  50.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.770883  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  29.41 
 
 		 1965 aa  50.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1686  Beta-galactosidase  34.94 
 
 		 780 aa  49.7  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00233252  normal  0.321684 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  41.82 
 
 		 212 aa  48.5  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  38.46 
 
 		 483 aa  47  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4540  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.37 
 
 		 616 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  26.95 
 
 		 492 aa  45.4  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5007  Alpha-galactosidase  26.21 
 
 		 850 aa  44.3  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0532  putative exo-alpha-sialidase  30.58 
 
 		 1173 aa  44.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 1467 aa  43.9  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>