171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0056 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0056  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00910  transcriptional regulator, MerR family protein  47.78 
 
 		 297 aa  284  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.307342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5621  transcriptional regulator, MerR family  44.04 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.695249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5173  transcriptional regulator, MerR family  34.14 
 
 		 291 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3717  regulatory protein MerR  38.79 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1060  MerR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2032  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 295 aa  149  7e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.662057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2029  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 298 aa  145  8.000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1107  MerR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 315 aa  96.3  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1049  transcriptional regulator, MerR family  20.27 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.362937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0938  regulatory protein MerR  22.18 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0487  regulatory protein, MerR  21.74 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2028  transcriptional regulator, MerR family  24.23 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000000332734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4630  MerR family transcriptional regulator  21.37 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1753  regulatory protein MerR  25.45 
 
 		 319 aa  79.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2972  MerR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 316 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0234999  normal  0.559596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4491  MerR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.51698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2116  regulatory protein, MerR  25.23 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3286  MerR family transcriptional regulator  20.15 
 
 		 321 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2399  transcriptional regulator, MerR family  20.22 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2213  transcriptional regulator, MerR family  23.64 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.68316  normal  0.172033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0810  MerR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.826651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4615  MerR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 311 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1448  MerR family transcriptional regulator  22.59 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2255  MerR family transcriptional regulator  20.07 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0803543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3271  MerR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 335 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.107511  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3692  MerR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  20.34 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1212  MerR family transcriptional regulator  22.62 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1384  transcriptional regulator, MerR family  20.89 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000396773  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3757  MerR family transcriptional regulator  21.81 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00211459  hitchhiker  0.00419816 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0894  MerR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2776  transcriptional regulator  24.45 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.379235  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6238  regulatory protein, MerR  19.13 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.316883  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0460  MerR family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2702  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.22 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1484  transcriptional regulator, MerR family  21.86 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0787562  hitchhiker  0.0000374152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2126  MerR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1577  transcriptional regulator, MerR family  24.7 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05121  hypothetical protein  37.5 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4299  regulatory protein MerR  22.63 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0130356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1397  putative transcriptional regulator, MerR family  21.9 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1180  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 		 242 aa  55.8  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3169  MerR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0340158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0064  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1781  transcriptional regulator, MerR family protein  38.1 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.329966  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1503  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104173 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1308  transcriptional regulator, MerR family  25.69 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1525  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175945 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1488  transcriptional regulator, MerR family protein  38.1 
 
 		 242 aa  54.7  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.372841  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001251  transcriptional regulator MerR family  32.81 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0238  hypothetical protein  21.53 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0010  transcriptional regulator, MerR family protein  27.78 
 
 		 241 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.904582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0081  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 265 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3069  MerR family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3212  MerR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.645977  normal  0.909294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3758  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.312823 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2473  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.03 
 
 		 398 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000169304 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1155  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0511253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2355  MerR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278081  normal  0.108483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3385  MerR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5846  MerR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 323 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0781  MerR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 299 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2964  cobalamin B12-binding domain-containing protein  21.43 
 
 		 223 aa  50.4  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0486605  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4396  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61620  MerR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.076426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5308  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3055  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 342 aa  49.7  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0920  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 141 aa  49.3  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.320526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  30.77 
 
 		 243 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4353  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 321 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.651332  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4486  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 321 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.892291  hitchhiker  0.0000100174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3741  transcriptional regulator, MerR family  29.89 
 
 		 112 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.274926  normal  0.767741 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5562  transcriptional regulator  36.92 
 
 		 139 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2847  MerR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 162 aa  48.9  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.786709  hitchhiker  0.005225 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  30.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4735  MerR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 313 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.49506 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1164  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 361 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1235  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 366 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1165  MerR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1868  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  30.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1877  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 159 aa  47.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  30.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3038  MerR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 125 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0025515  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  30.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  30.16 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02056  DNA-binding transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1122  transcriptional regulator, MerR family  30.16 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2306  transcriptional regulator, MerR family protein  30.77 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2395  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3096  MerR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 140 aa  47.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0714876 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2507  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.54567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>