More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0563 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0563  protein-export membrane protein SecD  100 
 
 		 473 aa  941    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  46.15 
 
 		 530 aa  341  2e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  46.11 
 
 		 533 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  47.69 
 
 		 525 aa  339  7e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  46.21 
 
 		 532 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  46.67 
 
 		 533 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  45.68 
 
 		 532 aa  333  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  46.08 
 
 		 533 aa  332  8e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  45.2 
 
 		 530 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  43.64 
 
 		 531 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  46.37 
 
 		 524 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1455  protein-export membrane protein SecD  40.26 
 
 		 622 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.202191  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  42.19 
 
 		 530 aa  319  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  45.1 
 
 		 533 aa  318  1e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  45.15 
 
 		 532 aa  316  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  42.25 
 
 		 594 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  42.25 
 
 		 594 aa  315  8e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  48.45 
 
 		 533 aa  313  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0012  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 594 aa  306  6e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.216124  hitchhiker  0.00885825 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0012  preprotein translocase subunit SecD  35 
 
 		 607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000769208  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1604  protein-export membrane protein SecD  42.13 
 
 		 399 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0444022  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1571  protein-export membrane protein SecD  37.2 
 
 		 503 aa  303  6.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  43.51 
 
 		 532 aa  301  2e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0007  preprotein translocase subunit SecD  39.72 
 
 		 595 aa  299  6e-80  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.211478 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1217  protein-export membrane protein SecD  42.86 
 
 		 457 aa  299  8e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000711082  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  43.99 
 
 		 554 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  45.05 
 
 		 534 aa  298  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  43.54 
 
 		 533 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1769  protein-export membrane protein SecD  43.26 
 
 		 512 aa  298  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  43.99 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  43.99 
 
 		 554 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0011  preprotein translocase subunit SecD  38.12 
 
 		 605 aa  296  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.019109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  43.96 
 
 		 556 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  42.67 
 
 		 533 aa  295  9e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  43.38 
 
 		 534 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  44.65 
 
 		 554 aa  293  3e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  43.54 
 
 		 533 aa  293  5e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  41.62 
 
 		 533 aa  293  6e-78  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  42.36 
 
 		 554 aa  293  7e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  44.36 
 
 		 554 aa  292  9e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  43.51 
 
 		 532 aa  291  1e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  41.88 
 
 		 532 aa  292  1e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  43.33 
 
 		 533 aa  291  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  42.14 
 
 		 526 aa  290  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  43.26 
 
 		 532 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  41.52 
 
 		 526 aa  289  7e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  40.37 
 
 		 843 aa  287  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  42.09 
 
 		 531 aa  287  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  41.71 
 
 		 535 aa  288  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  43.08 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  43.09 
 
 		 534 aa  287  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  42.67 
 
 		 535 aa  286  5.999999999999999e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  41.84 
 
 		 526 aa  285  8e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 532 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  42.49 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  41.09 
 
 		 534 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.06 
 
 		 853 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  42.93 
 
 		 533 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1116  protein-export membrane protein SecD  40 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  38.88 
 
 		 614 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  42.25 
 
 		 535 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  42.21 
 
 		 533 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.34 
 
 		 848 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  42.29 
 
 		 534 aa  282  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0033  preprotein translocase subunit SecD  37.39 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.58 
 
 		 856 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2540  protein-export membrane protein SecD  36.87 
 
 		 613 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.712905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0071  preprotein translocase subunit SecD  41.09 
 
 		 510 aa  280  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  40.87 
 
 		 531 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1621  protein-export membrane protein SecD  41.71 
 
 		 522 aa  280  4e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.58 
 
 		 623 aa  280  5e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.48 
 
 		 849 aa  279  6e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0707  preprotein translocase subunit SecD  41.34 
 
 		 521 aa  279  6e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.907979  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1425  preprotein translocase subunit SecD  39.86 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000290493  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1309  protein-export membrane protein SecD  36.42 
 
 		 613 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.198651  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0146  protein-export membrane protein SecD  40.2 
 
 		 535 aa  276  8e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00836416  hitchhiker  0.00269224 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  40.39 
 
 		 632 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0877  preprotein translocase subunit SecD  40 
 
 		 615 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.2 
 
 		 856 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  39.45 
 
 		 521 aa  273  7e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0446  preprotein translocase subunit SecD  38.5 
 
 		 615 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  39.64 
 
 		 625 aa  271  1e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2212  protein-export membrane protein SecD  39.36 
 
 		 620 aa  271  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363799  normal  0.0593357 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1410  protein-export membrane protein SecD  36.2 
 
 		 613 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.447303  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0453  preprotein translocase subunit SecD  38.5 
 
 		 615 aa  271  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3201  protein-export membrane protein SecD  39.26 
 
 		 604 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.167397  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1122  preprotein translocase subunit SecD  39.8 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.276034  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0507  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.714923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3225  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 604 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.457914  hitchhiker  0.00000220398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0447  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0466  preprotein translocase subunit SecD  39.51 
 
 		 615 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00356  protein export protein SecD  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.698554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0327  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.328268  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0488  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.16 
 
 		 839 aa  271  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00360  hypothetical protein  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.674482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0438  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0440  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0478  preprotein translocase subunit SecD  39.26 
 
 		 615 aa  270  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>