80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1172 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1172  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 372 aa  755    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.38155 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3113  transcriptional regulator  31.1 
 
 		 374 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.694615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3019  DNA-binding protein; transcriptional regulator  30.1 
 
 		 374 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.28018  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3127  DNA-binding protein  30.1 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.81107  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3347  DNA-binding protein  29.77 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3373  DNA-binding protein  30.1 
 
 		 374 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.645168  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3349  DNA-binding protein  29.77 
 
 		 374 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.166445  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3344  DNA-binding protein  29.43 
 
 		 374 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.455978  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3326  DNA-binding protein  29.43 
 
 		 374 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00900  predicted transcriptional regulator  33.07 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.506264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 374 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3051  XRE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 242 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0338218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1621  transcriptional regulator, XRE family  32.06 
 
 		 368 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 380 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2097  transcriptional regulator, XRE family  25.15 
 
 		 361 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.961796  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1982  Cro/CI family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 359 aa  76.3  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2628  transcriptional regulator, XRE family  22.52 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0359208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1053  DNA-binding protein  21.22 
 
 		 348 aa  61.2  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.101358  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  45.16 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0097  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 163 aa  58.2  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000770328  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2037  Cro/CI family transcriptional regulator  23.34 
 
 		 358 aa  58.2  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.64032  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0275  XRE family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 276 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05170  hypothetical protein  39.71 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.602534  normal  0.439559 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0162  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550867  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  46.67 
 
 		 235 aa  54.3  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 170 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 459 aa  50.4  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1967  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 268 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000016802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0064  XRE family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 266 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1621  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0031  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 211 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.60803e-35  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1627  transcriptional regulator, XRE family  27.59 
 
 		 133 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0696983 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0511  DNA-binding protein  44.26 
 
 		 210 aa  47.8  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00239636 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1286  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 197 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0709374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A15  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 204 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.659709  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0234  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00407493  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1978  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 183 aa  47.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 231 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 321 aa  47.4  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2696  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 117 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0430  transcriptional regulator, XRE family  41.54 
 
 		 69 aa  47  0.0005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1390  transcriptional regulator  36.07 
 
 		 252 aa  46.6  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.163834  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 338 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3112  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 208 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000156006  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11300  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 		 197 aa  45.4  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0844  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 		 142 aa  45.4  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0958964 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  28.74 
 
 		 258 aa  45.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06250  predicted transcriptional regulator  46.67 
 
 		 256 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  34.92 
 
 		 200 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1916  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 128 aa  45.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0812721  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0737  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 65 aa  44.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  30.65 
 
 		 137 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0150  transcriptional regulator, XRE family  37.1 
 
 		 197 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.172339  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1991  Cro/CI family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4236  hypothetical protein  27.71 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00014165  hitchhiker  0.0000000209993 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 187 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0759  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 70 aa  44.7  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2054  hypothetical protein  32.22 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000229491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2589  transcriptional regulator, XRE family  43.14 
 
 		 320 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0136414  hitchhiker  0.0041808 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2981  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 312 aa  44.7  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0006  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 186 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00549324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  27.71 
 
 		 149 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0398  XRE family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 244 aa  43.5  0.006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2733  helix-turn-helix domain-containing protein  37.31 
 
 		 115 aa  43.5  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000416248  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1922  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 128 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.243972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 206 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  27.71 
 
 		 149 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 1714 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2190  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 222 aa  43.1  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3317  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00645923  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3652  helix-turn-helix domain-containing protein  30.77 
 
 		 262 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0250948  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 		 135 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3489  XRE family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 187 aa  43.1  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  31.15 
 
 		 142 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  29.59 
 
 		 110 aa  42.7  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  27.71 
 
 		 149 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>