More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0067 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  100 
 
 		 488 aa  972    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2063  protein of unknown function DUF214  64.94 
 
 		 397 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2105  protein of unknown function DUF214  42.86 
 
 		 462 aa  326  5e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00482864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  37.92 
 
 		 386 aa  176  9e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  36.4 
 
 		 386 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  37.45 
 
 		 386 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  33.58 
 
 		 386 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  34.46 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  33.71 
 
 		 386 aa  160  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 386 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  32.85 
 
 		 386 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0916  hypothetical protein  32.2 
 
 		 385 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1372  protein of unknown function DUF214  25.72 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.669142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  32.87 
 
 		 385 aa  98.6  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  30.21 
 
 		 387 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0895  hypothetical protein  25.35 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  30.08 
 
 		 381 aa  78.6  0.0000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1822  hypothetical protein  26.64 
 
 		 408 aa  77.4  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.368625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5859  hypothetical protein  25.22 
 
 		 388 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.535317  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3549  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0269  protein of unknown function DUF214  29.17 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.36794 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0430  lipoprotein ABC transporter permease  25.34 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0396093  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0988  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 388 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3263  protein of unknown function DUF214  29.69 
 
 		 388 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2385  hypothetical protein  26.21 
 
 		 387 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00156944  normal  0.95956 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2932  hypothetical protein  26.64 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000965565  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1868  ABC efflux pump, inner membrane subunit  26.44 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1869  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.05 
 
 		 418 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0990  ABC transporter efflux protein  40 
 
 		 411 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0048907  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2056  protein of unknown function DUF214  27.23 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.339925  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2195  hypothetical protein  24.39 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2216  hypothetical protein  27.31 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1794  hypothetical protein  27.56 
 
 		 388 aa  70.1  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0173513  normal  0.533116 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1637  protein of unknown function DUF214  37.8 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1562  hypothetical protein  22.86 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00597787  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.74 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0495  hypothetical protein  26.97 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  28.1 
 
 		 409 aa  67.8  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1786  protein of unknown function DUF214  23.34 
 
 		 429 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  28.09 
 
 		 404 aa  67  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1669  hypothetical protein  34.68 
 
 		 420 aa  67  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3254  protein of unknown function DUF214  30.05 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12838  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1515  permease domain protein  23.31 
 
 		 373 aa  66.6  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000964832  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0998  protein of unknown function DUF214  27.04 
 
 		 410 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122855 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0527  ABC transport permease protein  25.33 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0117375  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0079  cell division protein FtsX  35.94 
 
 		 404 aa  66.6  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000120489  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1164  ABC transporter, permease protein  30.11 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.440199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3550  protein of unknown function DUF214  26.6 
 
 		 408 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0766  ABC transport permease protein  25.68 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0486768  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0059  hypothetical protein  24.9 
 
 		 397 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0255  hypothetical protein  29.21 
 
 		 389 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  29.45 
 
 		 404 aa  64.3  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  29.3 
 
 		 384 aa  64.7  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  27.6 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0953  hypothetical protein  26.97 
 
 		 402 aa  63.9  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  29.96 
 
 		 843 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  27.9 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2953  protein of unknown function DUF214  29.38 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1512  hypothetical protein  27.88 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.574186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2405  hypothetical protein  24.23 
 
 		 387 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0262818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0755  hypothetical protein  26.64 
 
 		 407 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.951595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1388  hypothetical protein  23.34 
 
 		 429 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3709  hypothetical protein  32.04 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.392463  normal  0.872596 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0230  protein of unknown function DUF214  27.22 
 
 		 402 aa  63.2  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.78911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0571  hypothetical protein  29.29 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40415 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 401 aa  62.8  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1474  hypothetical protein  28.1 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.56 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  34.29 
 
 		 404 aa  62.4  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.67 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0220  hypothetical protein  29.18 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0457  protein of unknown function DUF214  28.4 
 
 		 407 aa  61.6  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0854  hypothetical protein  38.02 
 
 		 410 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108176  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0228  hypothetical protein  28.79 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000368299 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.02 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.656867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1734  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.98 
 
 		 416 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00172788  normal  0.754695 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1252  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  23.84 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.888586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.42 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1814  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.98 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.109352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2201  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family protein  22.26 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.177002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2247  hypothetical protein  23.38 
 
 		 393 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2137  ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 376 aa  60.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  25.1 
 
 		 859 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  34.35 
 
 		 443 aa  60.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25 
 
 		 870 aa  60.8  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0078  hypothetical protein  27.66 
 
 		 404 aa  60.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000923125  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  29.74 
 
 		 855 aa  60.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2626  protein of unknown function DUF214  31.82 
 
 		 467 aa  60.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  26.61 
 
 		 391 aa  60.8  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  28.46 
 
 		 856 aa  60.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0817  hypothetical protein  29.77 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000337382 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1528  hypothetical protein  29.23 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.275544 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2285  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28 
 
 		 416 aa  60.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0114014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2846  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.34 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1459  hypothetical protein  26.74 
 
 		 388 aa  60.1  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.789839  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2040  hypothetical protein  24.81 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.11269  normal  0.213161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2829  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.62 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.417689  normal  0.0183937 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0903  protein of unknown function DUF214  37.19 
 
 		 416 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  29.52 
 
 		 838 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>