More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0571 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0571  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  762    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40415 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0790  putative ABC transporter permease protein  25.61 
 
 		 371 aa  105  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.119405 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1175  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.78 
 
 		 416 aa  94  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.433535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1340  ABC transporter, permease protein  26.84 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3204  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.36 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1371  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.381039  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  26.43 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2168  protein of unknown function DUF214  25.43 
 
 		 386 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1553  hypothetical protein  26.32 
 
 		 386 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.79 
 
 		 422 aa  88.6  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.998701  normal  0.300269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0049  hypothetical protein  26.29 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1564  hypothetical protein  22.17 
 
 		 397 aa  88.6  2e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1310  hypothetical protein  24.3 
 
 		 409 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2196  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.3 
 
 		 426 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00714902  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.94 
 
 		 420 aa  87.4  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3275  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.27 
 
 		 422 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0677  ABC transporter, permease protein, putative  25.7 
 
 		 387 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.297561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0918  hypothetical protein  23.17 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2598  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.54 
 
 		 426 aa  86.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258492  normal  0.437082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  29.27 
 
 		 399 aa  85.9  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3643  hypothetical protein  25.43 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  24.09 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  27.45 
 
 		 409 aa  84  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  26.92 
 
 		 409 aa  83.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3015  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.33 
 
 		 420 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4462  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 		 447 aa  83.2  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.919983  normal  0.365763 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3423  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.94 
 
 		 416 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0823  ABC transporter, permease protein  23.27 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.395922  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0971  hypothetical protein  22.25 
 
 		 397 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0827102  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0700  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.77 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4530  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.11 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.947625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0817  ABC transporter, permease protein  23.02 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2428  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.3 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507047  normal  0.0670699 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1668  hypothetical protein  23.33 
 
 		 421 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27.18 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1864  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.3 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.172929  normal  0.0361846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1796  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.56 
 
 		 439 aa  80.5  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.401704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0837  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.37 
 
 		 416 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0822431  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  24.88 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1046  lipoprotein releasing system transmembrane protein  22.28 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0938  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  22.28 
 
 		 414 aa  79.7  0.00000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3567  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  26.61 
 
 		 423 aa  80.1  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.756596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3239  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.69 
 
 		 424 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0892821  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2359  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  26.51 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0082  hypothetical protein  24.21 
 
 		 386 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0255  hypothetical protein  22.25 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  26.57 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1000  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.62 
 
 		 439 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.14096 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3748  hypothetical protein  28.57 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1041  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.94 
 
 		 427 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0901467  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4145  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.82 
 
 		 428 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2270  ABC transporter, permease protein  24.07 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0519  hypothetical protein  23.42 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00443458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1894  protein of unknown function DUF214  25.2 
 
 		 385 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1251  protein of unknown function DUF214  23.97 
 
 		 386 aa  77  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.859867  normal  0.288925 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 404 aa  76.6  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0065  hypothetical protein  27.97 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395417  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2054  protein of unknown function DUF214  24.2 
 
 		 386 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.01978e-17 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3232  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.64 
 
 		 418 aa  76.3  0.0000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.215903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4630  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.46 
 
 		 419 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  26.56 
 
 		 409 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2811  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.69 
 
 		 424 aa  75.9  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0243258  normal  0.703642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4631  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.03 
 
 		 419 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5041  putative ABC transporter, permease protein  24.82 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.78 
 
 		 417 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1372  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  23.83 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2146  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.38 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.299394  normal  0.273871 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1578  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.54 
 
 		 417 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0665062  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1065  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.74 
 
 		 439 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.123078 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1056  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.69 
 
 		 416 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.530836  normal  0.504254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1195  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.62 
 
 		 439 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1366  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  23.39 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.217764  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0960  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.45 
 
 		 416 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.100135  normal  0.0249332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  24.88 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2534  protein of unknown function DUF214  26.24 
 
 		 406 aa  74.3  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261611  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0545  protein of unknown function DUF214  25.06 
 
 		 386 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1658  hypothetical protein  22.41 
 
 		 397 aa  73.9  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  27.34 
 
 		 443 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1280  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  22.85 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0107812  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  25.37 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  24.4 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4409  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.14 
 
 		 433 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  25.37 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0320  hypothetical protein  24.14 
 
 		 395 aa  73.6  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2148  hypothetical protein  24.82 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327906 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3743  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.19 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.14534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3700  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  27.43 
 
 		 417 aa  73.6  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.8164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  26.97 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1025  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.347391 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1920  protein of unknown function DUF214  24.12 
 
 		 470 aa  73.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.911684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0940  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  24.62 
 
 		 415 aa  73.2  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  25.36 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  25.25 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2233  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  25.45 
 
 		 409 aa  72.8  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0067  hypothetical protein  29.29 
 
 		 488 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1249  putative kinase  25.19 
 
 		 417 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.95733e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  24.57 
 
 		 412 aa  72.4  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1376  hypothetical protein  28.21 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1073  hypothetical protein  26.42 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.418174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>