More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0901 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4056  hypothetical protein  58.82 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0200759  normal  0.24116 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  42.4 
 
 		 234 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  43.27 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  41.33 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  37.79 
 
 		 228 aa  125  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  42.99 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  42.52 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  41.47 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0060  ABC transporter related  44.26 
 
 		 235 aa  122  6e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.235651  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  38.27 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  35.92 
 
 		 223 aa  121  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  41.79 
 
 		 242 aa  119  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  38.92 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  40.19 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1251  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.54 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  38.42 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6019  ABC transporter related  40.32 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  39.73 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2845  ABC transporter-related protein  41.51 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  40.41 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2375  ABC-type transport system, ATPase component  41.62 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0713  ABC transporter related  35.62 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  38.65 
 
 		 228 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  40.45 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  45.76 
 
 		 213 aa  115  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.71 
 
 		 258 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.25 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0122  ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0218  ABC transporter related  35.71 
 
 		 231 aa  115  6.9999999999999995e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.489811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 		 221 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.14 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  39 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3421  ABC transporter related  35.16 
 
 		 223 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  43.08 
 
 		 231 aa  115  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  42.08 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3473  ABC transporter related protein  43.65 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  35.16 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  37.56 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0812  ABC transporter related  41.67 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3309  ABC transporter related  35.16 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  44.74 
 
 		 240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6284  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  40.11 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0257  ABC transporter related  40.72 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  40.98 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  43.46 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1677  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.89 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000705959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0868  ABC transporter related  35.78 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1084  ABC transporter related  39.01 
 
 		 255 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0833  ABC transporter related  35.81 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3507  ABC transporter related  35.81 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0856  ABC transporter related  35.78 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7376  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component-like protein  41.92 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.628473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1433  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 408 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.532362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  35.29 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  35.29 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  42.94 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0198  peptide ABC transporter ATPase  33.95 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.630395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  38.95 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  38.36 
 
 		 250 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0951  ABC transporter related  41.31 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  40.21 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 238 aa  112  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  43.02 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0086  ABC transporter related  42.86 
 
 		 231 aa  112  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0522946  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  36.36 
 
 		 235 aa  112  5e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0556  ABC transporter related  34 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  45.9 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  42.08 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1173  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 230 aa  112  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.659944  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  33.33 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0080  ABC transporter related  41.06 
 
 		 217 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  38.81 
 
 		 233 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  40.48 
 
 		 651 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  37.88 
 
 		 238 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  37 
 
 		 237 aa  111  8.000000000000001e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  35.38 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  40 
 
 		 267 aa  111  9e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1292  putative amino-acid ABC transporter ATP-binding protein YecC  40 
 
 		 250 aa  111  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000759261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0627  ABC transporter related  34.48 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 239 aa  111  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  40.89 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1395  ABC transporter related protein  39.9 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0267947  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39180  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.58 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.602292  normal  0.126496 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  39.39 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  43.37 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  40 
 
 		 254 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  36.04 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0349  ABC transporter related  37.76 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2553  ABC transporter related  38.62 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  38.97 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  37.32 
 
 		 653 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  37.44 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0368  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  35.84 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>