More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_52030 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  100 
 
 
238 aa  461  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  55.7 
 
 
230 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  54.46 
 
 
222 aa  211  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  51.54 
 
 
228 aa  209  4e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  54.39 
 
 
230 aa  207  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  52.48 
 
 
239 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  51.98 
 
 
239 aa  158  7e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  45.65 
 
 
234 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 
238 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  41.36 
 
 
251 aa  144  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  39.64 
 
 
240 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  38.5 
 
 
270 aa  132  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  32.57 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  32.57 
 
 
253 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  32.11 
 
 
253 aa  125  9e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  41.33 
 
 
241 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
253 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  38.58 
 
 
229 aa  123  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2843  ABC transporter, ATP-binding protein  34.11 
 
 
253 aa  123  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  38.58 
 
 
229 aa  123  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 
253 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  32.11 
 
 
266 aa  122  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
253 aa  121  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  38.97 
 
 
248 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  38.97 
 
 
248 aa  121  9e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  31.65 
 
 
253 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2490  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.755313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  31.19 
 
 
253 aa  119  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  36.9 
 
 
248 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
255 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  34.29 
 
 
227 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  37.81 
 
 
233 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2972  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.344281 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5251  bacitracin export ATP-binding protein BceA  33.85 
 
 
253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2355  ABC transporter, ATP-binding protein  34.76 
 
 
255 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4798  ABC transporter, ATP-binding protein  33.16 
 
 
253 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  36.27 
 
 
227 aa  119  6e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5204  bacitracin export ATP-binding protein BceA  32.72 
 
 
253 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2406  ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 
255 aa  118  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  33.51 
 
 
253 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2146  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 
255 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.278232  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2196  ABC transporter related  34.76 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111069  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  40.38 
 
 
213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0747  ABC transporter related  36.89 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  38.58 
 
 
252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  34.72 
 
 
256 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1015  ABC transporter related  38.86 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.5301  normal  0.120325 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  33.85 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  36.7 
 
 
229 aa  115  5e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4056  hypothetical protein  43.48 
 
 
244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0200759  normal  0.24116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1777  ABC transporter related  40.28 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  41.08 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2618  ABC transporter  37.23 
 
 
653 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.094569  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  40.54 
 
 
237 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1534  ABC transporter related  37.98 
 
 
217 aa  113  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.598778  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.5 
 
 
240 aa  113  3e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0291  ABC transporter-related protein  34.72 
 
 
339 aa  112  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2659  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
256 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00013766  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5154  ABC transporter related  38.14 
 
 
238 aa  112  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.792432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  35.29 
 
 
226 aa  112  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  42.39 
 
 
215 aa  112  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  36.94 
 
 
229 aa  111  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.06 
 
 
236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2621  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
256 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.012082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2297  ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0385  ABC transporter ATP-binding protein  38.54 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2383  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0355575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2349  ABC transporter, ATP-binding protein  34.12 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0800376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  38.34 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3314  ABC transporter related protein  36.98 
 
 
643 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1920  ABC transporter related  36.94 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5470  ABC transporter related  40.28 
 
 
231 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0589089  normal  0.059102 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  33.49 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  40.87 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  33.16 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2575  ABC transporter, ATP-binding protein  33.65 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0244  ABC transporter related  37.31 
 
 
369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177795  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2748  ABC transporter, ATP-binding protein  35.29 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.403092  hitchhiker  0.000000938072 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2531  ABC transporter related  34.12 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00457441  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3953  ABC transporter-related protein  39.13 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.245664 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0425  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.77 
 
 
236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  37.57 
 
 
240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0943  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.12 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  38.33 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0723  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 
225 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000098011  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  40.64 
 
 
228 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  31.09 
 
 
225 aa  109  3e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0473  ABC transporter related  34.62 
 
 
238 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0685  ABC transporter, ATPase protein  41.15 
 
 
235 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.360664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.85 
 
 
233 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5200  putative ABC transporter, ATP binding component  39.5 
 
 
238 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0864003  normal  0.0646011 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4992  ABC transporter related  37.31 
 
 
369 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  32.08 
 
 
237 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>