More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3150 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  47.72 
 
 		 251 aa  161  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  44.19 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  39.64 
 
 		 238 aa  138  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 222 aa  138  8.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  40 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1154  ABC transporter related  45.03 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.496221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  43.87 
 
 		 234 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  43.56 
 
 		 239 aa  133  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3214  ABC transporter related  43.65 
 
 		 214 aa  131  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  37.73 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  41.84 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  42.57 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0555  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.55 
 
 		 228 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04661  ABC transporter ATP-binding protein  41.51 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0165379  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1293  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186144  normal  0.521274 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  38.71 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  37.44 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  36.63 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0892  ABC transporter related  40.09 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.783252 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0553  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.09 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3112  ABC transporter related  43.17 
 
 		 225 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.522677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0560  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.09 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0570  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.09 
 
 		 228 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.661781 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1385  ABC transporter related  43.98 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00534091  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2241  ABC transporter related  41.67 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0103221  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3469  ABC transporter related  42.25 
 
 		 216 aa  126  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.297333  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  37.88 
 
 		 223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4396  ABC transporter related  41.85 
 
 		 255 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.758539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  39.5 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  40.91 
 
 		 230 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  38.1 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3201  ABC transporter-related protein  41.03 
 
 		 221 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3413  ABC transporter related  42 
 
 		 237 aa  125  8.000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.363302  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1718  ABC transporter ATP-binding protein  42.78 
 
 		 236 aa  124  9e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.324708 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0614  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  38.74 
 
 		 228 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27150  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 227 aa  124  9e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.358472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  36.98 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1862  ABC transporter related  41.97 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203223 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  38.97 
 
 		 243 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3735  ABC transporter related  43.43 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1509  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein, putative  35.71 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000891306  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  34.93 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  41.3 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  38.8 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1529  ABC transporter related  41.97 
 
 		 236 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.787332  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  43.01 
 
 		 237 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.8 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  36 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2458  ABC transporter related  42.55 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2955  ABC transporter, ATP-binding protein  39.72 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3627  ABC transporter related  42.62 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1291  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein LolD  33.66 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.286185 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  39.8 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  42.93 
 
 		 233 aa  123  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  40.74 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0286  ABC transporter ATP-binding protein  35.78 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.441396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1123  ABC transporter related  37.56 
 
 		 243 aa  123  3e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0137163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2958  ABC transporter ATP-binding protein  38.05 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0717892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  41.62 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  42.33 
 
 		 287 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4034  ABC transporter related  41.98 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.530357  normal  0.188181 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  40 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  41.62 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1045  ABC transporter related  38.99 
 
 		 239 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2317  ABC transporter ATP-binding protein  44.02 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0467206  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2156  ABC transporter related  42.23 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.506853  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  37.63 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2035  ABC transporter, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 219 aa  122  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.522762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  41.18 
 
 		 245 aa  122  5e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1604  ABC transporter related  41.62 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1563  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000128837  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  41.97 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0857  ABC transporter, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  34.52 
 
 		 224 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3231  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.42 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.15277  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1759  ABC transporter related  42.93 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0432501  hitchhiker  0.0000000000939298 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  39.89 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1902  ABC transporter-related protein  41.27 
 
 		 233 aa  122  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0919196 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3255  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41 
 
 		 318 aa  122  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3452  ABC transporter related  42.93 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0356163  hitchhiker  0.0000197884 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  40.76 
 
 		 271 aa  121  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4028  ABC transporter related  43.78 
 
 		 228 aa  121  9e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1514  ABC transporter related  39.89 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00446  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3115  ABC transporter related protein  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3192  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 243 aa  121  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110755  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  39.36 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0430  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.811195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0731  ATPase  38.95 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1919  ABC transporter related  42.39 
 
 		 227 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000203037  hitchhiker  0.000000000000141091 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2425  ABC transporter related  44.27 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1015  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0629404 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0599  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.962067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0544  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  39.61 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>