More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2875 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  86.52 
 
 		 230 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  54.59 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  51.57 
 
 		 222 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  54.39 
 
 		 238 aa  222  4e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  46.03 
 
 		 251 aa  166  2e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  45.37 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  45.83 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  45.37 
 
 		 239 aa  142  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  43.5 
 
 		 240 aa  131  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1317  ABC transporter related  38.03 
 
 		 270 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  39.23 
 
 		 230 aa  124  9e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1663  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 219 aa  123  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.557172 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  36.84 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.22 
 
 		 642 aa  123  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1755  ABC transporter related  33.65 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0195851  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  37.32 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  37.32 
 
 		 263 aa  122  5e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 253 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  36.71 
 
 		 228 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4659  ABC transporter related  36.95 
 
 		 253 aa  122  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  38.62 
 
 		 223 aa  121  7e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  38.16 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0653  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  37.8 
 
 		 246 aa  121  9e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  36.36 
 
 		 241 aa  121  9e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  37.32 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042866 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  38.05 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0889  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.488331  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0708  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0961  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0694  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  40.38 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0798  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0893  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.34457e-37 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0851  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  40.85 
 
 		 213 aa  119  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  38.16 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  37.82 
 
 		 243 aa  119  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3107  ABC transporter related  37.84 
 
 		 224 aa  120  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000083288  normal  0.565906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  37.32 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  37.32 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  37.32 
 
 		 246 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  36.84 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  36.84 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  36.84 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  36.84 
 
 		 246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  36.84 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  36.84 
 
 		 253 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0709  ABC transporter related  35.24 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0759  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 		 224 aa  118  6e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  35.89 
 
 		 240 aa  118  6e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4576  ABC transporter related  35.96 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  40.22 
 
 		 277 aa  118  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0380  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2310  ABC transporter related  36.14 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00369124  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  35.48 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3418  ABC transporter-related protein  35.96 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0483067  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3868  ABC transporter related  39 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2023  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1004  ABC transporter, ATP-binding protein  34.62 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  39.15 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  39.01 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2018  ABC transporter related  36.84 
 
 		 238 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40.66 
 
 		 228 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4881  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  34.43 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  40.11 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4643  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  41.11 
 
 		 224 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4867  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4496  ABC transporter, ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1167  ABC transporter related  37.43 
 
 		 235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3131  ABC transporter ATPase  38.5 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4997  ABC transporter ATP-binding protein  35.96 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3612  ABC transporter related  37.8 
 
 		 231 aa  116  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6611  ABC transporter related  43.55 
 
 		 660 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.961968 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  39.04 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  39.58 
 
 		 237 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0191  ABC transporter related  37.02 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00111007  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  36.87 
 
 		 240 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4888  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2162  ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 255 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.754182  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  32.85 
 
 		 226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  38.54 
 
 		 642 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  38.33 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  36.96 
 
 		 251 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4857  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 		 253 aa  115  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2420  ABC transporter, ATP-binding protein  37.57 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.658909  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  40.56 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.74 
 
 		 652 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1694  peptide ABC transporter ATPase  37.02 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000011753  unclonable  4.03836e-28 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1284  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 		 231 aa  115  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000136369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  36.71 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  33.96 
 
 		 223 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>