More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4056 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4056  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0200759  normal  0.24116 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0901  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.69974  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52030  ATP binding component of ABC transporter  43.48 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.90584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2312  ABC transporter related  43.84 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  hitchhiker  0.0000468431 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  46.7 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1841  ABC transporter, ATP-binding protein  45.58 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.551478  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00860  putative ATP-binding component of ABC transporter  47.47 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000878092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  40.87 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0144  ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.47583  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4410  ABC transporter related  40.89 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.567617  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3782  ABC transporter related  42.18 
 
 		 654 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.972642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  41.18 
 
 		 230 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4146  ABC transporter related  41.33 
 
 		 234 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  38.27 
 
 		 225 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  40.61 
 
 		 222 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3220  ABC transporter related  46.24 
 
 		 213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  40.18 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  36.92 
 
 		 233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60790  ABC transporter ATP-binding protein  44.17 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  41.26 
 
 		 654 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  41.51 
 
 		 671 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  35.63 
 
 		 647 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  40.55 
 
 		 663 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  37.82 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5234  ABC transporter ATP-binding protein  44.09 
 
 		 237 aa  123  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  38.02 
 
 		 231 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  39.62 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  41.26 
 
 		 654 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  31.76 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  36.11 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  40.09 
 
 		 663 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2114  ABC efflux transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  39.91 
 
 		 247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  37.84 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1377  ABC transporter related  42.71 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0531793  normal  0.0760119 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  45.03 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3750  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  34.68 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1234  ABC transporter-like  36.25 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0135817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.68 
 
 		 646 aa  119  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3799  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  34.68 
 
 		 237 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  40.76 
 
 		 652 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1852  ABC transporter, ATP-binding protein  30.74 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000122663  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0599  ABC transporter-like  37.95 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  43.26 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0697  ABC transporter related  38.89 
 
 		 232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  40.09 
 
 		 226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3588  ABC transporter-like  38.31 
 
 		 244 aa  119  6e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0246542 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2215  hypothetical protein  36.44 
 
 		 651 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000167589  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3304  translation initiation factor IF-2  43.33 
 
 		 221 aa  119  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.431816 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  38.46 
 
 		 654 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  39.35 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2832  syringolide efflux protein SyfD  36.67 
 
 		 668 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237626  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2195  ABC transporter related  36.97 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0336091  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5296  ABC transporter related  38.25 
 
 		 217 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1867  ABC transporter related  38.53 
 
 		 655 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2435  ABC transporter related  36.44 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  38.19 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  37.73 
 
 		 648 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  37.26 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.25 
 
 		 649 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  37.6 
 
 		 653 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.25 
 
 		 649 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3253  ABC transporter-related protein  40.91 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3158  ABC transporter related protein  43.72 
 
 		 213 aa  118  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.722977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0090  DevA family ABC exporter ATP-binding subunit  35.32 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3170  ABC transporter related  36.59 
 
 		 647 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04060  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.15 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0552358 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2810  ABC transporter related  39.91 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0257216  normal  0.633294 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2729  ABC exporter ATP-binding subunit, DevA family  35.48 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6202  macrolide ABC transporter ATP-binding/membrane protein  37.93 
 
 		 654 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.486155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1863  ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0577867  normal  0.0321889 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  37.74 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  39.82 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 234 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  43.32 
 
 		 225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  41.01 
 
 		 657 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4354  ABC transporter related  35.68 
 
 		 230 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4480  ABC transporter related  36.44 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.859777  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  36.63 
 
 		 652 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  40.81 
 
 		 656 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3638  ABC transporter-like  35.29 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1251  ABC transporter related  40 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.799033  normal  0.890973 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1616  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2619  ABC transporter related  38.67 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.512871  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  40.09 
 
 		 661 aa  115  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  40.7 
 
 		 230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  36.32 
 
 		 260 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0826  ABC transporter related  34.18 
 
 		 682 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.018784  hitchhiker  0.00000000432999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1769  ABC transporter related  41.71 
 
 		 247 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.78 
 
 		 239 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01135  ABC transporter, ATP-binding protein  35.38 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  36.87 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2039  ABC transporter related  39.29 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  37.97 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  35.43 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  33.19 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  37.67 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  35.55 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>