70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2014 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  100 
 
 		 994 aa  2014    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  28.9 
 
 		 1011 aa  182  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  23.47 
 
 		 1706 aa  129  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  23.31 
 
 		 736 aa  126  2e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  62.1 
 
 		 2031 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0410  hypothetical protein  22.43 
 
 		 1294 aa  87.8  9e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  45.1 
 
 		 833 aa  72.8  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  45.36 
 
 		 746 aa  73.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.72 
 
 		 1750 aa  70.5  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  25.59 
 
 		 882 aa  69.7  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1017 aa  69.7  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  26.34 
 
 		 884 aa  67.4  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 1011 aa  64.3  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  37.8 
 
 		 950 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  42.27 
 
 		 1987 aa  62.4  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  41.49 
 
 		 1258 aa  61.2  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  40 
 
 		 972 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1648  hypothetical protein  23.68 
 
 		 865 aa  60.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  42.22 
 
 		 848 aa  60.1  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  44.79 
 
 		 460 aa  59.7  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  39.39 
 
 		 1418 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  44.09 
 
 		 826 aa  57.4  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  41.41 
 
 		 1771 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  41.49 
 
 		 1265 aa  57  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  40.74 
 
 		 3278 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.61 
 
 		 1217 aa  55.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  38.1 
 
 		 1311 aa  55.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  43.33 
 
 		 855 aa  55.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  35.23 
 
 		 994 aa  55.1  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.78 
 
 		 1293 aa  55.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  35.61 
 
 		 2706 aa  55.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1690  protease domain-containing protein  34.34 
 
 		 1300 aa  54.7  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.983324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  43.59 
 
 		 848 aa  54.3  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1915  serine protease  35.35 
 
 		 1300 aa  53.9  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  37 
 
 		 1393 aa  53.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  36.73 
 
 		 1393 aa  52.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1134 aa  52.4  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  28.76 
 
 		 14609 aa  52  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  34.07 
 
 		 1098 aa  52  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  42.86 
 
 		 528 aa  51.2  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1208 aa  51.2  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 		 1212 aa  51.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  24.44 
 
 		 1347 aa  50.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  45.83 
 
 		 665 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1316 aa  49.7  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  44.79 
 
 		 665 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  31.25 
 
 		 882 aa  49.3  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  37.11 
 
 		 1022 aa  48.9  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  33.64 
 
 		 985 aa  48.5  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  36.57 
 
 		 1487 aa  48.5  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.38 
 
 		 863 aa  48.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  38.71 
 
 		 635 aa  48.1  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5949  hypothetical protein  22 
 
 		 1152 aa  47.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  37.11 
 
 		 1004 aa  47.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  40.24 
 
 		 1376 aa  47.4  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  36.08 
 
 		 611 aa  47.8  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1182  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1125 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.3 
 
 		 913 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  29.25 
 
 		 1110 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  39.02 
 
 		 286 aa  46.2  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  36.45 
 
 		 1188 aa  46.2  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  40.24 
 
 		 635 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  35.96 
 
 		 869 aa  45.8  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  34.78 
 
 		 1107 aa  45.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  42.5 
 
 		 706 aa  45.1  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  28.57 
 
 		 911 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  38.68 
 
 		 820 aa  44.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  34.02 
 
 		 1084 aa  44.7  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  31.29 
 
 		 1831 aa  44.3  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  34.74 
 
 		 868 aa  44.7  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>