16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2024 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  84.87 
 
 
736 aa  1167    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_002950  PG1837  hemagglutinin protein HagA  66.93 
 
 
2105 aa  1087    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  100 
 
 
1706 aa  3534    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_002950  PG1326  hemagglutinin, putative  53.21 
 
 
352 aa  213  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0411  hemagglutinin, putative  47.06 
 
 
925 aa  137  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  23.47 
 
 
994 aa  124  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  24.4 
 
 
1017 aa  67.4  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0026  hypothetical protein  23.99 
 
 
1123 aa  64.7  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  21.77 
 
 
1011 aa  63.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4007  hypothetical protein  23.22 
 
 
1134 aa  61.2  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.842426  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  22.08 
 
 
884 aa  60.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  20.6 
 
 
882 aa  55.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0410  hypothetical protein  21.77 
 
 
1294 aa  50.8  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4246  hypothetical protein  21.16 
 
 
1110 aa  50.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0953  hypothetical protein  21.4 
 
 
1347 aa  45.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0182  hypothetical protein  22.38 
 
 
1440 aa  45.4  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>