More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2593 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2593  NLP/P60 protein  100 
 
 
476 aa  961    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  44.29 
 
 
482 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1137  Peptidase M23  44.78 
 
 
468 aa  289  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3043  NLP/P60 protein  64 
 
 
274 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.166608  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2940  NLP/P60 protein  51.47 
 
 
265 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000104581  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2432  NLP/P60 protein  57.02 
 
 
391 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2422  peptidase M23B  30.08 
 
 
475 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000638116  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  29.94 
 
 
452 aa  144  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0896  NLP/P60 protein  42.86 
 
 
342 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000013444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3365  NLP/P60 protein  42.21 
 
 
342 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  41.56 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2104  NLP/P60  48.51 
 
 
217 aa  127  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.178668  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2736  NLP/P60 protein  45.27 
 
 
307 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3056  NLP/P60 protein  31.12 
 
 
347 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000688808  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0173  NlpC/P60 family protein  40.71 
 
 
458 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000388548  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3368  NLP/P60 protein  50.45 
 
 
246 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.776928  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1368  NLP/P60 protein  39.61 
 
 
346 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00025517  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  38.1 
 
 
342 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2639  NLP/P60 protein  49.55 
 
 
349 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1679  NLP/P60 protein  42.21 
 
 
210 aa  121  3e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0878  NLP/P60 protein  46.67 
 
 
246 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112829 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2520  NLP/P60 family protein  49.61 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.509627  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2149  NLP/P60 protein  49.61 
 
 
365 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000521128  hitchhiker  0.000892281 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0433  NLP/P60 protein  51.67 
 
 
245 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.895953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  46.09 
 
 
285 aa  118  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1787  NLP/P60 protein  41.72 
 
 
278 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2041  NLP/P60 protein  40 
 
 
284 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000350881  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  31.94 
 
 
298 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2151  NLP/P60 protein  46.32 
 
 
424 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000325506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0828  NLP/P60 protein  45.95 
 
 
240 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000898283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2277  NLP/P60 family lipoprotein  36.81 
 
 
267 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1003  NLP/P60 protein  39.86 
 
 
269 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3257  NLP/P60 protein  39.16 
 
 
269 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3253  NLP/P60 protein  43.26 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000111899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2291  NLP/P60 protein  47.11 
 
 
242 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2789  NLP/P60 family protein  48.36 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.142626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2365  NLP/P60:sporulation-related protein  34.64 
 
 
266 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4127  NLP/P60 protein  51.28 
 
 
532 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1279  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
150 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2519  cell wall-associated hydrolase-like protein  46.28 
 
 
225 aa  110  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0605  PgdS peptidase. cysteine peptidase. MEROPS family C40  47.55 
 
 
370 aa  110  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000243263  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3172  NLP/P60 protein  43.75 
 
 
335 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0396  NLP/P60 protein  42.64 
 
 
150 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1247  putative cell-wall associated endopeptidase  42.5 
 
 
257 aa  109  8.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2585  NLP/P60 protein  46.15 
 
 
183 aa  109  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.364054  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1664  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
192 aa  109  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0388  NLP/P60  43.75 
 
 
170 aa  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.815605  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2667  peptidace C40 NLP/P60  46.22 
 
 
187 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.411217  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2830  NLP/P60 protein  45.3 
 
 
220 aa  109  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.704353  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2091  NLP/P60 protein  46.22 
 
 
192 aa  109  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.315099  normal  0.543667 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2142  NLP/P60  43.51 
 
 
226 aa  108  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0634754  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33170  NLP/P60 family lipoprotein  42.66 
 
 
173 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0857869  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  38.89 
 
 
232 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2125  NLP/P60  42.55 
 
 
228 aa  108  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.839892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1215  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
532 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48800  hypothetical protein  45.97 
 
 
205 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.040428  hitchhiker  0.0000000044472 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3121  NLP/P60 protein  44.17 
 
 
333 aa  108  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3286  NLP/P60 protein  46.55 
 
 
450 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1936  NLP/P60 protein  43.55 
 
 
333 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.782262  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1388  NLP/P60  50.44 
 
 
303 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297937  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1787  NLP/P60 protein  42.75 
 
 
202 aa  107  5e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0258261 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3133  NLP/P60 protein  48.72 
 
 
454 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000296935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1132  NLP/P60 protein  46.34 
 
 
556 aa  107  6e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000155845  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2283  cell wall-associated hydrolase (invasion-associated proteins)  41.13 
 
 
222 aa  106  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2739  NLP/P60 protein  41.27 
 
 
216 aa  106  9e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.232039  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4180  hypothetical protein  45.97 
 
 
193 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000520752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0274  SagA protein  50 
 
 
432 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2100  NLP/P60  44.54 
 
 
201 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.995227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0577  NLP/P60 protein  41.46 
 
 
242 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0265  NlpC/P60 family protein  50 
 
 
432 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.894472  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2017  NLP/P60 protein  45.3 
 
 
536 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.474847  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3968  NLP/P60 protein  44.54 
 
 
211 aa  104  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.12193  normal  0.0821241 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1218  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
224 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00850028  normal  0.283839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3070  NLP/P60 protein  41.09 
 
 
306 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00281193  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1018  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
215 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.121174  normal  0.0409551 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1112  NLP/P60 protein  47.01 
 
 
215 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.893499 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10740  cell wall-associated hydrolase, invasion-associated protein  48.25 
 
 
332 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2321  NLP/P60 protein  48.6 
 
 
266 aa  104  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1008  cell wall-associated hydrolase  48.08 
 
 
197 aa  104  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000147737  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1250  NLP/P60 protein  42.48 
 
 
248 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000552171  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0435  NLP/P60 protein  40.65 
 
 
232 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1637  NLP/P60  41.32 
 
 
226 aa  103  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.58461  normal  0.048116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3648  NLP/P60 protein  42.31 
 
 
391 aa  103  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2658  NLP/P60 family protein  43.7 
 
 
333 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.209758  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1371  cell wall-associated hydrolase/invasion-associated protein  44.92 
 
 
273 aa  103  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2849  NLP/P60 family protein  43.7 
 
 
333 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2609  cell wall-associated hydrolase  43.22 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.652367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2577  cell wall-associated hydrolase  43.22 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.164117  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1654  hypothetical protein  40.43 
 
 
177 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2205  peptidase M23B  28.29 
 
 
450 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000218447  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2855  NLP/P60 family protein  43.22 
 
 
333 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2431  putative outer membrane lipoprotein  42.37 
 
 
191 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2862  NLP/P60 family protein  40 
 
 
333 aa  101  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2077  NLP/P60 protein  46.9 
 
 
223 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.010952  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5367  NLP/P60 family protein  46.02 
 
 
224 aa  102  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174254  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1554  NLP/P60  42.86 
 
 
208 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.68889  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2472  peptidase M23B  26.46 
 
 
446 aa  102  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000997494  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2090  NLP/P60 protein  46.02 
 
 
223 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0226051  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2058  NLP/P60 protein  46.9 
 
 
223 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000524971  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2195  NLP/P60 protein  49.53 
 
 
168 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>