187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4392 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4392  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 240 aa  492  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000433749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5729  Lipoprotein signal peptidase-like protein  59.53 
 
 		 261 aa  300  2e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3677  signal peptidase II  51.24 
 
 		 205 aa  188  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.273504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0018  lipoprotein signal peptidase  43.81 
 
 		 236 aa  188  5.999999999999999e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0234  Lipoprotein signal peptidase-like protein  39.8 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.290036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02475  putative signal peptidase  39.79 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0248092  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0418  peptidase A8 signal peptidase II  39.59 
 
 		 200 aa  139  4.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.216588 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0700  lipoprotein signal peptidase  40.31 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  42.86 
 
 		 193 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1598  lipoprotein signal peptidase  37.27 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.698067 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2030  lipoprotein signal peptidase  35.36 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1655  lipoprotein signal peptidase  29.95 
 
 		 164 aa  73.9  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.583994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2067  lipoprotein signal peptidase  31.41 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1798  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 		 168 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.226903  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0707  lipoprotein signal peptidase  27.04 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0482  lipoprotein signal peptidase  27.55 
 
 		 167 aa  68.6  0.00000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1775  lipoprotein signal peptidase  30.11 
 
 		 159 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  30.21 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  23.28 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0013  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0013  lipoprotein signal peptidase  30.97 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  30.05 
 
 		 180 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  28.18 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  28.41 
 
 		 212 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  31.37 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  26.7 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  29.06 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09320  lipoprotein signal peptidase  27.84 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00061275  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0948  lipoprotein signal peptidase  26.59 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2717  lipoprotein signal peptidase  24.69 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.702732 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1346  lipoprotein signal peptidase  24.19 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  32.04 
 
 		 166 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0014  lipoprotein signal peptidase  27.66 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  29.55 
 
 		 161 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  29.15 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  27.22 
 
 		 164 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  26.03 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  28.04 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1234  lipoprotein signal peptidase  31.22 
 
 		 170 aa  53.1  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  27.12 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  29.83 
 
 		 167 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  30.05 
 
 		 173 aa  53.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  30.58 
 
 		 174 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 172 aa  52.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  29.31 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1093  lipoprotein signal peptidase  29.94 
 
 		 153 aa  52  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  29.73 
 
 		 160 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0013  lipoprotein signal peptidase  30.34 
 
 		 206 aa  52  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  25.51 
 
 		 169 aa  52  0.000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  32.28 
 
 		 238 aa  52  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  30 
 
 		 172 aa  52  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  29.17 
 
 		 170 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  28.09 
 
 		 159 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  31.11 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  29.02 
 
 		 149 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  32.02 
 
 		 149 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  32.12 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2967  lipoprotein signal peptidase  29.28 
 
 		 160 aa  50.8  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0888295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4493  lipoprotein signal peptidase  24.64 
 
 		 180 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  24.89 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  29.9 
 
 		 171 aa  50.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1822  lipoprotein signal peptidase  30.3 
 
 		 144 aa  50.1  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  28.19 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  26.4 
 
 		 161 aa  50.1  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  28.11 
 
 		 162 aa  50.4  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 		 163 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2249  lipoprotein signal peptidase  30.05 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.464022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5845  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 		 166 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.469794  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4181  lipoprotein signal peptidase  26.98 
 
 		 165 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.797741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  25 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0196  lipoprotein signal peptidase  30.9 
 
 		 170 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0222  lipoprotein signal peptidase  30.9 
 
 		 170 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  27.36 
 
 		 164 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  29.38 
 
 		 170 aa  48.5  0.00009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  29.67 
 
 		 182 aa  48.5  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  30.16 
 
 		 154 aa  48.5  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1060  signal peptidase II  29.31 
 
 		 146 aa  48.1  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3850  lipoprotein signal peptidase  30.36 
 
 		 164 aa  47.8  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.777675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1323  lipoprotein signal peptidase  32.22 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  28.88 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  32.18 
 
 		 166 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  32.48 
 
 		 170 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0281  lipoprotein signal peptidase  27.22 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0645052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2357  lipoprotein signal peptidase  25.81 
 
 		 174 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0614763  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3473  lipoprotein signal peptidase  30.9 
 
 		 170 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.911066  normal  0.126226 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1671  lipoprotein signal peptidase  28.57 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  28.49 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_002978  WD0760  lipoprotein signal peptidase  27.27 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.473173  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  28.41 
 
 		 162 aa  47.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  26.15 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  27 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  26.4 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2818  signal peptidase II  29.53 
 
 		 160 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  28.18 
 
 		 169 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  32.18 
 
 		 166 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  29.02 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  31.28 
 
 		 166 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>