More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0035 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_0035  ABC transporter related  100 
 
 		 278 aa  570  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3040  ABC transporter related  61.63 
 
 		 261 aa  328  8e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.874651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1463  ABC transporter related  60.15 
 
 		 265 aa  324  8.000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6033  putative ABC transporter, ATP-binding protein  60.71 
 
 		 261 aa  323  3e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1371  ABC transporter related  61.07 
 
 		 333 aa  322  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.138832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3295  ABC transporter related  60.39 
 
 		 258 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0815311 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1815  ABC transporter related  61.81 
 
 		 266 aa  321  7e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463697  normal  0.452124 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1496  ABC transporter related  60.96 
 
 		 255 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.409922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3458  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (nitrate)  55.04 
 
 		 263 aa  309  2.9999999999999997e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2369  ABC transporter related  58.5 
 
 		 263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0194302  normal  0.406873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0346  ABC transporter related  56.69 
 
 		 278 aa  305  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2703  ABC transporter related  59.59 
 
 		 272 aa  305  6e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.244414 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2044  ABC transporter related  57.09 
 
 		 262 aa  304  9.000000000000001e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.471854  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1081  ABC transporter related  58.66 
 
 		 289 aa  301  5.000000000000001e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0182261 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2052  ABC transporter related  59.84 
 
 		 284 aa  299  4e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.405737 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3453  ABC transporter component  58.87 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1733  ABC transporter related  59.44 
 
 		 284 aa  296  4e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2104  ABC transporter related protein  56.18 
 
 		 268 aa  276  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1885  ABC transporter-like protein  56.18 
 
 		 274 aa  269  4e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152883 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2984  ABC transporter related  49.58 
 
 		 271 aa  244  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0771  ABC transporter related  48.79 
 
 		 271 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1860  ABC transporter related  47.54 
 
 		 259 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.188134  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1435  ABC transporter related protein  52.54 
 
 		 291 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.597503  normal  0.846861 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0618  ABC transporter related  48.73 
 
 		 259 aa  234  1.0000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4579  ABC transporter related  47.79 
 
 		 262 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3507  ABC transporter related  48.19 
 
 		 261 aa  233  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0770339  normal  0.17835 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7628  ABC transporter ATP-binding protein  52.52 
 
 		 281 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.494067  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3092  ABC transporter related  45.71 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.935227  normal  0.896647 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3418  ABC transporter related  46.51 
 
 		 284 aa  231  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.647429  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3119  ABC transporter related  49.02 
 
 		 267 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3034  ABC transporter related  45.38 
 
 		 265 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.971108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0087  ABC transporter related  50.64 
 
 		 263 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0028  ABC transporter related  46.59 
 
 		 273 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3811  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3100  ABC transporter related  50 
 
 		 276 aa  223  3e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3754  ABC transporter related  49.57 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44540  ABC transporter  47.43 
 
 		 288 aa  223  3e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1168  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.52 
 
 		 275 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2575  ABC transporter related  47.06 
 
 		 282 aa  222  4e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1303  ABC transporter related  47.9 
 
 		 299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419819  normal  0.779102 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2796  ABC transporter related protein  46.53 
 
 		 276 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5690  ABC transporter related  49.78 
 
 		 246 aa  218  7.999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0991  ABC transporter related  43.78 
 
 		 258 aa  216  2e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.671415  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0849  ABC transporter-related protein  47.18 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0140067  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4270  ABC transporter related  48.72 
 
 		 257 aa  216  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.74821  normal  0.0108203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0513  ABC transporter related  46.19 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2760  ABC transporter related protein  50.42 
 
 		 278 aa  215  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.398097  normal  0.0252415 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6282  ABC transporter related  45.85 
 
 		 266 aa  214  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24170  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system, ATPase component  54.19 
 
 		 330 aa  214  9e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.505798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3870  ABC transporter related  46.25 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0218  ABC transporter related  49.11 
 
 		 251 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1264  ABC transporter ATP-binding protein  48.73 
 
 		 284 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2133  ABC nitrate/sulfonate/bicarbonate transporter, ATPase subunit  47.86 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1308  ABC transporter related  47.23 
 
 		 252 aa  213  2.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3130  ABC transporter related  47.83 
 
 		 278 aa  213  2.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3551  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.41 
 
 		 324 aa  213  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3879  ABC transporter related  49.15 
 
 		 258 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.898001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0378  hypothetical protein  44.79 
 
 		 260 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0392  ABC transporter related  46.06 
 
 		 254 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.238571  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2978  ABC transporter related  48.28 
 
 		 255 aa  212  5.999999999999999e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3211  ABC transporter, ATP-binding protein  45.49 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1475  ABC transporter related  46.98 
 
 		 254 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5006  ABC transporter related  45.93 
 
 		 257 aa  211  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4664  ABC transporter related  42.15 
 
 		 274 aa  210  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.456657 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2434  ABC transporter related protein  49.57 
 
 		 276 aa  210  2e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0618237 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4503  ABC transporter related protein  48.18 
 
 		 267 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0445  ABC transporter related  46.55 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0327  ABC transporter related  43.45 
 
 		 264 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1677  ABC transporter related  43.25 
 
 		 274 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.012686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3180  ABC transporter related  43.37 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.219824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8276  ABC-type transporter, ATP-binding protein  47.11 
 
 		 264 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2866  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 299 aa  207  1e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4759  ABC transporter related  46.61 
 
 		 276 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.328175  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2544  ABC transporter  44.53 
 
 		 269 aa  208  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.569384  normal  0.531117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0435  ABC transporter related  44.03 
 
 		 256 aa  207  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.30818  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2589  ABC transporter related  45.06 
 
 		 284 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.40805 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0800  nitrate/sulfonate/bicarbonate ABC transporter ATPase  47.6 
 
 		 276 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.872437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0621  ABC transporter related  46.81 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6457  ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 		 261 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1472  ABC transporter related  46.32 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2099  ABC transporter related  47.68 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1801  ABC transporter related protein  43.19 
 
 		 267 aa  206  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3751  ABC transporter, ATPase subunit  41.83 
 
 		 271 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1163  ABC transporter related  46.58 
 
 		 257 aa  206  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.119429 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0259  ABC transporter related  46.92 
 
 		 270 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.511865 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1505  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport system ATPase component  44.88 
 
 		 262 aa  205  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0234474  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2954  ABC transporter related  45.45 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0571  ABC transporter related  45.14 
 
 		 267 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.260264  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0580  ABC transporter related  45.45 
 
 		 265 aa  205  7e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.860273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0470  ABC transporter related  44.88 
 
 		 276 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7165  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  44.36 
 
 		 263 aa  205  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1900  ABC transporter related  43.37 
 
 		 269 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1403  ABC transporter related  42.64 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0332  ABC transporter, ATPase subunit  47.88 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5145  ABC transporter related  43.37 
 
 		 267 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537076  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0735  ABC transporter related  47.89 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0415182  normal  0.371016 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0670  ABC transporter related protein  44.68 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  49.34 
 
 		 246 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2804  ABC transporter related protein  46.49 
 
 		 256 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00228299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4886  ABC transporter related  47.41 
 
 		 297 aa  203  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>