More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4894 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4894  porin  100 
 
 		 361 aa  725    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  47.66 
 
 		 366 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  47.66 
 
 		 366 aa  329  6e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  36.26 
 
 		 357 aa  216  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  38.74 
 
 		 357 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0172  OmpC family outer membrane porin  37.91 
 
 		 357 aa  210  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  38 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  38 
 
 		 362 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  38 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  38 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  38 
 
 		 383 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  38 
 
 		 432 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  35.16 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  35.16 
 
 		 359 aa  202  7e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  35.16 
 
 		 359 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  35.71 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  36.31 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1303  outer membrane porin  37.75 
 
 		 362 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  35.44 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4632  porin Gram-negative type  36.74 
 
 		 368 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.656997 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  37.64 
 
 		 496 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  34.89 
 
 		 359 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  36.81 
 
 		 357 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  34.7 
 
 		 382 aa  194  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  34.26 
 
 		 355 aa  187  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  34.66 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  34.66 
 
 		 380 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  34.66 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  34.66 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  34.66 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  34.66 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  34.66 
 
 		 383 aa  179  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  33.6 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0260  outer membrane protein (porin)  37.46 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  34.39 
 
 		 481 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  33.88 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2803  OmpC family outer membrane porin  33.72 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.011499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  33.88 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  32.6 
 
 		 359 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  33.88 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  33.88 
 
 		 379 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  33.88 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  33.88 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  33.33 
 
 		 379 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  32.3 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  32.3 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  32.47 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  32.22 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  32.22 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  32.22 
 
 		 436 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  32.22 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  32.22 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  32.22 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  31.83 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  32.55 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  32.01 
 
 		 371 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  32.52 
 
 		 382 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2524  OmpC family outer membrane porin  32.78 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.510501  normal  0.104939 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  31.96 
 
 		 386 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.97 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.97 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  30.64 
 
 		 354 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  33.42 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.25 
 
 		 383 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  33.42 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  32.9 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  32.48 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  35.03 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  35.04 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  35.03 
 
 		 430 aa  155  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  35.03 
 
 		 430 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 375 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  34.77 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  35 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  34.77 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  34.77 
 
 		 430 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  35 
 
 		 409 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.32 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.32 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  34.99 
 
 		 390 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  31.83 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  31.7 
 
 		 389 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  30.15 
 
 		 395 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  34.25 
 
 		 391 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  30.17 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.98 
 
 		 389 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2079  putative outer membrane porin  30.17 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0815  putative outer membrane porin  30.17 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1106  putative outer membrane porin  30.17 
 
 		 399 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  34.2 
 
 		 390 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  30.83 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  32.11 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.63 
 
 		 381 aa  149  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1789  outer membrane porin  29.93 
 
 		 399 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  33.42 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  31.92 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  30.18 
 
 		 389 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  32.99 
 
 		 381 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0357  outer membrane porin  29.67 
 
 		 391 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.614189  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  33.68 
 
 		 390 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>