165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2651 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2651  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  100 
 
 
190 aa  382  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.136026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3466  WD40 domain protein beta Propeller  99.47 
 
 
190 aa  380  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4015  WD40 domain protein beta Propeller  72.12 
 
 
174 aa  247  6e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.482104 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0520  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  60.48 
 
 
186 aa  214  9e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.118512  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0056  WD40 domain-containing protein  55.36 
 
 
184 aa  200  9e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2014  hypothetical protein  56.89 
 
 
197 aa  187  9e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.598603 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3979  hypothetical protein  44.83 
 
 
171 aa  130  8e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4021  WD40 domain protein beta Propeller  44.83 
 
 
171 aa  130  8e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  43.12 
 
 
169 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  42.66 
 
 
197 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  42.66 
 
 
197 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  40.52 
 
 
160 aa  113  2e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  40.52 
 
 
160 aa  113  2e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  38.71 
 
 
172 aa  113  2e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0057  WD40 domain-containing protein  38.75 
 
 
175 aa  112  4e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2013  hypothetical protein  38.67 
 
 
175 aa  101  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.57132 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0417  hypothetical protein  34.56 
 
 
165 aa  68.2  7e-11  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2264  hypothetical protein  29.73 
 
 
158 aa  66.6  2e-10  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03171  hypothetical protein  29.69 
 
 
168 aa  62.8  3e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.954075 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  32.31 
 
 
451 aa  60.5  2e-08  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  32.85 
 
 
428 aa  59.7  2e-08  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  28.95 
 
 
436 aa  59.7  2e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.82 
 
 
403 aa  59.3  3e-08  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  30.26 
 
 
560 aa  57.4  1e-07  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  27.07 
 
 
432 aa  56.6  2e-07  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  32.46 
 
 
421 aa  56.2  3e-07  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2263  hypothetical protein  35.56 
 
 
176 aa  55.1  6e-07  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.596766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  34.75 
 
 
435 aa  55.1  6e-07  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03181  hypothetical protein  31.78 
 
 
133 aa  54.7  8e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.932316 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  31.69 
 
 
438 aa  54.7  9e-07  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  32.46 
 
 
427 aa  53.9  1e-06  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  32.46 
 
 
442 aa  53.9  1e-06  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  1.37237e-05  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  32.46 
 
 
442 aa  53.9  1e-06  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  7.51795e-08  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  32.46 
 
 
442 aa  53.9  1e-06  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  1.71266e-07  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.81 
 
 
440 aa  53.1  2e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  4.1437e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.45 
 
 
444 aa  53.5  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  2.57607e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.77 
 
 
441 aa  53.1  2e-06  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  8.32022e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0416  hypothetical protein  27.59 
 
 
146 aa  53.5  2e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  31.62 
 
 
442 aa  53.1  2e-06  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  9.78843e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  31.62 
 
 
442 aa  53.1  2e-06  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  7.14613e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  35.96 
 
 
461 aa  53.5  2e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  31.62 
 
 
442 aa  53.1  2e-06  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  1.86682e-08  hitchhiker  1.62747e-05 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  31.62 
 
 
442 aa  53.1  3e-06  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  1.49314e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  31.58 
 
 
442 aa  52.8  3e-06  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  1.08344e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  52.8  3e-06  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  2.03609e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  33.33 
 
 
442 aa  52.4  4e-06  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  32.14 
 
 
457 aa  51.6  7e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  29.75 
 
 
450 aa  50.8  1e-05  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  31.53 
 
 
442 aa  50.8  1e-05  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  29.82 
 
 
438 aa  50.8  1e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  29.82 
 
 
443 aa  49.7  2e-05  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_002978  WD0038  translocation protein TolB  26.27 
 
 
420 aa  50.1  2e-05  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0823662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  32.86 
 
 
445 aa  50.1  2e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  34.26 
 
 
428 aa  49.7  2e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  31.62 
 
 
441 aa  50.1  2e-05  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  30.77 
 
 
451 aa  50.4  2e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  29.82 
 
 
440 aa  49.7  3e-05  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  29.82 
 
 
429 aa  49.7  3e-05  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.37 
 
 
426 aa  49.3  3e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.95 
 
 
441 aa  48.9  5e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  29.1 
 
 
717 aa  48.9  5e-05  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  31.67 
 
 
432 aa  48.5  6e-05  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  29.82 
 
 
408 aa  48.1  7e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  32.56 
 
 
432 aa  48.1  7e-05  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  3.36659e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0782  translocation protein TolB  35.4 
 
 
425 aa  48.1  7e-05  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  29.37 
 
 
434 aa  48.1  8e-05  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  32.11 
 
 
415 aa  48.1  8e-05  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  4.1462e-08  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  30.25 
 
 
442 aa  48.1  8e-05  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  4.3993e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  31.3 
 
 
441 aa  48.1  8e-05  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  5.40509e-05  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  29.31 
 
 
434 aa  47.8  9e-05  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.17 
 
 
428 aa  47.4  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.89 
 
 
450 aa  47.4  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.34537e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  31.9 
 
 
440 aa  47.4  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  28.69 
 
 
444 aa  47.8  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  7.50977e-07  decreased coverage  9.15698e-05 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15281  hypothetical protein  28.23 
 
 
572 aa  46.6  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.493814  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.89 
 
 
407 aa  46.6  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  2.66488e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  28.07 
 
 
431 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  30.33 
 
 
439 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0888  translocation protein TolB  27.66 
 
 
426 aa  46.6  0.0002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.1 
 
 
450 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  26.79 
 
 
1202 aa  46.6  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  26.47 
 
 
437 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  27.19 
 
 
431 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  27.19 
 
 
431 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.71 
 
 
407 aa  46.2  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  29.77 
 
 
432 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  27.19 
 
 
431 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  27.87 
 
 
441 aa  45.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  2.31281e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  27.19 
 
 
431 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  28.93 
 
 
1078 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  27.19 
 
 
431 aa  45.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.06 
 
 
442 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27.19 
 
 
425 aa  45.1  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  28.33 
 
 
560 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  27.73 
 
 
442 aa  45.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  29.41 
 
 
463 aa  44.7  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.48 
 
 
438 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.69838e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  32.8 
 
 
442 aa  44.7  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  30.56 
 
 
469 aa  44.7  0.0009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  2.01302e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  38.16 
 
 
439 aa  44.7  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>