More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2456 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2456  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
255 aa  511  1e-144  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.588805  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0026  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.19 
 
 
269 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5052  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
246 aa  169  3e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.77 
 
 
254 aa  169  4e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.37 
 
 
254 aa  169  5e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.5 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.165554 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7850  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.86 
 
 
256 aa  159  5e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.68 
 
 
249 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1020  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.9 
 
 
246 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0122832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2089  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
246 aa  156  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0163129  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1897  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
247 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100219 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1110  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.29 
 
 
246 aa  155  6e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2395  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
245 aa  155  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.17766  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4471  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.07 
 
 
270 aa  155  7e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0156103  normal  0.420839 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2371  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.52 
 
 
244 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 
271 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.224446 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5464  NAD-dependent epimerase/dehydratase:Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852927  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
253 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0908  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  41.92 
 
 
257 aa  151  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.117831  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.74 
 
 
254 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4205  short chain dehydrogenase  39.84 
 
 
249 aa  151  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1005  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
260 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000302146 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3772  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.08 
 
 
246 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00117266  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1869  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
263 aa  150  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1473  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 
249 aa  150  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162054  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0840  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.48 
 
 
266 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.551106  normal  0.267139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
263 aa  150  2e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00404736  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0142  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.14 
 
 
255 aa  149  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0684  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  33.33 
 
 
245 aa  150  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015461  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
258 aa  150  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.66 
 
 
255 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000131904  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.04 
 
 
249 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 
248 aa  148  6e-35  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.253805  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2680  short chain dehydrogenase  38.52 
 
 
253 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.313407  normal  0.819387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4194  short chain dehydrogenase  39.85 
 
 
253 aa  148  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.896625 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7331  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  38.25 
 
 
249 aa  148  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.753901  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3623  short chain dehydrogenase  40.7 
 
 
253 aa  148  8e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0211534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.4 
 
 
260 aa  148  8e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0407787  normal  0.415093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2790  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.11 
 
 
269 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1425  short chain dehydrogenase  39.3 
 
 
253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.857979  normal  0.357324 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1447  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.77 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6998  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
252 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4004  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.132038  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0108  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.51 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0592411  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0917  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.213986 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2428  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.85 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.888427 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00277313  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0156  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000282185  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2914  short chain dehydrogenase  38.74 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.892644  normal  0.135282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3531  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6461  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
244 aa  146  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998929  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3366  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
250 aa  146  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.13 
 
 
246 aa  146  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.650868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.8 
 
 
270 aa  146  3e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2513  normal  0.363007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0982  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
249 aa  146  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.629035  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
264 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0249  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0279472  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.22 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2297  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.17 
 
 
267 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0843841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1817  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6053  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.37 
 
 
285 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0516293 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.89 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0696  glucose 1-dehydrogenase  34.51 
 
 
252 aa  145  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
248 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1098  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.65 
 
 
249 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4552  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.73 
 
 
246 aa  144  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72840  putative short-chain dehydrogenase  35.74 
 
 
252 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6322  putative short-chain dehydrogenase  35.74 
 
 
252 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1396  short chain dehydrogenase  39.13 
 
 
253 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1794  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.65 
 
 
257 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.55 
 
 
244 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.43 
 
 
256 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6108  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.34 
 
 
255 aa  143  3e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  36.33 
 
 
251 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.83 
 
 
274 aa  143  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.446578 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 
256 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.105219 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.84 
 
 
252 aa  143  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.87063  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.06 
 
 
236 aa  142  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  32.44 
 
 
250 aa  142  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00209821  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4009  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
240 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.39 
 
 
251 aa  142  4e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1052  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.8 
 
 
249 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.595942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
262 aa  142  5e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
251 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.612185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 
252 aa  142  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
250 aa  142  5e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.4902  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0551  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.4 
 
 
259 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0259011  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  34.52 
 
 
246 aa  142  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.71 
 
 
265 aa  142  6e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5843  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.36 
 
 
261 aa  142  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.861263  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2801  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.36 
 
 
249 aa  142  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
297 aa  142  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00620  dehydrogenase of unknown specificity, short-chain alcohol dehydrogenase like  39.37 
 
 
260 aa  142  7e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.297652  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0863  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.22 
 
 
264 aa  142  8e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3894  short chain dehydrogenase  38.34 
 
 
253 aa  142  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.933722  normal  0.0806905 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.36 
 
 
244 aa  141  9e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.101629  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>