More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0968 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0968  nitroreductase  100 
 
 		 273 aa  566  1e-160  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000969197  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1845  nitroreductase  54.04 
 
 		 278 aa  317  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000200158  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0979  nitroreductase family protein  55.31 
 
 		 272 aa  313  9.999999999999999e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0228506  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1135  nitroreductase family protein  54.58 
 
 		 272 aa  293  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000059926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1141  nitroreductase  33.84 
 
 		 263 aa  166  5e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.262211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3021  nitroreductase family protein  28.72 
 
 		 262 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2624  nitroreductase  29.29 
 
 		 273 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.28949  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3391  nitroreductase  27.78 
 
 		 284 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0601341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1688  nitroreductase  29.18 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1649  nitroreductase  29.23 
 
 		 274 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0777  nitroreductase  26.41 
 
 		 275 aa  124  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0136069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0454  nitroreductase  29.75 
 
 		 271 aa  122  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00612332  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3115  nitroreductase  28.01 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273584 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1860  nitroreductase  30.58 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0528  nitroreductase family protein  26.69 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0687509  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2365  nitroreductase  29.23 
 
 		 273 aa  118  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1484  nitroreductase  28.26 
 
 		 295 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.763778 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1631  nitroreductase  27.14 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1590  nitroreductase  28.12 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000230699  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1740  nitroreductase  27.6 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.326694  normal  0.378634 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0500  ferredoxin-nitroreductase protein  28.1 
 
 		 277 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  27.8 
 
 		 334 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1266  nitroreductase  26.55 
 
 		 282 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0390  nitroreductase  27.46 
 
 		 274 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00534305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0625  nitroreductase  26.62 
 
 		 279 aa  107  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497203  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0390  nitroreductase  27.24 
 
 		 278 aa  107  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.36041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1838  nitroreductase  25.18 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00713551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  24.82 
 
 		 272 aa  102  7e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2472  nitroreductase  25.18 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.151442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  27.96 
 
 		 345 aa  101  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2413  nitroreductase family protein  24.11 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0886  hypothetical protein  28.03 
 
 		 303 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3287  nitroreductase  23.67 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.954102 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1543  nitroreductase  25.09 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000000268728  normal  0.225024 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1490  nitroreductase  21.55 
 
 		 275 aa  94  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.628384  normal  0.490077 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1195  nitroreductase family protein  27.37 
 
 		 278 aa  94.4  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.950969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0015  nitroreductase  24.91 
 
 		 272 aa  92  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2995  nitroreductase  28.01 
 
 		 271 aa  92  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.321815  normal  0.440461 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0432  hypothetical protein  25.36 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0348  ferredoxin  25.71 
 
 		 275 aa  85.5  9e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0453  nitroreductase  24.03 
 
 		 274 aa  82.4  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18390  nitroreductase  23.16 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.281647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  28.71 
 
 		 194 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  26.34 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0039  nitroreductase  27.05 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.499814  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  28.36 
 
 		 202 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  28.22 
 
 		 215 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  24.53 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  25 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  27.5 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  24.75 
 
 		 186 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  29.76 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  25.91 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2040  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2145  Fe-S cluster domain-containing protein  41.27 
 
 		 435 aa  58.9  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0093  Fe-S cluster domain protein  32.5 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000835421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1494  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  42.59 
 
 		 57 aa  57.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2354  nitroreductase  24.6 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0174097  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1929  hypothetical protein  52.38 
 
 		 633 aa  57.4  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.986915  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  30.67 
 
 		 428 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  23.18 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.92 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  26.63 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  26.24 
 
 		 176 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  28.49 
 
 		 167 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  27.37 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1568  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  40 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  29.95 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0532  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  50 
 
 		 55 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000183692  normal  0.0950225 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0375  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  42.31 
 
 		 57 aa  55.1  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3017  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.28 
 
 		 57 aa  55.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0212727  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.7 
 
 		 190 aa  55.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1292  Fe-S cluster domain protein  37.1 
 
 		 443 aa  55.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0902  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  28.57 
 
 		 314 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.533273  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  24.09 
 
 		 215 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.62 
 
 		 246 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000357209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001121  NADPH-flavin oxidoreductase  28.65 
 
 		 240 aa  54.3  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000890353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1713  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  42.37 
 
 		 748 aa  54.7  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000552259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  24.73 
 
 		 174 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  23.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  23.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  23.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  23.64 
 
 		 215 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  23.64 
 
 		 215 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  27.68 
 
 		 179 aa  53.1  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0494  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 519 aa  53.1  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  22.56 
 
 		 192 aa  53.5  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  26.37 
 
 		 163 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2435  nitroreductase  19.8 
 
 		 303 aa  53.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00882814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  48 
 
 		 791 aa  52.8  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0092  putative PAS/PAC sensor protein  36.92 
 
 		 577 aa  53.1  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2557  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  45.28 
 
 		 369 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.75783  normal  0.24962 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  23.85 
 
 		 215 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02060  putative PAS/PAC sensor protein  42.42 
 
 		 571 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2239  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.74 
 
 		 371 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000624735 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  26.82 
 
 		 176 aa  52.4  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0178  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.43 
 
 		 443 aa  52.4  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0372  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  32.26 
 
 		 418 aa  52.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0995  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.85 
 
 		 366 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1456  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  42.59 
 
 		 57 aa  52  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.519464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>