More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0630 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 304 aa  627  1e-179  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  57.4 
 
 		 280 aa  353  2e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  54.51 
 
 		 277 aa  329  4e-89  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  56.63 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  54.15 
 
 		 277 aa  324  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  56.27 
 
 		 278 aa  324  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  53.43 
 
 		 277 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  52.71 
 
 		 292 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  54.84 
 
 		 278 aa  311  7.999999999999999e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  51.06 
 
 		 287 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 		 282 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  53.05 
 
 		 278 aa  302  5.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  51.64 
 
 		 279 aa  301  8.000000000000001e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  53.93 
 
 		 282 aa  301  1e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  51.61 
 
 		 278 aa  297  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  46.76 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  49.46 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  46.74 
 
 		 283 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5074  diaminopimelate epimerase  47.18 
 
 		 288 aa  259  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4806  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4647  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4667  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3545  diaminopimelate epimerase  46.98 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5170  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5079  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0166  diaminopimelate epimerase  47.54 
 
 		 288 aa  259  4e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5045  diaminopimelate epimerase  47.33 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  47.84 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5076  diaminopimelate epimerase  47.18 
 
 		 288 aa  257  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4756  diaminopimelate epimerase  46.62 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  45.65 
 
 		 284 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  42.29 
 
 		 279 aa  251  2e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  44.73 
 
 		 278 aa  249  6e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2888  diaminopimelate epimerase  47.48 
 
 		 284 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3033  diaminopimelate epimerase  48.03 
 
 		 290 aa  247  2e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  43.73 
 
 		 284 aa  244  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  41.79 
 
 		 277 aa  232  6e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0198  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  42.7 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0153  diaminopimelate epimerase  41.4 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  44.73 
 
 		 279 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4373  diaminopimelate epimerase  40.62 
 
 		 287 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2542  diaminopimelate epimerase  43.37 
 
 		 277 aa  228  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0836815  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0196  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 290 aa  228  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.465069  hitchhiker  0.000651224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0192  diaminopimelate epimerase  40.71 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3688  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 315 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  0.690927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2998  diaminopimelate epimerase  39.52 
 
 		 292 aa  224  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  41.9 
 
 		 280 aa  223  2e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0495  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0349  diaminopimelate epimerase  39.58 
 
 		 299 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  40.22 
 
 		 278 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1453  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 286 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3080  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.188461 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3131  diaminopimelate epimerase  40 
 
 		 289 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  39.71 
 
 		 269 aa  219  5e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0039  diaminopimelate epimerase  39.16 
 
 		 292 aa  218  1e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258665 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1418  diaminopimelate epimerase  41.49 
 
 		 279 aa  218  1e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.827991  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 278 aa  218  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3102  diaminopimelate epimerase  39.31 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0172  diaminopimelate epimerase  40.41 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0061  diaminopimelate epimerase  39.01 
 
 		 279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1015  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 274 aa  216  4e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0033  diaminopimelate epimerase  39.37 
 
 		 292 aa  216  4e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2377  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 281 aa  215  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.63698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2326  diaminopimelate epimerase  41.07 
 
 		 281 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2471  diaminopimelate epimerase  39.31 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3085  diaminopimelate epimerase  39.31 
 
 		 309 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0209  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3260  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  40.93 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3426  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2922  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.513817  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0237  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 277 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.142779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2167  diaminopimelate epimerase  40.69 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.636028  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5143  diaminopimelate epimerase  40.49 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75804e-23 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0197  diaminopimelate epimerase  40.34 
 
 		 289 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.925339  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0045  Diaminopimelate epimerase  37.59 
 
 		 278 aa  212  7.999999999999999e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6435  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 289 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.497527 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3587  diaminopimelate epimerase  41.94 
 
 		 276 aa  211  1e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.335636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0076  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0405  diaminopimelate epimerase  41.75 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.759979  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  37.99 
 
 		 274 aa  209  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2994  diaminopimelate epimerase  39.44 
 
 		 282 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0384566 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1893  diaminopimelate epimerase  42.39 
 
 		 278 aa  209  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.593063  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2393  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 276 aa  209  5e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.976013  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2526  diaminopimelate epimerase  40.36 
 
 		 288 aa  209  6e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.126589 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0380  diaminopimelate epimerase  39.07 
 
 		 281 aa  209  6e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  40.07 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35896  predicted protein  38.28 
 
 		 407 aa  207  1e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.22648  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0799  diaminopimelate epimerase  38.49 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  39.86 
 
 		 274 aa  206  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3444  diaminopimelate epimerase  38.28 
 
 		 291 aa  206  5e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0899  diaminopimelate epimerase  37.54 
 
 		 294 aa  205  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  39.5 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00309  diaminopimelate epimerase  37.77 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  38.43 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1200  diaminopimelate epimerase  38.71 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0570214  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0119  diaminopimelate epimerase  36.88 
 
 		 278 aa  202  4e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1107  diaminopimelate epimerase  37.76 
 
 		 355 aa  203  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134817  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1058  diaminopimelate epimerase  37.93 
 
 		 299 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.553091  normal  0.543638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>