More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0070 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  100 
 
 		 157 aa  326  7e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  66.24 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  51.47 
 
 		 143 aa  140  9e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  46.56 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0808  UspA domain protein  37.86 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0102743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  37.86 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  37.86 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1448  universal stress protein UspA  37.84 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  36.88 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  35.97 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  35.17 
 
 		 152 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  34.48 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  35.81 
 
 		 164 aa  71.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  36.49 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  34.51 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  33.79 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2791  UspA domain-containing protein  37.68 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.119476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  32.47 
 
 		 162 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4021  UspA domain protein  45.9 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4059  UspA domain protein  45.9 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  36.36 
 
 		 162 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  32.37 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2060  UspA domain protein  32.61 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000482374  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1338  universal stress protein  33.09 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431225  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0538  UspA domain protein  29.37 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0713  UspA domain-containing protein  33.81 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00140239  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  31.13 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  31.13 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6565  UspA domain-containing protein  31.25 
 
 		 161 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.363872  normal  0.275495 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  33.56 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.06 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  31.79 
 
 		 169 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  32.24 
 
 		 320 aa  63.9  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  31.69 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  43.24 
 
 		 144 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  36.62 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  34.78 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  35.16 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.07 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  30.99 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  56.86 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  42.37 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  27.95 
 
 		 162 aa  60.5  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5007  UspA domain protein  29.17 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.773862 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3615  UspA domain protein  30.6 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0603569  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  30.61 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2861  UspA domain protein  32.84 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.569855  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1662  UspA domain protein  41.33 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  31.03 
 
 		 309 aa  58.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2314  UspA domain protein  39.51 
 
 		 153 aa  58.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1792  UspA domain protein  32.24 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  31.51 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  28.76 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  28.76 
 
 		 166 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  44.64 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  31.65 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2888  UspA domain protein  36.36 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  49.06 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0155  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  33.1 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  45.16 
 
 		 300 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2768  UspA domain protein  31.58 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.327579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2133  universal stress family protein  32.24 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2132  UspA domain protein  28.39 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182208  normal  0.874997 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2567  UspA domain protein  34.56 
 
 		 325 aa  57.8  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1274  UspA domain-containing protein  46.3 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.331528 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  43.84 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  32.03 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  28.47 
 
 		 304 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  37.78 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2675  universal stress protein UspA  31.58 
 
 		 134 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4067  UspA domain-containing protein  34.06 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.483975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  45.45 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  31.16 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5163  UspA domain protein  31.16 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.262292  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  30.67 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  29.14 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  30.46 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  29.86 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  45 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  38.67 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2381  UspA domain protein  28.1 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.726392 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  36.11 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  29.8 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  31.5 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2330  UspA domain protein  28.1 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  28.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2547  UspA domain protein  29.08 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  29.3 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  44.44 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  28.97 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2327  UspA domain protein  29.93 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  43.4 
 
 		 296 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2546  UspA domain protein  30.47 
 
 		 390 aa  55.5  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  29.5 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>