217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03980 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  37.6 
 
 		 1048 aa  654    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  100 
 
 		 1097 aa  2271    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  38.12 
 
 		 486 aa  262  3e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  26.73 
 
 		 986 aa  241  8e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  27.35 
 
 		 901 aa  217  9.999999999999999e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  35.28 
 
 		 934 aa  211  8e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  30.18 
 
 		 636 aa  210  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  33.69 
 
 		 619 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  34.48 
 
 		 902 aa  202  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  33.26 
 
 		 622 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  33.05 
 
 		 622 aa  198  6e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  32.96 
 
 		 902 aa  197  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  32.57 
 
 		 651 aa  196  2e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  29.42 
 
 		 632 aa  194  8e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  35.98 
 
 		 754 aa  178  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  36.81 
 
 		 650 aa  173  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  33.33 
 
 		 655 aa  172  3e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  36.81 
 
 		 650 aa  169  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  31.66 
 
 		 1090 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  34.73 
 
 		 636 aa  166  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  29.17 
 
 		 606 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  37.13 
 
 		 283 aa  160  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  32.29 
 
 		 643 aa  159  2e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  29.57 
 
 		 797 aa  158  6e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  29.98 
 
 		 686 aa  156  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  31.11 
 
 		 609 aa  156  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.243815 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  29.16 
 
 		 1077 aa  154  7e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  29.57 
 
 		 611 aa  154  8e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.71 
 
 		 635 aa  152  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  26.56 
 
 		 748 aa  141  7e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  28.33 
 
 		 952 aa  140  1e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  28.9 
 
 		 752 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  28.99 
 
 		 466 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  33.93 
 
 		 633 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  28.74 
 
 		 479 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  31.35 
 
 		 633 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  30.41 
 
 		 633 aa  127  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  30.56 
 
 		 633 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  30.85 
 
 		 388 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  34.4 
 
 		 716 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  32.58 
 
 		 464 aa  119  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  31.33 
 
 		 629 aa  119  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  31.29 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1516  AAA ATPase  29 
 
 		 1271 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.18518 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_16966  predicted protein  24.84 
 
 		 870 aa  113  2.0000000000000002e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0659  superfamily I DNA and RNA helicase  27.43 
 
 		 1111 aa  112  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0681058 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.06 
 
 		 2245 aa  109  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  29.45 
 
 		 1653 aa  109  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  26.72 
 
 		 1038 aa  108  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  29.72 
 
 		 1999 aa  102  4e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  29.83 
 
 		 1189 aa  101  8e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  33.19 
 
 		 237 aa  100  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  31.29 
 
 		 941 aa  100  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2207  AAA ATPase  26.91 
 
 		 1255 aa  100  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  26.86 
 
 		 585 aa  96.3  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2111  superfamily I DNA/RNA helicase  29.27 
 
 		 1408 aa  95.1  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.87 
 
 		 1275 aa  94.7  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0935  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1172 aa  92.8  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.576468  hitchhiker  0.000557734 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  25 
 
 		 715 aa  92.8  3e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  27.19 
 
 		 315 aa  91.3  1e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  23.77 
 
 		 769 aa  90.5  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  24.69 
 
 		 1116 aa  89  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  23.24 
 
 		 1099 aa  87  0.000000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  24.05 
 
 		 1428 aa  86.7  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0890  hypothetical protein  24.74 
 
 		 1215 aa  85.9  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1784  hypothetical protein  24.57 
 
 		 1118 aa  85.9  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.424401  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  22.53 
 
 		 759 aa  85.5  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  22.85 
 
 		 769 aa  85.1  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1018 aa  84.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1000  hypothetical protein  23.63 
 
 		 1215 aa  83.6  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0219894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  31.4 
 
 		 1041 aa  82.4  0.00000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3698  RecB family nuclease, putative  24.5 
 
 		 1082 aa  82.4  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1126 aa  82  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4472  RecB family-like nuclease  26.93 
 
 		 1151 aa  81.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.836505  normal  0.104003 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  23.89 
 
 		 1284 aa  80.9  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  26.2 
 
 		 795 aa  80.9  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  29.15 
 
 		 553 aa  80.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  29.15 
 
 		 553 aa  80.5  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  25.05 
 
 		 521 aa  78.6  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.273766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02510  predicted nuclease (RecB family)  24.94 
 
 		 1250 aa  77.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  27.64 
 
 		 1427 aa  77.4  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  23.43 
 
 		 759 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  23.22 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  23.43 
 
 		 759 aa  77  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  23.62 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  23.01 
 
 		 759 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51880  Superfamily I DNA and RNA helicases and helicase subunits-related protein  23.76 
 
 		 1212 aa  75.1  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.838373  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  26.64 
 
 		 759 aa  75.1  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  25.21 
 
 		 1427 aa  75.1  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  26.64 
 
 		 759 aa  74.7  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  26.73 
 
 		 1620 aa  74.3  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20350  predicted nuclease (RecB family)  24.58 
 
 		 1196 aa  74.3  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  22.59 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  22.61 
 
 		 1457 aa  73.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  23.43 
 
 		 1270 aa  73.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2456  hypothetical protein  23.95 
 
 		 1247 aa  72.4  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.0142117 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1720  hypothetical protein  24.07 
 
 		 1259 aa  72  0.00000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5304  AAA ATPase  22.31 
 
 		 1153 aa  72  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0014  putative DNA helicase  26.2 
 
 		 925 aa  70.5  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4376  superfamily I DNA/RNA helicase  25.99 
 
 		 659 aa  70.1  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.568868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>