More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2090 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  448  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  81.08 
 
 		 222 aa  366  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1510  GntR family transcriptional regulator  69.82 
 
 		 222 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.535687  normal  0.154359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2755  GntR family transcriptional regulator  70 
 
 		 222 aa  301  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  68.37 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  68.37 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  62.74 
 
 		 233 aa  271  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  62.26 
 
 		 244 aa  268  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  49.53 
 
 		 223 aa  201  9e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  48.8 
 
 		 212 aa  188  5e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  47.78 
 
 		 239 aa  185  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  46.73 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 211 aa  170  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  44.88 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  43.2 
 
 		 211 aa  164  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  44.86 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  41 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1013  GntR family transcriptional regulator  46.12 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.972264 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  46.04 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2806  GntR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 215 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155753  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 240 aa  133  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3571  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.792294 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1722  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  37.02 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 231 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 224 aa  119  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 223 aa  118  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  36.41 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 241 aa  117  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.86 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 255 aa  115  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0165  GntR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 222 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108309  decreased coverage  0.00499675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 229 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  37.56 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  35.9 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0614  transcriptional regulator, GntR family  34.65 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22125  normal  0.431633 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  39.25 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1660  transcriptional regulator, GntR family  39.02 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1385  GntR domain-containing protein  39.02 
 
 		 223 aa  108  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179807 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  34.47 
 
 		 216 aa  108  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 223 aa  108  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  35.38 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0485  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  108  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  33 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  37.76 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  36.76 
 
 		 274 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 229 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  31.31 
 
 		 228 aa  105  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5802  GntR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 227 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154475  normal  0.167902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.22 
 
 		 229 aa  104  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3196  transcriptional regulator, GntR family  33.85 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.594143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.29 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1652  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.13154  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6029  GntR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.235411  normal  0.357721 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5373  transcriptional regulator GntR family  34.47 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 230 aa  102  6e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  31.53 
 
 		 224 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1381  transcriptional regulator, GntR family  40 
 
 		 223 aa  102  7e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1839  GntR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000090483  n/a   
 
 
 
NC_011894  Mnod_3148  transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 222 aa  101  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4643  transcriptional regulator, GntR family  36.71 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.215636  normal  0.668191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4056  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 244 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.153402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 290 aa  99.8  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>