More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2062 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2062  major facilitator transporter  100 
 
 		 414 aa  801    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000288841  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0180  major facilitator transporter  61.21 
 
 		 420 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3525  major facilitator transporter  35.63 
 
 		 486 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4171  major facilitator transporter  35.22 
 
 		 426 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00182156  normal  0.0631303 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3782  major facilitator superfamily transporter  36.49 
 
 		 415 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6372  major facilitator transporter  34.99 
 
 		 418 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4300  major facilitator superfamily MFS_1  33.69 
 
 		 413 aa  192  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1335  major facilitator superfamily MFS_1  35.79 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3527  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0989887 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4647  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1096  major facilitator transporter  35.79 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.222683  normal  0.273205 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0615  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.444913  normal  0.0805923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1701  major facilitator transporter  35.73 
 
 		 416 aa  166  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.3535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1554  major facilitator transporter  32.2 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0480  major facilitator transporter  29.28 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0580  major facilitator superfamily (MFS)transporter  32.34 
 
 		 420 aa  155  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.104096  normal  0.348152 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1427  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 417 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220727 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37460  putative permease  30.25 
 
 		 427 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.114641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3251  major facilitator superfamily MFS_1  31 
 
 		 430 aa  126  8.000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30600  putative permease  31.57 
 
 		 404 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.166806 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6311  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0278735  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2288  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.16784  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0298  major facilitator transporter  30.79 
 
 		 449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6123  major facilitator superfamily permease  28.43 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  0.649512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2923  major facilitator superfamily MFS_1  30.28 
 
 		 438 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000215921  hitchhiker  0.0000549805 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0351  major facilitator superfamily permease  24.39 
 
 		 415 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.642789  hitchhiker  0.00154369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0424  major facilitator transporter  30.87 
 
 		 420 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0839  major facilitator transporter  30.62 
 
 		 402 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3058  major facilitator transporter  31.2 
 
 		 442 aa  107  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2759  major facilitator superfamily MFS_1  30.99 
 
 		 472 aa  106  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000526196 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1013  major facilitator superfamily transporter  30 
 
 		 405 aa  106  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0927  major facilitator superfamily MFS_1  30 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.758133  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0738  major facilitator transporter  30.69 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1789  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 400 aa  106  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.790734  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3632  major facilitator superfamily MFS_1  28.57 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3096  major facilitator superfamily MFS_1  28.64 
 
 		 431 aa  103  5e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00556654 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1339  major facilitator superfamily transporter  29.38 
 
 		 412 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.627078 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2522  major facilitator transporter  27.65 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.957719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3681  major facilitator superfamily MFS_1  30.37 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0825  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 415 aa  101  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2011  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 452 aa  101  3e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.805115  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0492  major facilitator transporter  28.39 
 
 		 422 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2585  twin-arginine translocation pathway signal  28.24 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0520  major facilitator transporter  28.24 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  26.43 
 
 		 412 aa  101  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3607  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 439 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.943392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3203  major facilitator superfamily MFS_1  26.53 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  unclonable  0.000000000018384 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1692  major facilitator superfamily transporter  26.33 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.183372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3808  major facilitator transporter  28.97 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0079  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 428 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2637  major facilitator transporter  28.33 
 
 		 414 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03015  putative transport transmembrane protein  26.81 
 
 		 432 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.120422 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2878  major facilitator transporter  28.11 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.124672 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3842  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.474269  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  26.61 
 
 		 413 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2737  major facilitator superfamily MFS_1  31.37 
 
 		 405 aa  95.5  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.710897  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5487  major facilitator transporter  26.91 
 
 		 410 aa  95.5  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.397179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2623  major facilitator transporter  26.37 
 
 		 434 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2943  major facilitator superfamily MFS_1  30.59 
 
 		 409 aa  95.1  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2359  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.313379  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0450  major facilitator transporter  28.46 
 
 		 424 aa  94.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.240321  normal  0.0410928 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 421 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1300  major facilitator transporter  29.25 
 
 		 410 aa  94  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.058248 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1594  major facilitator transporter  25.32 
 
 		 457 aa  93.2  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.224646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3364  major facilitator transporter  26.95 
 
 		 412 aa  93.2  8e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1022  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 412 aa  92.8  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3574  MFS family transporter  28.78 
 
 		 425 aa  92.8  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.356058  normal  0.784997 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1958  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1994  major facilitator transporter  30.4 
 
 		 411 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.392153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3966  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal  0.02436 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3852  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.133619  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4323  major facilitator transporter  30.34 
 
 		 436 aa  92  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189699  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2451  major facilitator transporter  29.05 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.367941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3167  major facilitator transporter  26.88 
 
 		 417 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.312872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2560  putative MFS transporter  29.14 
 
 		 407 aa  90.9  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2999  major facilitator transporter  29.84 
 
 		 408 aa  90.9  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.548657  normal  0.0674552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1609  major facilitator superfamily MFS_1  28.09 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0283587  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1718  transporter, putative  27.88 
 
 		 402 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149984  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4904  MFS superfamily transporter  31.27 
 
 		 435 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00499167  normal  0.0129591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5585  major facilitator protein family permease  28.32 
 
 		 480 aa  90.5  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4386  major facilitator transporter  29.35 
 
 		 405 aa  90.1  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4759  major facilitator superfamily MFS_1  27.14 
 
 		 439 aa  90.1  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.302877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7202  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 431 aa  89.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.63867  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2099  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 406 aa  89.4  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1198  major facilitator superfamily transporter  27.97 
 
 		 413 aa  89.4  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.852259 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5900  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00598208  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2177  major facilitator transporter  26.98 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.404965  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3944  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 428 aa  89.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1521  putative transporter  27.08 
 
 		 429 aa  88.6  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.488674  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4035  major facilitator transporter  29.27 
 
 		 400 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3671  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 402 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112178  normal  0.0907085 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1282  major facilitator transporter  27.69 
 
 		 400 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800461 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0055  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2194  major facilitator transporter  27.04 
 
 		 410 aa  87.8  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  24.88 
 
 		 401 aa  88.2  3e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1573  transporter, putative  27.08 
 
 		 430 aa  87.4  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2280  major facilitator superfamily MFS_1  31.58 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.975633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1885  major facilitator transporter  31.56 
 
 		 405 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.135618  normal  0.739833 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1507  major facilitator transporter  25.37 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 		 424 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>