More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6404 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  100 
 
 		 359 aa  725    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  40.61 
 
 		 371 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  41.13 
 
 		 380 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  41 
 
 		 379 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  41.55 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  41.55 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  41.55 
 
 		 379 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  39.89 
 
 		 382 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  41 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  41 
 
 		 379 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  38.8 
 
 		 382 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  40.44 
 
 		 379 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  39.64 
 
 		 384 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  37.79 
 
 		 381 aa  216  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  39.44 
 
 		 386 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  39.64 
 
 		 384 aa  215  8e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  38.97 
 
 		 383 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  38.73 
 
 		 381 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  39.23 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  39.23 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  39.23 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  39.23 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  39.23 
 
 		 380 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  39.23 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  39.23 
 
 		 383 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  38.67 
 
 		 481 aa  212  7e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  38.93 
 
 		 386 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  40.31 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  37.78 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  38.32 
 
 		 387 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.8 
 
 		 385 aa  202  6e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  37.8 
 
 		 385 aa  202  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  40 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  37.22 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  37.22 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  37.03 
 
 		 387 aa  196  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  37.27 
 
 		 375 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  34.84 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  36.87 
 
 		 389 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  38.26 
 
 		 387 aa  192  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  36.8 
 
 		 383 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  35.68 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  38.92 
 
 		 422 aa  191  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  37.6 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  37.74 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  37.4 
 
 		 380 aa  189  5e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  36.7 
 
 		 383 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  36.03 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  36.5 
 
 		 393 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  35.7 
 
 		 380 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  35.26 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  37.47 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  34.59 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  38.38 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  38.38 
 
 		 382 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  38.38 
 
 		 424 aa  187  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.77 
 
 		 380 aa  186  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  37.4 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  36.51 
 
 		 375 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  36.11 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  34.72 
 
 		 375 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  38.35 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  35.23 
 
 		 358 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  37.33 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  38.35 
 
 		 390 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  36 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  35.65 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  36 
 
 		 383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  35.65 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  35.77 
 
 		 386 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  37.5 
 
 		 390 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  36.51 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  36.51 
 
 		 375 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  36.03 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  35.07 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  36.48 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  36.83 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  36.83 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  35.52 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.11 
 
 		 383 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0910  OmpC family outer membrane porin  35.51 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106458  normal  0.0412885 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  34.68 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  36.91 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  37.33 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  34.29 
 
 		 376 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  36.75 
 
 		 380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4625  porin  35.56 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0866781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  37.4 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  34.76 
 
 		 436 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  37.4 
 
 		 386 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  36.56 
 
 		 385 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.79 
 
 		 381 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2684  porin  36.25 
 
 		 402 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.835836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5151  porin  35.56 
 
 		 370 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  36.86 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  37.77 
 
 		 376 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  37.77 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  37.77 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  36.39 
 
 		 380 aa  179  7e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  37.01 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>