267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4251 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  100 
 
 		 386 aa  790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  56.87 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  59.1 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  55.78 
 
 		 792 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  51.24 
 
 		 871 aa  352  7e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  54.1 
 
 		 800 aa  350  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  55.77 
 
 		 820 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  52.71 
 
 		 881 aa  345  6e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  51.06 
 
 		 826 aa  333  3e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  49.57 
 
 		 867 aa  333  3e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  50.14 
 
 		 836 aa  329  4e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  49.86 
 
 		 857 aa  329  5.0000000000000004e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  52.22 
 
 		 859 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  50.43 
 
 		 859 aa  328  8e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  51.9 
 
 		 859 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  51.9 
 
 		 859 aa  325  9e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  49.86 
 
 		 860 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  51.58 
 
 		 859 aa  323  3e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.3 
 
 		 875 aa  322  5e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  47.41 
 
 		 416 aa  322  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  50.15 
 
 		 430 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  50.32 
 
 		 859 aa  319  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  50.32 
 
 		 856 aa  316  5e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.73 
 
 		 863 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  50.76 
 
 		 419 aa  315  7e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.57 
 
 		 872 aa  311  1e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  48.72 
 
 		 852 aa  311  1e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  47.23 
 
 		 811 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  49.12 
 
 		 779 aa  307  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  47.58 
 
 		 838 aa  305  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  44.56 
 
 		 842 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  50.14 
 
 		 884 aa  303  4.0000000000000003e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  46.51 
 
 		 841 aa  296  5e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  40.78 
 
 		 390 aa  286  2.9999999999999996e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  46.52 
 
 		 841 aa  279  7e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  45.22 
 
 		 757 aa  278  1e-73  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  39.66 
 
 		 352 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  46.93 
 
 		 899 aa  272  7e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.27 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 		 352 aa  270  2e-71  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  44.66 
 
 		 325 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  39.94 
 
 		 352 aa  269  7e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.87 
 
 		 944 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  40.11 
 
 		 351 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  46.13 
 
 		 565 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  44.34 
 
 		 330 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  45.81 
 
 		 331 aa  249  8e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  44.66 
 
 		 329 aa  248  2e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0221  FO synthase subunit 1  43.83 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.906705  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  43.04 
 
 		 387 aa  237  3e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.59 
 
 		 389 aa  235  9e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  43.59 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  44.41 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  43.81 
 
 		 321 aa  231  1e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  42.63 
 
 		 368 aa  223  4e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  41.21 
 
 		 372 aa  212  1e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.05 
 
 		 741 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.12 
 
 		 737 aa  186  9e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  37.57 
 
 		 737 aa  176  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0173  FO synthase subunit 1  35.56 
 
 		 319 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0892  FO synthase subunit 1  36.88 
 
 		 336 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000147702  decreased coverage  0.000138874 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3749  FO synthase subunit 1  35.58 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.499333 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3695  FO synthase subunit 1  35.58 
 
 		 318 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0829  FO synthase subunit 1  33.87 
 
 		 321 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.241986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1598  FO synthase subunit 1  33.64 
 
 		 340 aa  142  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000217734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0367  FO synthase subunit 1  33.44 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0829  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  33.23 
 
 		 325 aa  119  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0678132  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1531  biotin synthase  30.14 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  26.02 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 359 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 362 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  27.34 
 
 		 388 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  29.51 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 367 aa  68.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 359 aa  67  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  24.7 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  25.89 
 
 		 381 aa  66.2  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 388 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  22.29 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3533  biotin synthase  26.33 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  23.1 
 
 		 361 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  24.62 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  24.31 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  29.01 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  25.41 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2370  biotin synthase  25.57 
 
 		 333 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0124723  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  23.12 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>