269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6340 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6340  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  100 
 
 		 378 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00129843  normal  0.444524 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5477  Mannitol dehydrogenase domain  69.76 
 
 		 386 aa  532  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1248  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  67.37 
 
 		 386 aa  528  1e-149  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1222  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  67.64 
 
 		 386 aa  530  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.329178  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6309  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.18 
 
 		 387 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.773131 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6468  mannitol dehydrogenase-like  68.18 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6703  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  68.18 
 
 		 387 aa  519  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.155037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3906  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  54.77 
 
 		 373 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2069  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  55.53 
 
 		 382 aa  408  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.692519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0173  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.5 
 
 		 383 aa  303  5.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1734  mannitol dehydrogenase-like protein  44.32 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.08776  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0263  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  42.9 
 
 		 366 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1609  putative altronate dehydrogenase  42.9 
 
 		 366 aa  235  9e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5504  altronate oxidoreductase  31.93 
 
 		 481 aa  157  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578611  hitchhiker  0.00540225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1160  altronate oxidoreductase  29.26 
 
 		 505 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2842  altronate oxidoreductase  31.48 
 
 		 507 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00101076  normal  0.0729645 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  31.9 
 
 		 483 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2741  altronate oxidoreductase  27.3 
 
 		 485 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0368058  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  31.18 
 
 		 483 aa  138  2e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6833  altronate oxidoreductase  30.48 
 
 		 501 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634732 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1247  Mannitol dehydrogenase domain protein  29.02 
 
 		 525 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0588834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4128  altronate oxidoreductase  29.52 
 
 		 496 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.450764 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1577  altronate oxidoreductase  30.62 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1056  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.03 
 
 		 513 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.946313  normal  0.945068 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  30.08 
 
 		 481 aa  126  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4259  altronate oxidoreductase  28.03 
 
 		 482 aa  126  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  30.13 
 
 		 483 aa  124  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  30 
 
 		 483 aa  124  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  30.08 
 
 		 481 aa  124  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  29.87 
 
 		 483 aa  123  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  30.21 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0701  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.88 
 
 		 469 aa  122  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2656  Mannitol dehydrogenase domain protein  30.03 
 
 		 514 aa  113  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00362231  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  29.19 
 
 		 488 aa  112  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  28.92 
 
 		 488 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  29.37 
 
 		 496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  28.86 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03857  D-mannonate oxidoreductase  32.08 
 
 		 458 aa  100  6e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.712324  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  28.47 
 
 		 464 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 498 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 489 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 489 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.93 
 
 		 487 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  29.87 
 
 		 489 aa  98.6  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  28.28 
 
 		 491 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  25.75 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2785  Fructuronate reductase  27.06 
 
 		 499 aa  95.1  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  29.76 
 
 		 492 aa  94  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3280  Mannitol dehydrogenase domain protein  28.23 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0834  mannitol dehydrogenase-like  25.4 
 
 		 492 aa  88.2  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0886018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0426  mannitol dehydrogenase-like  28.32 
 
 		 492 aa  86.7  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.321146 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  30.86 
 
 		 510 aa  86.7  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  28 
 
 		 451 aa  85.9  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  27.53 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  30.51 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  27.75 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  26.4 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.7 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.7 
 
 		 460 aa  84.3  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3198  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  28.01 
 
 		 488 aa  84.7  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.247953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1716  Mannitol dehydrogenase domain protein  25 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.122674 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  26.18 
 
 		 493 aa  82.8  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.73 
 
 		 509 aa  82.4  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2791  Mannitol dehydrogenase domain protein  25.67 
 
 		 505 aa  81.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.448642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0503  mannitol dehydrogenase  28.34 
 
 		 482 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0223  mannitol dehydrogenase  29.8 
 
 		 470 aa  79.7  0.00000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000715906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  23.73 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01746  D-mannonate oxidoreductase  23.72 
 
 		 484 aa  79  0.0000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.108025  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3496  mannitol dehydrogenase-like protein  24.2 
 
 		 497 aa  79.3  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.201819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1859  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  27.25 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.901295  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3649  mannitol dehydrogenase Rossman-like  24.6 
 
 		 485 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0357773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3748  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  25 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.29715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  26.34 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  25.81 
 
 		 487 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  27.3 
 
 		 493 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  23.47 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  23.47 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  23.47 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  23.47 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  23.47 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  25.66 
 
 		 490 aa  76.6  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  23.68 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  23.47 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  24.8 
 
 		 497 aa  76.6  0.0000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  23.47 
 
 		 488 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  24.32 
 
 		 488 aa  76.3  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4359  mannitol dehydrogenase-like protein  24.66 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.293801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4445  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  24.66 
 
 		 472 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0634883 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  26.19 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  26.19 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>