More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2518 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
857 aa  1748    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  39.47 
 
 
719 aa  420  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  29.53 
 
 
853 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  29.84 
 
 
860 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  30.22 
 
 
798 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  33.24 
 
 
762 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  32.65 
 
 
855 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.16 
 
 
774 aa  338  2.9999999999999997e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  33.79 
 
 
770 aa  338  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33.54 
 
 
801 aa  337  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  32.16 
 
 
861 aa  336  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  33.73 
 
 
952 aa  336  1e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  29.42 
 
 
782 aa  323  8e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  28.81 
 
 
779 aa  318  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  29.45 
 
 
782 aa  317  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  31.5 
 
 
793 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  32.04 
 
 
774 aa  312  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1324  glycosyl transferase family 51  30.48 
 
 
980 aa  298  2e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144561 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 
759 aa  297  6e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  32.03 
 
 
908 aa  294  4e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1290  penicillin-binding protein 1C  31.91 
 
 
747 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00589164  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1584  penicillin-binding protein 1C  31.06 
 
 
844 aa  287  7e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  30.04 
 
 
927 aa  286  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  30.6 
 
 
766 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4091  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 
745 aa  281  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  31.61 
 
 
705 aa  281  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3383  penicillin-binding protein 1C  30.31 
 
 
746 aa  279  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.743243  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1343  penicillin-binding protein 1C  31.44 
 
 
747 aa  279  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00458316  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  31.89 
 
 
905 aa  279  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3981  penicillin-binding protein 1C  32.86 
 
 
745 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.187688 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4445  penicillin-binding protein 1C  33.04 
 
 
745 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971962  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3812  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 
747 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.596  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5748  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 
747 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  30.72 
 
 
649 aa  274  6e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4556  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 
747 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  30.7 
 
 
814 aa  273  9e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5300  penicillin-binding protein 1C  31.95 
 
 
774 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3529  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 
726 aa  272  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  29.58 
 
 
816 aa  269  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4689  glycosyl transferase family protein  32.53 
 
 
1037 aa  268  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3299  penicillin-binding protein 1C  31.35 
 
 
758 aa  267  5.999999999999999e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  32.02 
 
 
774 aa  266  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  28.41 
 
 
806 aa  266  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1957  penicillin-binding protein 1C  31.67 
 
 
784 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0162399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2652  penicillin-binding protein 1C  31.48 
 
 
768 aa  264  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.447412  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3142  penicillin-binding protein 1C  31.65 
 
 
742 aa  265  4e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  29.6 
 
 
780 aa  263  8e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  31.13 
 
 
790 aa  263  8.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  30.6 
 
 
712 aa  263  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2383  penicillin-binding protein 1C  28.92 
 
 
729 aa  263  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.977643  normal  0.393038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  31.23 
 
 
770 aa  262  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  31.75 
 
 
648 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  31.23 
 
 
770 aa  261  3e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  31.23 
 
 
770 aa  261  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  31.23 
 
 
770 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  31.23 
 
 
770 aa  260  9e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  31.23 
 
 
770 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  31.23 
 
 
770 aa  259  1e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  32.43 
 
 
713 aa  259  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  31.05 
 
 
770 aa  258  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  31.73 
 
 
797 aa  258  3e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  31.05 
 
 
770 aa  258  3e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  30.65 
 
 
766 aa  258  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.82 
 
 
646 aa  258  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  31.72 
 
 
642 aa  258  5e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.47 
 
 
668 aa  257  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  31.67 
 
 
705 aa  257  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  33.53 
 
 
712 aa  257  6e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0786  penicillin-binding protein 1C  30.7 
 
 
1060 aa  257  6e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.879691  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  32.22 
 
 
843 aa  257  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  30.78 
 
 
642 aa  255  2.0000000000000002e-66  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0242  glycosyl transferase family 51  28.86 
 
 
810 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.378731 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  31.19 
 
 
757 aa  254  6e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  29.73 
 
 
787 aa  253  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  29.73 
 
 
787 aa  253  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  29.73 
 
 
787 aa  253  1e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  32.72 
 
 
750 aa  252  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.33 
 
 
734 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  30.97 
 
 
771 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0941  penicillin-binding protein 1C  30.19 
 
 
785 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237946  normal  0.754349 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  30.97 
 
 
771 aa  251  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  29.83 
 
 
772 aa  250  6e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.32 
 
 
667 aa  250  7e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  30.8 
 
 
771 aa  250  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  30.44 
 
 
771 aa  250  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  30.97 
 
 
771 aa  250  8e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  30.74 
 
 
706 aa  249  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  31.94 
 
 
718 aa  249  2e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  30.67 
 
 
720 aa  249  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  29.67 
 
 
833 aa  248  4e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.09 
 
 
626 aa  248  4e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  30.67 
 
 
724 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  31.08 
 
 
724 aa  248  4.9999999999999997e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  31.2 
 
 
638 aa  247  4.9999999999999997e-64  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  32.31 
 
 
741 aa  247  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  31.44 
 
 
794 aa  247  9e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.69 
 
 
714 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  30.81 
 
 
759 aa  246  9.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  31.83 
 
 
680 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  30.91 
 
 
718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>