More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0242 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0242  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 810 aa  1618    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.378731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  33.47 
 
 		 798 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  32.77 
 
 		 793 aa  268  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  29.38 
 
 		 762 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  32.35 
 
 		 719 aa  264  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  28.86 
 
 		 857 aa  255  2.0000000000000002e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2226  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 		 759 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  29.57 
 
 		 770 aa  252  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  33.39 
 
 		 766 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  32.79 
 
 		 770 aa  243  1e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.79 
 
 		 770 aa  243  1e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 		 770 aa  242  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  32.62 
 
 		 770 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  32.62 
 
 		 770 aa  240  6.999999999999999e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 		 770 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.62 
 
 		 770 aa  240  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  32.69 
 
 		 801 aa  239  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  35.16 
 
 		 780 aa  233  8.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  32.34 
 
 		 816 aa  233  8.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  31.66 
 
 		 790 aa  232  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  33.44 
 
 		 771 aa  232  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  33.54 
 
 		 771 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  33.44 
 
 		 771 aa  230  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  33.7 
 
 		 771 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1842  glycosyl transferase family 51  34.71 
 
 		 782 aa  229  2e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0117542  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  33.44 
 
 		 771 aa  229  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 855 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2036  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  37.35 
 
 		 779 aa  227  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0247082  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  31.25 
 
 		 787 aa  227  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  31.25 
 
 		 787 aa  227  7e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  31.25 
 
 		 787 aa  227  7e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  27.5 
 
 		 772 aa  226  1e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  27.02 
 
 		 775 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1927  glycosyl transferase family 51  36.28 
 
 		 782 aa  225  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0285568  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  31.39 
 
 		 774 aa  225  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  29.61 
 
 		 774 aa  224  4e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  32.64 
 
 		 774 aa  224  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  30.32 
 
 		 724 aa  224  6e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00006738  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  27.45 
 
 		 794 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  32.9 
 
 		 782 aa  222  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  33.16 
 
 		 861 aa  222  3e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  37.71 
 
 		 799 aa  221  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  32.07 
 
 		 952 aa  220  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2139  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.86 
 
 		 774 aa  220  8.999999999999998e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.911102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  29.54 
 
 		 860 aa  219  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  33.23 
 
 		 793 aa  218  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  34.75 
 
 		 679 aa  218  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  37.13 
 
 		 680 aa  217  8e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  30.76 
 
 		 762 aa  216  9.999999999999999e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  30.87 
 
 		 807 aa  215  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  35.33 
 
 		 684 aa  216  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  35.85 
 
 		 699 aa  214  3.9999999999999995e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  30.66 
 
 		 797 aa  214  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  35.44 
 
 		 750 aa  214  7e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  32.79 
 
 		 782 aa  213  1e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  32.32 
 
 		 784 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  33.73 
 
 		 780 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  30.12 
 
 		 774 aa  213  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  36.29 
 
 		 691 aa  211  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  34.22 
 
 		 692 aa  211  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  32.53 
 
 		 760 aa  211  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  32.18 
 
 		 784 aa  210  7e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0269  penicillin-binding protein 1C  36.13 
 
 		 734 aa  210  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  34.69 
 
 		 693 aa  210  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1576  penicillin-binding protein, putative  29.45 
 
 		 713 aa  210  1e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.772594  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  30.11 
 
 		 722 aa  209  1e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  32.02 
 
 		 784 aa  210  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  35.26 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  35.16 
 
 		 731 aa  207  7e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1391  penicillin-binding protein 1C  37.5 
 
 		 704 aa  207  7e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 853 aa  206  9e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1396  penicillin-binding protein 1C  37.14 
 
 		 767 aa  206  1e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1671  penicillin-binding protein 1C  36.97 
 
 		 733 aa  206  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.60886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  31.49 
 
 		 784 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3627  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 		 908 aa  204  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1160  penicillin-binding protein 1C  34.82 
 
 		 686 aa  204  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.215949  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  31.53 
 
 		 804 aa  204  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  27.4 
 
 		 716 aa  204  7e-51  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  35.61 
 
 		 745 aa  204  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.787281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  31.82 
 
 		 762 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  31.82 
 
 		 760 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  29.11 
 
 		 734 aa  201  3e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  34.39 
 
 		 706 aa  201  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0405  penicillin-binding protein 1C  37.16 
 
 		 699 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905597  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  35.53 
 
 		 706 aa  201  6e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5148  penicillin-binding protein 1C  31.55 
 
 		 809 aa  200  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  34.26 
 
 		 794 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1355  glycosyl transferase family protein  36.06 
 
 		 674 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186022  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  34.26 
 
 		 794 aa  199  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  31.64 
 
 		 760 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0508  peptidoglycan glycosyltransferase  28.57 
 
 		 927 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  34.05 
 
 		 696 aa  197  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0637  penicillin-binding protein 1C  35.94 
 
 		 683 aa  197  9e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405443  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1163  penicillin-binding protein 1C  33.46 
 
 		 705 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.22385  normal  0.584003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  35.62 
 
 		 696 aa  196  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5133  penicillin-binding protein 1C  31.77 
 
 		 809 aa  196  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  35.66 
 
 		 674 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3235  penicillin-binding protein 1C  31.77 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>