More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31600 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31600  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  100 
 
 		 389 aa  765    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5919  FAD dependent oxidoreductase  51.58 
 
 		 398 aa  340  2.9999999999999998e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000776638  normal  0.0692698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0082  FAD dependent oxidoreductase  47.89 
 
 		 393 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6008  SoxB2  52.38 
 
 		 379 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00127478  normal  0.130354 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4107  FAD dependent oxidoreductase  45.41 
 
 		 393 aa  297  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0968917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4726  FAD dependent oxidoreductase  50.14 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2886  putative glycine oxidase  31.85 
 
 		 391 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2595  sarcosine oxidase, beta subunit  31.85 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2560  sarcosine oxidase, beta subunit  31.85 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1686  FAD dependent oxidoreductase  32.63 
 
 		 401 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.470832  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2841  putative glycine oxidase  31.59 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000111292 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2644  glycine oxidase  31.69 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.746701  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2638  FAD dependent oxidoreductase  31.95 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.071101  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2835  glycine oxidase  31.69 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0387982  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  32.21 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2864  glycine oxidase, putative  31.49 
 
 		 375 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.137573  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01436  D-amino acid oxidase  30.89 
 
 		 378 aa  149  6e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.337919  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2847  putative glycine oxidase  30.03 
 
 		 330 aa  149  9e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0255303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3101  hydrogen cyanide synthase HcnC  30 
 
 		 417 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.124285  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0595  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 390 aa  142  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.140462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36310  hydrogen cyanide synthase HcnC  30.24 
 
 		 417 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.134451 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4032  FAD dependent oxidoreductase  32.47 
 
 		 375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.120783 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3551  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 375 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4446  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.750872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1893  FAD dependent oxidoreductase  32.73 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4225  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0211166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4141  FAD dependent oxidoreductase  31.84 
 
 		 375 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.659228  normal  0.0539213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4123  hypothetical protein  31.68 
 
 		 371 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00603105  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3378  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 		 375 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.344294  normal  0.353692 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5605  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 984 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3514  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.137187  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3032  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.451614  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0462  glycine oxidase  30.87 
 
 		 378 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2500  FAD dependent oxidoreductase  29.81 
 
 		 370 aa  129  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.50654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47850  hypothetical protein  31.12 
 
 		 371 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000392863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1841  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 374 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0721  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 983 aa  127  3e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0139  glycine oxidase ThiO  32.73 
 
 		 376 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1938  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 388 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4561  FAD dependent oxidoreductase  33.42 
 
 		 375 aa  127  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1751  FAD dependent oxidoreductase  25.63 
 
 		 382 aa  127  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.18751 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0968  FAD dependent oxidoreductase  25.73 
 
 		 383 aa  127  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0185207  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3636  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 394 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295113  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4695  FAD dependent oxidoreductase  29.92 
 
 		 394 aa  126  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.518456 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4668  FAD dependent oxidoreductase  33.67 
 
 		 379 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0623925  normal  0.830145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6771  glycine oxidase ThiO  31.96 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2066  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.66 
 
 		 377 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3210  FAD dependent oxidoreductase  28.98 
 
 		 378 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.2962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2933  glycine oxidase ThiO  30.08 
 
 		 371 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.789116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1730  FAD dependent oxidoreductase  26.8 
 
 		 382 aa  123  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04340  glycine/D-amino acid oxidase, deaminating  26.91 
 
 		 386 aa  123  7e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.704442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 819 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  28.22 
 
 		 441 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8165  oxidoreductase  25.6 
 
 		 460 aa  120  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0557691  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1735  glycine oxidase ThiO  28.72 
 
 		 368 aa  120  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 440 aa  119  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3942  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.741631  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5073  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  33.75 
 
 		 375 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0207  FAD dependent oxidoreductase  29.32 
 
 		 388 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.654488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7805  FAD dependent oxidoreductase  28.46 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6548  FAD dependent oxidoreductase  32.89 
 
 		 374 aa  117  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0161  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 394 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  31.15 
 
 		 382 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4903  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0595104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0303  FAD dependent oxidoreductase  27.76 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1501  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.190283  normal  0.0251893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0146  glycine oxidase ThiO  32.47 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.473112  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3866  FAD dependent oxidoreductase  30.24 
 
 		 843 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1475  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0271  FAD dependent oxidoreductase  25.56 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0157  glycine oxidase ThiO  32.22 
 
 		 376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0884  FAD dependent oxidoreductase  25.92 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2290  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 		 823 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.407986 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1379  FAD dependent oxidoreductase  29.61 
 
 		 500 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.258536  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3964  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 		 378 aa  113  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3808  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 385 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6625  FAD dependent oxidoreductase  27.44 
 
 		 383 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  26.59 
 
 		 462 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5700  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6064  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 374 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60270  putative glycine/D-amino acid oxidases  35.19 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000302001 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5219  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2479  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 496 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.113272  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  30.51 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1073  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0918  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 		 960 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0964  glycine oxidase ThiO  32.91 
 
 		 361 aa  111  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0437682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0274  FAD dependent oxidoreductase  26.23 
 
 		 381 aa  110  4.0000000000000004e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11880  FAD-dependent glycine oxidase  31.97 
 
 		 363 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.274663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1477  FAD dependent oxidoreductase  26.71 
 
 		 420 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.699089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.89 
 
 		 401 aa  109  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4955  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.916041  normal  0.433563 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5188  glycine oxidase ThiO  35.35 
 
 		 404 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5517  FAD dependent oxidoreductase  25.95 
 
 		 441 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176807  normal  0.255694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5571  FAD dependent oxidoreductase  26.61 
 
 		 415 aa  109  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000397488  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6532  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7056  FAD dependent oxidoreductase  27.18 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.370606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4400  FAD dependent oxidoreductase  30.98 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0086  FAD dependent oxidoreductase  23.78 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.024354  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>